Diversité génétique des Rhizobia associés à un champ de pois d'Angole (Cajanus cajan l.) à Yamoussoukro (centre de la Côte d'Ivoire)

• RESUME
  
• ABSTRACT
  
• AVANT-PROPOS ET REMERCIEMENTS
  
• TABLE DES MATIERES
  
• LISTE DES TABLEAUX
  
• LISTE DES FIGURES
  
• LISTE DES ANNEXES
  
• SIGLES ET ABREVIATIONS
  
• DEDICACES
  
• PREMIERE PARTIE :
  
• REVUE BIBLIOGRAPHIQUE
  
  • I.1- FIXATION BIOLOGIQUE DE L'AZOTE (FBA)
    
  • I.2- SYMBIOSE LEGUMINEUSES/RHIZOBIA
    
    • I.2.1- Définition de la symbiose rhizobienne
      
    • I.2.2- Intérêts de la symbiose rhizobia-légumineuses
      
    • I.2.3- Caractérisation des deux partenaires
      
      • I.2.3.1- Rhizobia
        
      • I.2.3.2- Légumineuses
        
      • I.2.3.3- Caractéristiques du couple : infectivité, efficience et spécificité
        
  • II.1- GENETIQUE DE LA NODULATION CHEZ LA BACTERIE
    
    • II.1.1- Gènes nod
      
      • II.1.1.1- Gène nod D
        
      • II.1.1.2- Gènes nod communs (ABCIJ)
        
      • II.1.1.3- Gènes nod spécifiques (nod H, nod FE, nod G, nod MN, nod Q etc.)
        
      • II.1.1.4 - Autres gènes nécessaires à la nodulation
        
    • II.1.2- Gènes nif
      
    • II.1.3- Gènes fix
      
  • II.2- GENETIQUE DE LA NODULATION CHEZ LA LEGUMINEUSE
    
  • II.3- SCHEMATISATION DES ETAPES DU PROCESSUS DE NODULATION
    
  • III.1- HISTOIRE DE LA TAXONOMIE RHIZOBIENNE
    
  • III.2- TAXONOMIE POLYPHASIQUE ET PHYLOGENIE DES RHIZOBIA
    
    • III.2.1- Taxonomie polyphasique
      
    • III.2.2 - Notion de phylogénie chez les Rhizobia
      
  • III.3 - CLASSIFICATION ACTUELLE DES RHIZOBIA
    
  • IV.1 - ORIGINE ET DISTRIBUTION GEOGRAPHIQUE DE LA PLANTE
    
  • IV.2 - ZONES DE CULTURE ET IMPORTANCE DES PRODUCTIONS
    
  • IV.3 - TAXONOMIE DU POIS D'ANGOLE
    
    • IV.3.1 - Nomenclature
      
    • IV.3.2- Classification
      
  • IV.4- DESCRIPTION DU POIS D'ANGOLE
    
    • IV.4.1- Description botanique
      
    • IV.4.2 - Ecologie
      
    • IV.4.3 - Mode de multiplication et systèmes de culture
      
    • IV.4.4 - Croissance, développement et rendement
      
    • IV.4.5 - Ennemis et maladies de Cajanus cajan
      
  • IV.5 - IMPORTANCE DE LA CULTURE DU POIS CAJAN
    
    • IV.5.1 - Importance nutritionnelle du pois cajan
      
    • IV.5.2 - Importance agronomique du pois cajan
      
    • IV.5.3 - Importance du pois cajan en Afrique
      
• DEUXIEME PARTIE :
  
• ETUDE EXPERIMENTALE
  
  • VI.2- PRESENTATION DU SITE DE COLLECTE DES ECHANTILLONS
    
  • VI.3- PRESENTATION DES LABORATOIRES D'ACCUEIL DE L'ETUDE
    
  • VII.1- MATERIEL
    
    • VII.1.1 - Matériel vivant
      
    • VII.1.2 - Matériel technique
      
  • VII.2- METHODES
    
    • VII.2.1 - Récolte des nodules et isolement des souches bactériennes
      
    • VII.2.2 - Préparation des cellules bactériennes par effet thermique
      
    • VII.2.3 - Amplification et digestion de la région 16S de l'ADNr des rhizobia par PCR-RFLP
      
      • VII.2.3.1 - Principe de la PCR-RFLP et choix du gène de l'ADNr 16S
        
      • VII.2.3.2- Réalisation de la PCR-RFLP
        
  • VIII.1- RESULTATS
    
    • VIII.1.1- Croissance des bactéries sur milieu TY solide
      
    • VIII.1.2 Amplification par PCR de l'ADNr 16S
      
    • VIII.1.3 Produits de digestion
      
  • VIII.2- DISCUSSION DES RESULTATS
    
• ANNEXE I : Classification des rhizobia selon les séquences du gène de l'ARN 16S
  
• ANNEXE I : (suite)
  
• ANNEXE II : Présentation des structures et des laboratoires d'accueil de l'étude
  
• ANNEXE III : Composition du milieu TY (Tryptone Yeast Agar) en g/l (BERINGER, 1974)