3.3 Concept de l'interaction génotype x milieu
Lorsqu'un caractère est mesuré sur un individu,
la valeur observée représente la valeur phénotypique de
cet individu et toutes les observations doivent être fondées sur
la mesure des valeurs phénotypiques. Dans ce cas, les caractères
quantitatifs, dans leur expression phénotypique sont la
résultante en fait de plusieurs facteurs génétiques et non
génétiques. De ce fait, la variabilité phénotypique
(Vp) est égale à la somme suivante : [67].
(Vp) = VG + V (G ×E) + VE
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Où (VG) : la variance génétique, (VE) :
la variance environnementale et V (G ×E) : l'interaction génotype
× environnement. Inclure tous les facteurs d'ordre non
génétique dans le terme « environnement » signifie que
le génotype et l'environnement sont par définition les seules
causes qui déterminent la valeur phénotypique [67].
La variance génétique (VG) peut être
elle-même décomposée en variance additive (VA), due
à l'effet moyen des gènes, en variance de dominance (VD) due aux
interactions entre allèles aux même loci et en variance
d'épistasie (VEP), due aux interactions entre allèles à
des loci différents. L'expression de la variance phénotypique
devient :
(VP) = (VA) + (VD) + (VEP) + (VG x E) + (VE)
La variance due au milieu qui par définitions, comprend
toute la variation d'origine non génétique, peut avoir beaucoup
de causes différentes et sa nature dépendra beaucoup du
caractère et de l'espèce étudiée. D'une
façon générale, la variance due au milieu est une cause
d'erreur qui réduit la précision des études
génétiques [67].
L'interaction génotype x environnement
représentent, donc, la variation quantitative et qualitative, entre
divers environnements, des différences entre génotypes.
L'interaction perturbe en fait l'association que l'on peut faire entre valeur
phénotypique et valeur génotypique d'un caractère [69].
C'est l'interaction génotype x environnement qui permet d'expliquer que
certains génotypes soient plus performants que d'autres pour un type
d'environnement donné.
L'interaction GxE peut prendre plusieurs aspects [70] :
- soit qu'une quelconque différence spécifique
du milieu exerce sur certains génotypes un effet plus important que sur
d'autres ;
- soit qu'il y ait un changement dans le classement d'une
série de génotypes que l'on mesure sous différents
milieux, c'est-à-dire que le génotype A qui est supérieur
au génotype B sous le milieu X peut lui être inférieur sous
le milieu Y.
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