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Biologie et Médecine
Les éléments transposables: le cas du transposon mariner une approche expérimentale
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par
R Ferhi
Université de Tebessa - DES en Biochimie et Biologie moléculaire 2009
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III.1.5.1. La Co-suppression transcriptionnelle: 51
Partie II : Caractérisations et fonctionnalité des transposons de type
III. Fonctionnalité des MLEs : 62
III.2.1.4.1.3. Test de coupure des transposases de type mariner : 84
III.2.1.4.2.3. Réalisation des tests de transposition in vivo : 90
Résumé
Introduction et Historique
I- Classification générale des éléments transposables:
I.1. Les éléments de la Classe I : Les rétrotransposons
I.1.1.a. Caractères généraux :
I.1.1.b. La classification :
I.1.1.b1. Les éléments autonomes :
I.1.1.b1.1. La super famille ty1/copia : Pseudoviridae
I.1.1.b1.2. La super famille ty3/gypsy : Métaviridae
I.1.1.b2.2. La famille des LARDs :
I.1.1.c. Cycle de vie d'un rétrotransposon :
I.1.2. Les rétrotransposons sans LTR : ou rétroposons
I.1.2.2. Les éléments SINEs :
I.1.2.3. Les RTEs :
I.2. Les éléments de la Classe II: Les Transposons
I.2.1.2. les transposons composites: "Tn"
I.2.1.3. Les mécanismes de transposition: Deux modèles de transposition des IS et donc des Tn ont été observés
I.2.2.1. Le groupe des éléments hat:
I.2.2.2. Le groupe des éléments PiggyBac:
I.2.2.3. Le groupe des éléments P:
I.2.2.4. Le groupe des MITEs/PIF/Harbinger:
I.2.2.5. Le groupe En/Spm:
I.2.2.7. Les éléments Mutator (Mu)
I.2.2.8. Le groupe des éléments de la super famille IS630/Tc1/maT/mariner :
I.2.2.9. La famille Polintons(Mavericks) :
I.2.2.10. La famille des éléments Merlins :
I.2.2.11. La Super famille des Transib :
II. L'impact des éléments transposables sur le génome :
II.1. La modification de la structure et la fonction des gènes :
II.2. Les réarrangements chromosomiques :
II.4.1. Recrutement de fonctions structurelles :
II.4.1. Recrutement de fonctions enzymatiques :
III. La régulation de la transposition :
III.1. L'autorégulation de la transposition :
III.1.1. Titration de la transposase par les séquences délétées:
III.1.2. Les régions régulatrices :
III.1.3. Synthèse de répresseurs :
III.1.4. Inhibition par surproduction:
III.1.5. La Co-suppression:
III.1.5.1. La Co-suppression transcriptionnelle :
III.1.5.2. La Co-suppression post-transcriptionnelle:
III.2. Régulation de la transposition par les facteurs de l'hôte :
III.2.1. L'effet de position :
III.2.2. La régulation épigénétique :
IV. La transmission des éléments transposables :
I. Définition et Découverte:
I.1. La nomenclature des MLEs:
II. Structure et fonctionnalité des éléments Tc1/mariner : II.1. Structure générale des MLEs et TLEs:
II.1.1.2. Structure protéique:
II.1.1.2.1. Les motifs caractéristiques du domaine N-Terminal:
II.1.1.2.2. Les motifs caractéristiques du domaine C-Terminal:
III. Fonctionnalité des MLEs : III.1. Les MLEs actifs :
III.1.1. Le mécanisme de transposition des MLEs :
III.1.1.1. Liaison aux ITRs :
III.1.1.2. L'excision de l'élément :
III.1.1.3. La réinsertion de l'élément dans son site cible :
III.1.2.1. L'intérêt fondamental :
III.1.2.2. L'intérêt appliqué :
III.2.1.4. Analyse fonctionnelle d'un transposon de type mariner :
III.2.1.4.1. Tests de transposition in vitro :
III.2.1.4.1.1. Analyse de la liaison des transposase de type mariner aux ITRs :
III.2.1.4.2. Les tests de transposition in vivo :
III.2.1.4.2.1. Construction des vecteurs permettant l'expression de la transposase mariner : (Figure 22)
III.2.1.4.2.2. La construction de plasmide pBC KS(+) contenant le pseudo transposon :
III.2.1.4.2.3. Réalisation des tests de transposition in vivo :
Conclusion et perspectives
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