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Isolement et identification acetobacter aceti à  partir d'un vinaigre biologique


par Nadjat OUIS/Mouna SAMCHA
Université Mostapha Stambouli - Master Biotechnologie microbienne 2021
  

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I.2.7.2.Détermination du taux de solides solubles «TSS ou Brix» (NF V 05-109 ,1970)

A voir la page 45 matériel et méthodes

I.2.7.3.Dosage des sucres totaux (méthode de Dubois, 1956)

A voir la page 45 matériel et méthodes

I.2.7.4.Dosage d'acidité titrable

A voir la page (56-57) matériel et méthodes

I.2.7.5.Détermination de la densité (Siboukeur, 2008)

Elle nous renseigne sue l'état des produits par la mise en oeuvre du taux de matière solide et

de la viscosité. Elle donc d'une importance considérable dans la mesure où elle nous

renseigne sur l'aptitude des micros- organismes vis à vis de l'état physique du milieu. Elle est

mesurée par lecture direct à l'aide d'un densimètre ou pynctomètre.

La détermination de la densité est réalisée par pynctomètre en verre vide. Le calcule se fait

selon les formule (11) (12)

ñv = M1 - M0 (11)

Avec:

D= pv

p eau

(12)

I.2.7.6.Détermination de la viscosité par la loi de Stokes (Stokes,1981)

Principe

La viscosité est mesurée a l'aide du viscosimètre a chute de bile (HAAKE).en Pascal par seconde (Pa/s) selon la formule suivante :

(13)

r2+ (P2-P1 )+g

ç=

9V

D'où :

ç : viscosité.

P2 : la densité de la taille égale : m/v ; m : masse de la bille et v :4/3*ð*r3.

P1 : la densité du produit.

g:la gravité.

r : rayon de la bille utilisée.

v : la vitesse de la bille égale L/t ; L : mesurer la distance entre les deux marques de tubes

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Chapitre I : Matériels et méthodes

 

Partie 2 : Etude expérimentale

 
 

t : le temps en secondes de chute de la taille a travers le produit a analyser.

? Mode opératoire

Le vinaigre est placé dans le tube du viscosimètre puis on mesuré a l'aide d'un chronomètre

le temps « t »(en secondes) de passage de la billes en distance « h »qui sépare les deux repères

A et B du viscosimètre et on a calculé la viscosité du produit par la formule précédente.

I.2.7.7. Dosage de l'alcool (Audigité et al., 1984).

Le dosage de l'alcool au cours de la fermentation est effectué avec un alcoomètre

(gradué 0° à 100°). La méthode consiste à mesurer le degré alcoolique, à la température

Ambiante20°C, et lecture directe sur le gradient.

Le suivi de la production de l'alcool au cours de la fermentation est d'une importance

considérable. Il renseigne sur l'évolution de l'activité métabolique des micro-organismes.

? Matériels et méthodes

Le dosage de l'alcool est réalisé par la distillation du vinaigre, l'oxydation et le titrage

? Principe

L'éthanol est oxydé par une quantité connue et en excès de bichromate de potassium, en

milieu acide, l'excès de bichromate est dosé par todométrie. Après dilution du milieu, on

ajoute un excès d'iodure, de manière à réduire le bichromate du milieu et l'iode formé est dose

par le thiosulfate.

Le degré alcoolique peut se mesurer au moyen d'un ébulliomètre on d'un alcoomètre indice de

0 à 10 et de 10 à 20. Il peut aussi être détermine théoriquement : 1.7 g de sucre (saccharose)

fomente forme I ml ou 1 d'alcool pur.

1°Alcoolique = g d'alcool pure dans 100 ml de solution.

? Mode opératoire

? Distillation de l'alcool

Dans un bécher mélanger:

-30 ml du vinaigre.

-200 ml d'eau distillée.

? Ajuster le pH du mélange par une solution de soude à 0,1 N jusqu'à PH=8.

? Dans un ballon de distillation, verser le mélange obtenu après l'ajustement.

? Introduire 5 billes en verre.

? Distiller doucement en évitant tout entrainement, recueillir environ 8ml de distillat

dans 10 ml d'eau distillée.

? Le distillat récupéré est mis dans une fiole jaugée de 100 ml.

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Chapitre I : Matériels et méthodes

 

Partie 2 : Etude expérimentale

 
 

? Compléter le volume avec de l'eau distillée jusqu'au trait de jauge.

