TABLE DES MATIÈRES
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Dédicaces
Remerciements ..
TABLE DES MATIÈRES ..
LISTE DES ABRÉVIATIONS
LISTE DES FIGURES
LISTE DES TABLEAUX
Introduction ..
Revue bibliographique
1. Bactériophages ..
1.1. Définition
1.2. Historique
1.3. Classification des bactériophages
1.4. Biologie des bactériophages
1.4.1. Cycle lytique « phages virulents »
1.4.2. Cycle lysogénique « phages
tempérés » ..
1.4.3. Cycle chronique « phages filamenteux »
2. Applications des bactériophages ..
2.1. Phagothérapie ..
2.1.1. Pharmacologie de la phagothérapie
2.1.2. Intérêts de la phagothérapie
2.1.3. Contraintes de la phagothérapie
..
2.2. Essor du génie génétique et de la
Biotechnologie ..
2.3. Agroalimentaire
2.4. Traitement des eaux usées ..
2.5. En médecine humaine et vétérinaire
..
3. Rôle des phages en Biologie moléculaire
.
3.1. Rôle des bactériophages dans le transfert des
gènes (phage lysogénique)
3.2. Les phage display
3.3. Les protéines des phages
3.4. La génomique des phages dans la nature
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3.5. La métagénomique des Bactériophages
..
4. Caractérisation génomique
4.1. Cas du bactériophage T4
4.2. Méthodes de génotypage
Matériel et Méthodes
1. Matériel ..
1.1 Cadre d'étude
1.2. Matériel d'étude
1.2.1. Matériel biologique .
1.2.2. Matériel technique ..
1.2.2.1. Equipements et consommables .
1.2.2.2. Réactifs et tampons
2. Méthodes
2.1. Concentration des bactériophages
2.1.1. Principe .
2.1.2. Protocole
2.2. Extraction de l'ADN des phages .
2.2.1. Principe .
2.2.2. Protocole
2.3. Dosage fluorimétrique
2.3.1. Principe
2.3.2. Protocole
2.4. Digestion enzymatique
2.4.1. Principe
2.4.2. Protocole
2.5. Electrophorèse sur gel d'agarose
2.6. Electrophorèse en champ pulsé
2.6.1. Encapsidation des phages dans l'agarose
2.6.2. Lyse virale des phages dans les plugs d'agarose
2.6.3. Digestion enzymatique du génome
2.6.4. Électrophorèse sur gel d'agarose
2.7. Analyse des profils de restriction
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v
2.7.1. Evaluation de la similarité des profils
2.7.2. Analyse phylogénétique
2.7.3. Attribution de pulsotype et de cluster
Résultats et Discussion
1. Résultats
1.1. Analyse du profil génomique des phages par
les endonucléases sur gel d'agarose
1.2. Analyse du profil génomique par la méthode en
champ pulsé .
1.2.1. Analyse du profil génomique
générée par XbaI
1.2.2. Analyse du profil génomique
générée par XhoI
2. Discussion ..
Conclusion Et Perspectives ..
Références bibliographiques
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