I.2.2.10. La famille des éléments Merlins
:
Ces éléments sont des homologues des
séquences d'insertion IS1016, le premier élément
Merlin était identifié en octobre 2001 dans le
nématode Caenorhabditis briggsae, il est une séquence
d'environ 1914pb et possède un TSD de 8pb (Feschotte, 2004). Les
éléments merlin décrits sont des séquences
de 1.4-3.5 kb, avec des ITRs entre 21 et 462 pb flanqués par des TSD de
8-9 pb, leurs ORFs codent pour une transposase de
270-330 aa caractérisées par le motif DD(36-38)E.
Ils sont présents dans les génomes de divers
invertébrés et vertébrés (Feschotte et Pritham,
2007)
I.2.2.11. La Super famille des Transib :
Cette super Famille a été reconstituée
in silico à partir des éléments
dégénérés dans les génomes de Drosophila
melanogaster et Anopheles gambiae (Chen et Li, 2007), ils sont
des éléments d'une longueur comprise entre 3 et 4kb bordés
par des ITRs de 9- 60pb, ils produisent lors de son insertion un TSD de 5pb. Un
élément Transib code pour une transposase de 650-700aa
avec une triade catalytique de type DD(206-214)E (Feshotte et Pritham, 2007).
Kapitonov et Jurka (2005) ont démontré que les protéines
RAG1/2 impliquées dans la recombinaison V(D)J sont des
dérivés de ces éléments (Kapitonov et Jurka, 2005).
Les transposons Transib sont aussi présents dans le
génome de l'Hydre, de l'oursin et du moustique de la fièvre jaune
(Chen et Li, 2007).
II. L'impact des éléments transposables sur
le génome :
L'intérêt porté aux éléments
transposables se focalise sur deux points principaux : l'évolution des
éléments transposables eux-mêmes et leur effet sur les
génomes des hôtes. Au cours des dernières années,
les auteurs ont orienté leurs recherches sur ce deuxième point,
c'est-à-dire sur le rôle des éléments transposables
dans l'évolution de la structure et du fonctionnement du génome
de l'hôte (Anxolabéhère et al., 2000). Ce ne sont
cependant pas des éléments génétiques purement
égoïstes dans la mesure où l'acquisition de nouveaux
gènes sous la forme d'élément transposable est une voie
majeure d'adaptation des organismes qui les hébergent (Merlin et
Toussaint, 1999), d'une manière générale les
éléments transposables influencent le trajet
évolutionnaire de leurs hôtes selon 3 façons principales
:
/ La modification de la structure et la fonction des
gènes par le processus excision/intégration.
/ L'induction des réarrangements
chromosomiques.
v' Ils constituent une source importante du
matériel codon et non-codon qui permettent l'émergence de
nouveauté génétique (néogène et des
régions régulatrices) (Feschotte et Pritham, 2007).
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