2-Méthode de dosage de l'alcool

V' Dans une fiole d'Erlen Meyer de 150 ml, introduire :

V' 20 ml de distillat.

V' 20 ml de solution de nitro-chromique à 0,05 N. Boucher et attendre 30 min (pour que

l'oxydation de l'alcool soit complète).

V' Ajoute 10 ml de solution de lugole concentré à100 g/1 après avoir préalablement

dilué le milieu par 40 ml environ d'eau distillée.

V' Attendre 1 minute, puis doser l'iode forme par une solution thiosulfate à 0.05 N de

titre connu.

> Témoin

Opérer comme pour l'essai, en remplaçant les 20 ml de distillat par 20ml d'eau distillée.

> Expression des résultats

Cette expression a été démontrée en se basant sur la méthode décrit par Audigité et

collaborateurs (1984)

E1

Taux d'alcool (g/l) =TS2O3-2 (V2×E2 - ????)) × (46/4) × (1/E») × (E'/E) (14)

Ou :

V1 : Volume de thiosulfate utilisé pour doser l'échantillon.

V2 : Volume de thiosulfate utilisé pour l'essai à blanc. E : Volume de l'échantillon.

E1 : Volume de nitro- chromique pour l'essai.

E2 : Volume de nitro- chromique pour le témoin.

E' : Volume de la solution dilué de l'échantillon

: 20 ml de distillat que l'on soumit à l'oxydation par nitrochromique.

Etude statistiques :

Nous avons faires des études statistiques (calcule la moyenne et l'écartype) pour tous nos

résultats trouvable et nous avons utilisés teste ANOVA pour les analyses statistiques de

densité optique (DO) dosage de sucres (Annexes 04).

1.2.8. Analyses microbiologiques

1.2.8.1. Technique d'isolements des bactéries acétiques

La technique d'isolement consiste à prélever 0.1 ml de solution mère et 0.1 ml des dilutions

(10-1 à 10-3) à l'aide d'une pipette Pasteur stérile pour l'étalement.

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Chapitre I : Matériels et méthodes

 

Partie 2 : Etude expérimentale

 
 

Le milieu de culture de base pour les bactéries acétique est un milieu liquide glucosé contient des CaCO3 (bouillon pour bactérie acétique) ou le même milieu gélosé (gélose pour bactérie acétique) .Pour un isolement sélectif, il est préférable d'utiliser milieu à l'éthanol du type de ceux décrits pour différencier les Acetobacter des Gluconobacter et qui permettent à la fois un isolement et une différenciation: milieu gélose de Carr ou milieu gélose de Frateur. Ce milieu peut être additionné éventuellement d'actidione si le produit étudié contient beaucoup de levures. Le milieu DSM permet également d'isoler et de différencier les bactéries acétiques : il contient du sorbitol et du mannitol, du désoxycholate et de la cycloheximide comme agent sélectif et du lactate comme agent de différentiateur (avec BCP). Les Acetobacter font au pourpre (lactate+) contrairement aux Gluconobacter qui restent jaune (lactate -) (Guiraud, 1998).

? Prélèvement de colonies isolées

On prélevant les colonies apparaissant morphologiquement différentes. Sur le milieu d'isolement (milieu Frateur), et par étalement régulier, les prélèvements s'effectuent, prenant tous les colonies isolées, et les colonies apparaissant morphologiquement différents sur les autres. Il nécessaire de prélever au hasard plusieurs colonies d'un même type pour vérifier l'homogénéité (Guiraud, 2012 et NF.ISO 7218).

? Purification des souches (repiquages successifs)

La méthode courante utilise des tubes de milieu solide inclinés ou en culot .Une fois ensemencés, les tubes sont placés à étuve pour que la croissance débute puis, avant qu'elle ne soit trop abondante, les tubes sont placés dans une armoire réfrigérée à 4°C. La vitalité de la souche se maintient pendant des durées variables, selon la température et l'espèce microbienne. Au bout de ce délai, un nouveau repiquage est réalisé.

Les bactéries demandent un repiquage plus fréquent. Il conseillé de conserver dans ce cas (souches sélectionnées ou marquées génétiquement) les repiquages antérieurs et d'effectuer le nouvel ensemencement à partir du tubes le plus ancien (Guiraud, 2012).

