Diversité génétique et fréquences alléliques des gènes Pfmsp1 et Pfmsp2 des isolats provenant d'enfants asymptomatiques et symptomatiques de la région de Lastourville au sud est du Gabon

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Mémoire N° EDR MR 2022 0098 de Master 2 Recherche en Infectiologie Tropicale

DIVERSITE GENETIQUE ET FREQUENCES ALLELIQUES DES GENES Pfmsp1 ET Pfmsp2 DES ISOLATS PROVENANT D' ENFANTS ASYMPTOMATIQUES ET SYMPTOMATIQUES DE LA REGION DE LASTOURVILLE

Présentée et soutenue publiquement le 22/09/2022 par :

Sous la direction de :

MORISHO NASIBU MILAMBO MOSKI

Pr. LEKANA-DOUKI Jean Bernard, Professeur-Titulaire CAMES/USS

Dr. OYEGUE LIABAGUI ép. ASSANGABOUA Sandrine Lydie, Maitre- Assistant CAMES /USTM

Année Académique 2021 - 2022

DEDICACES

Je dédie ce Mémoire A

Mon défunt grand frère Daniel MORISHO KAEYO, puisse Dieu te bénir à jamais pour l'amour, la vie

A mes parents Béatrice MWAMINI et l'inspecteur Adrien NEPA MORISHO, puisse Dieu vous benir à jamais pour l'amour parental sans pareil,

A madame Esther BAMAVU, pour qui je te serai à jamais reconnaissant, pour l'amour, les sacrifices et le soutien sans faille.

A mes enfants et à toute la grande famille MORISHO, pour l'amour sans cesse renouvelé, le soutien, et surtout vos encouragements.

REMERCIEMENTS

Je remercie sincèrement le Professeur. LEKANA-DOUKI Jean Bernard, Directeur Général du CIRMF, qui a bien voulu m'accepter comme stagiaire au sein de la structure dont il a la charge, et pour avoir accepté de diriger ce travail.

Mes remerciements vont également à l'endroit du Directeur général de l'école doctorale, le professeur Jacques LEBIBI, pour son abnégation, son humilité et ses sages conseils .

Mes remerciements vont également à l' endroit du Docteur OYEGUE LIABAGUI Sandrine Lydie,

chef de l'Unité d'Evolution, Epidémiologie, Résistance Parasitaire (UNEEREP) du CIRMF, pour avoir accepté d'encadrer ce travail.

Je voudrais exprimer toute ma gratitude à l'ingénieur Mme KOUNA Lady Charlène, pour m'avoir supervisé durant tout le stage. Merci pour ses conseils, sa disponibilité et sa rigueur scientifique.

Je remercie aussi d'une manière particulière Mme MBANI MPEGA NTIGUI Chérone, et Mr ONTOUA Steede Seinnat, PhD Students dans le service, pour leur disponibilité dans l'apprentissage des méthodes de recherche et leurs sympathies.

J'exprime ma gratitude à toute l'équipe de l'UNEEREP, Dr. IMBOUMY Karl, M. OKOUGA Alain-Prince, ,ALICE, VANESSA et LUIDE, pour l'accueil, le suivi, la convivialité, l'harmonie et la rigueur de travail.

Mes remerciements nourris à tous les enseignants de l'école doctorale et à tous les collègues compagnons de lutte.

TABLE DES MATIERES

DEDICACES ii

ABREVIATIONS vi

LISTE DE FIGURES vii

LISTE DES TABLEAUX viii

GENERALITES SUR LE PALUDISME 3

I.1. Définition 3

I.2. Epidémiologie du paludisme. 3

I.3. Agents pathogènes 4

1.4. Cycle de développement 4

1.5.3. Paludisme grave 7

1.6. Paludisme au Gabon 11

1.6.1. Epidémiologie 11

1.6.2. Marqueurs de virulence au Gabon 11

II. LES OBJECTIFS DE L'ETUDE 13

2.1. Objectif général 13

2.2. Objectifs spécifiques 13

3.1. Caractéristiques de l'étude 14

Il s'est agi d'une étude observationnelle à visée descriptive et analytique, privilégiant une approche pluridisciplinaire qui associe l'épidémiologie et la biologie moléculaire 14

.3.1.1. Type et période d'étude 14

3.1.2. Site de l'étude 14

3.1.3. Population d'étude 14

3.1.4. Critères d'inclusion et de non inclusion 14

3.2. Analyses Biologiques 15

3.2.1. Diagnostic de l'infection plasmodiale 15

3.2.1.1. Le prélèvement : 15

3.2.1.2. Diagnostic par TDR 15

3.1.2.3. Diagnostic par microscopie: Goutte épaisse 16

3.2. Analyses moléculaires 16

3.2.1. L'extraction d'ADN : 16

Amplification pour le diagnostic moléculaire d'espèces 17

Electrophorèse 18

3.2.2 Analyse des données 19

4.1 Caractéristiques de la population d'étude 20

4.1.1. Description de la population d'étude 20

4.2. Comparaison de la Prévalence de l'infection plasmodiale entre symptomatiques et asymptomatiques 20

4.2.1. Distribution des espèces plasmodiale en fonction de la symptomatologie 20

4.2.2. Caractérisation de la virulence 21

4.2.2. Infections polyclonale des gènes Pfmsp-1 et Pfmsp-2 en fonction du statut clinique 22

4.3. Diversité allélique : polymorphisme de longueur de taille de fragments 23

V. DISCUSSIONS 26

VI. CONCLUSION ET PERSPECTIVES 29