Caractérisation génomique des bactériophages isolés en Côte d’Ivoire.

• Dédicaces
  
• Remerciements
  
• TABLE DES MATIÈRES
  
  • 1.4.1. Cycle lytique « phages virulents »
    
  • 1.4.3. Cycle chronique « phages filamenteux »
    
  • 4.1. Cas du bactériophage T4
    
  • 2.1. Concentration des bactériophages
    
  • 2.3. Dosage fluorimétrique
    
  • 2.4. Digestion enzymatique
    
  • 2.5. Electrophorèse sur gel d'agarose
    
  • 2.6. Electrophorèse en champ pulsé
    
  • 2.7. Analyse des profils de restriction
    
  • 1.1. Analyse du profil génomique des phages par les endonucléases sur gel d'agarose
    
• LISTE DES ABRÉVIATIONS
  
• LISTE DES FIGURES
  
• LISTE DES TABLEAUX
  
• Introduction
  
• Introduction
  
• Introduction
  
• Revue bibliographique
  
  • 1. Bactériophages
    
    • 1.1. Définition
      
    • 1.2.Historique
      
    • 1.3. Classification des bactériophages
      
    • 1.4. Biologie des bactériophages
      
      • 1.4.1. Cycle lytique « phages virulents »
        
      • 1.4.2. Cycle lysogénique « phages tempérés »
        
      • 1.4.3. Cycle chronique « phages filamenteux »
        
  • 2. Applications des bactériophages
    
    • 2.1.Phagothérapie
      
      • 2.1.1. Pharmacologie de la phagothérapie
        
      • 2.1.2. Intérêts de la phagothérapie
        
      • 2.1.3. Contraintes de la phagothérapie
        
    • 2.2 Essor du génie génétique et de la biotechnologie
      
    • 2.3. Agroalimentaire
      
    • 2.4. Traitement des eaux usées
      
    • 2.5. En médecine humaine et vétérinaire
      
  • 3. Rôles des phages en Biologie moléculaire
    
    • 3.1.Rôle des bactériophages dans le transfert des gènes (phage lysogénique)
      
    • 3.2. Les phages display
      
    • 3.3. Les protéines des phages
      
    • 3.4. La génomique des phages dans la nature
      
    • 3.5. La métagénomique des bactériophages
      
  • 4. Caractérisation génomique
    
    • 4.1.Cas du bactériophage T4
      
    • 4.2.Méthodes de génotypage
      
• Matériel et Méthodes
  
  • 1. Matériel
    
    • 1.1.Cadre d'étude
      
    • 1.2. Matériel d'étude
      
      • 1.2.1. Matériel biologique
        
      • 1.2.2. Matériel technique, équipement et consommables
        
      • 1.2.3. Réactifs et tampons
        
  • 2. Méthodes
    
    • 2.1. Concentration des bactériophages
      
      • 2.1.1. Principe
        
      • 2.1.2. Protocole
        
    • 2.2. Extraction de l'ADN des phages
      
      • 2.2.1. Principe
        
      • 2.2.2. Protocole
        
    • 2.3.Dosage fluorimétrique
      
      • 2.3.1. Principe
        
      • 2.3.2. Protocole
        
    • 2.4. Digestion enzymatique
      
      • 2.4.1. Principe
        
      • 2.4.2. Protocole
        
    • 2.5. Electrophorèse sur gel d'agarose
      
    • 2.6. Electrophorèse en champ pulsé
      
      • 2.6.1. Encapsidation des phages dans l'agarose
        
      • 2.6.2. Lyse virale des phages dans les plugs d'agarose
        
      • 2.6.3. Digestion enzymatique du génome
        
      • 2.6.4. Électrophorèse sur gel d'agarose
        
    • 2.7. Analyse des profils de restriction
      
      • 2.7.1. Evaluation de la similarité des profils
        
      • 2.7.2. Analyse phylogénétique
        
      • 2.7.3. Attribution de pulsotype et de cluster
        
• Résultats et Discussion
  
  • 1. Résultats
    
    • 1.1. Analyse du profil génomique des phages par les endonucléases sur gel d'agarose
      
    • 1.2.Analyse du profil génomique par la méthode en champ pulsé
      
      • 1.2.1. Analyse du profil génomique généré par XbaI
        
      • 1.2.2 Analyse du profil génomique généré par XhoI
        
  • 1. Discussion
    
• Conclusion et Perspectives
  
• Conclusion et Perspectives
  
• Références bibliographiques
  
• Annexes
  
• Annexes
  
• Annexe 1 : Les Protéines Phage T4 dans la base de données (Miller et al., 2003).
  
• Annexes
  
• Annexes
  
• Annexe 4 : Profil de digestion des phages par les enzymes de restrictions XbaI et XmnI
  
• RÉSUMÉ
  
• ABSTRACT