? Conservation

Plusieurs méthodes sont utilisables en fonction de la souche et du but recherché. La technique courante de conservation des souches est celle des repiquages successifs, mais elle est limitée dans le temps. En effet, certaines souches accumulent des déches toxiques ou modifient le pH : il est nécessaire de les repiquer très vite après la fin de la croissance. Pour augmenter la durée de conserver des cultures importantes, il est nécessaire de recourir à la dessiccation, à la congélation ou à la lyophilisation (Bougnou, 1988).

? Congélation

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Chapitre I : Matériels et méthodes

 

Partie 2 : Etude expérimentale

 
 

Elle permet la conservation d'une quantité importante de germes. Les cultures sont centrifugées stérilement et mises en suspension dans un milieu à 10 % de glycérol .Elles sont conservées à -25°C ou mieux à -80°C, la survie peut attendre plusieurs années (Vicent, 1970). 1.2.8.2. Identification des bactéries acétiques

L'identification phénotypique utilise un faible nombre de caractères considérés comme importants tels que la morphologie, la mise en évidence d'un caractère biochimique (enzymes), sérologique (anticorps) ect. Les identifications bactériennes par les caractères biochimiques et sérologiques sont les plus utilisés en routine (Aboulal, 2008)

> Étude macroscopique (l'aspect) des colonies

La première étape du diagnostic bactérien et du biotypage d'une souche est la description macroscopique des colonies isolées, parfois cette seule étude permet de connaître le germe qu'on a en présence car les colonies sont typiques.... (Tekkouk, 1977 et Bourgeois et Leveau ,1980).

> Etude microscopique

L'observation microscopique permet de faire une étude morphologique des cellules d'une espèce bactérienne. Elle comprend :

> L'état frais

Cet examen permet d'apprécier la forme et parfois la mobilité des germes étudiés (Annexes 01).

> Coloration simple

Coloration au bleu de méthylène (Annexes 01).

> Coloration de Gram

C'est une coloration qui permet de mettre en évidence les propriétés de la paroi

bactérienne, et d'utiliser ces propriétés pour les distinguer et les classifier en deux grands

groupes: Gram + et Gram - (Bourgeois et Leveau ,1980) (Annexes 01).

> Identification biochimique

Les bactéries acétiques sont représentées par les genres Acetobacter qui peut oxyder l'acide acétique et l'acide lactique en CO2 et H2O (pouvoir sur oxydant) et Gluconobacter qui ne le peut pas.

Une classification des souches fréquemment utilisées est ancienne classification de Frateur. Cet auteur classe les souches des bactéries acétiques en quatre groupes:

o Le groupe suboxydans qui correspond au genre Gluconobacter (ou Acetomonas)

contenant selon Frateur l'espèce G. oxydans avec quatre variétés.

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Chapitre I : Matériels et méthodes

 

Partie 2 : Etude expérimentale

 
 

o Le groupe mesoxydans qui correspond à la majorité des espèces d'Acetobacter (considérées par Frateur comme des sous-espèces d'A. acetie).

o Les groupes oxydant et peroxydans qui correspond à l'espèce A. pasteurianus (et selon Frateur, respectivement à A. pasteurianus avec cinq sous-espèce et A. peroxydans) (Guiraud ; 2012).

La classification des souches en groupes, espèce et variétés est basée sur les testes suivant: ? Pouvoir suroxydant

Le pouvoir suroxydant est mise en évidence sur le milieu Carr : virage au jaune du vert de bromocrésol pour Gluconobacter et virage puis réversion au bleu pour Acétobacter .Il doit être vérifié par culture sur le milieu gélosé au lactate de calcium. Ce milieu est prépare en boite pétri et ensemencé par touches. La production de CO2 et donc pouvoir suroxydant se traduisent par une précipitation de carbonate de calcium autour des colonies après 48 heures d'incubation à 28-30°C (zone claire pour Gluconobacter et zone claire et précipitation marginale pour Acétobacter) (Guiraud ; 1998).

? Catalase :

Le test est réalisé à partir une culture sur milieu gélosé (Karen Reiner, 2010).

Principe : En présence d'oxygène moléculaire, certaines réactions métaboliques conduisent à la formation d'eau oxygénée. La catalase est une enzyme qui dégrade l'eau oxygénée en eau et oxygène.

? Pouvoir cétogène

Certaines bactéries acétiques peuvent transformer le glycérol en dihydroxy acétone, qui peut être mise en évidence par la liqueur de Fehling. Un milieu gélose au glycérol est coulé en boite de pétri et ensemencé par touches. Après 48 h d'incubation à 28-30 °C, la surface du milieu est recouverte de liqueur de Fehling. Un halo d'oxyde de cuivre rouge se développe autour des colonies à pouvoir cétogène. Ce pouvoir peut être testé sur d'autre alcool en remplaçant le glycérol par les produits à tester (Guiraud ; 1998).

? Culture en présence d'ammonium comme seule source d'azote et de 3% d'éthanol.

La culture est réalisée en utilisant le milieu liquide de Hoyer-Frateur. L'inoculation est réalisée avec une faible quantité de bactéries (une a trois gouttes de suspension dans l'eau physiologique, réalisée a partir d'une culture sur milieu solide). Le milieu est incubé à une température comprise entre 28 et 30 °C pendant une période de 2à 14j. Le développement est comparé à celui d'un milieu témoin sans ammonium (Guiraud ; 2003).

? Présence d'un pigment

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Chapitre I : Matériels et méthodes

 

Partie 2 : Etude expérimentale

 
 

Sur le milieu d'isolement certaines souches de bactéries acétiques possèdent un pigment rose ou brun (Guiraud ; 2012 et Mariama. c et. al ; 2021).

? Formation d'acide gluconique à partir du glucose.

Elle est mise en évidence sur le milieu de culture de base pour bactéries acétiques (gélose pour bactéries acétiques). Ce milieu coulé en boite de pétri contient du glucose et du carbonate de calcium. La production d'acide se traduit après 48 heures d'incubation à une température comprise entre 28 et 30°C par clarification du milieu autour des colonies (Guiraud ; 2012).

? Formation d'acide cétogluconique

La formation d'acide cétogluconique à partir de gluconate est réalisée en utilisant le milieu de Haynes que l'on incube à une température de 30°C pendant 48h .La révélation se fait à l'aide du réactif Bénédict avec 10 min de chauffage au bain marie à 100°C :il apparait un précipité rouge orangé. La technique utilisée pour mettre en évidence le pouvoir cétogène est utilisable en remplaçant le glycérol par du gluconate. La formation d'acide cétogluconique peut aussi être recherchée à partir d'un milieu glucosé (Guiraud ; 2003).

? Production de cellulose

Elle est mise en évidence sur le bouillon pour bactéries acétiques. La pellicule formée à la surface du milieu prélevée et placée dans une capsule ou sur une lame et recouverte de réactif (lugol) puis d'acide sulfurique à 60%.Le développement d'une couleur bleue traduit la production de cellulose (Mariama . C et. al ; 2021). Le développement des fibres d'une couleur bleue signifier une production de cellulose (Gibbs et Shapton ,1968)

? Etude de la tolérance des bactéries acétiques aux températures élève

La thermo- tolérance des souches isolées a été réalisé dans des milieux liquides de Frateur (50 ml), ensemencé et incubé aux différentes températures ; 30°C, 35°C, 40°C, 45°C, 50°C, 55°C, 60°C. Toutes les cultures sont comparées avec une culture blanc (50 ml). Les flacons ont été inoculés avec des colonies jeunes de 48 h d'incubation à 30°C puis incubé simultanément séparément à des températures différentes. La qualité totale de biomasse produit a été déterminée en mesurant l'absorbance de la culture sur un spectrophotomètre à 600 nm (DO mesuré par spectrophotomètre) pour tous les échantillons (Mounir et al. 2016).

? Etude la mobilité et l'utilisation de mannitol (essai propre lui) :

Ensemencer avec pipette Pasteur, par piqure centrale, jusqu'au fond du tube de gélose. Incuber à 30°C pendants 48 h ; la fermentation du mannitol virage de la couleur au jaune du milieu .Les bactéries mobiles envahissent tout le milieu à partir de la piqure centrale.

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Partie 02 : ETUDE EXPERIMENTALLE]

Chapitre II : Résultats et discussions

 

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"I don't believe we shall ever have a good money again before we take the thing out of the hand of governments. We can't take it violently, out of the hands of governments, all we can do is by some sly roundabout way introduce something that they can't stop ..."   Friedrich Hayek (1899-1992) en 1984