Influenza aviaire hautement pathogène à H5N1. Bilan en Afrique de 2006 au 31 décembre 2007

LISTE DES TABLEAUX

LISTE DES TABLEAUX

Tableau I : Production projetée d'une poule en Tanzanie

Tableau II : Souches aviaires hybrides de l'espèce Gallus gallus utilisées en Algérie.

Tableau III : Principaux pays producteurs de volailles en Afrique (production en tonnes)

Tableau IV : Données sur la production avicole en Afrique et dans le monde en 2003

Tableau V : Espèces moléculaires d'hémagglutinine d'influenzavirus de type A.

Tableau VI : Espèces moléculaires de neuramidase d'influenzavirus de type A

Tableau VII : Cas humains confirmés de grippe aviaire dans le monde de 2003 au 31 décembre 2007 de type A (H5N1)

Tableau VIII : Date de confirmation du virus H5N1 dans les pays africains (31 décembre 2007).

Tableau IX : Espèces affectées dans 11 pays d'Afrique

Tableau X : Récapitulatif des cas et décès dû au Virus H5N1 en Afrique au 31 décembre 2007.

Tableau XI : Localisation et caractérisation du 1^er foyer de H5N1 au Nigeria.

Tableau XII : Caractéristiques des animaux des premiers foyers en Égypte.

Tableau XIII : Mortalité selon le sexe dû à l'Influenza Aviaire en Afrique.

Tableau XIV : Localisation et caractérisation du 1^er foyer de H5N1 au Niger.

Tableau XV : Somme allouée à l'indemnisation selon le type de volailles au Niger.

Tableau XVI : Localisation et caractérisation du 1er foyer de H5N1 au Cameroun

Tableau XVII : Localisation et caractérisation du 1er foyer de H5N1 au Burkina Faso

Tableau XVIII : Localisation et caractérisation du 1er foyer de H5N1 au Soudan

Tableau XIX: Localisation et caractérisation du 1er foyer de H5N1 en Côte d'Ivoire

Tableau XX : Localisation et caractérisation du 1er foyer de H5N1 de Djibouti.

Tableau XXI : Caractéristiques du 1^er foyer au Ghana.

Tableau XXII : Caractéristiques du 1^er foyer au Togo.

Tableau XXIII : Caractéristiques des 1er et 2^ème foyers au Bénin.

Tableau XXIV : Pertes quantitatives et économiques liées au déficit de production de volailles en Côte d'Ivoire

Tableau XXIV : Valeurs monétaires d'indemnisation des abattages FCFA en Côte d'Ivoire

Plan détaillé

INTRODUCTION 1

Première partie : Filière avicole en Afrique et généralités sur l'Influenza aviaire Hautement Pathogène 3

CHAPITRE I : FILIERE AVICOLE EN AFRIQUE 4

I. Contexte macro économique de l'Afrique 4

I.1. Présentation de l'Afrique 4

I.2. Économie 5

II. Filière avicole en Afrique 5

II.1. Aviculture traditionnelle 7

II.1.1. Contexte 7

II.1.2. Importance socio-économique 8

II.1.3. Aspect sanitaire 9

II.2. Aviculture moderne 9

II.2.1. Contexte 9

II.2.2. Zones d'élevage 10

II.2.3. Production 11

II.2.3.1. Race et souches exploitées 11

II.2.3.2. Type de spéculations 12

II.2.3.3. Production de volaille et d'oeufs de consommation 13

II.2.4. Importation des viandes et abats 15

II.2.5. Consommation de volaille et d'oeufs en Afrique 15

III. Organisation générale et Acteurs de la filière avicole 16

III.1. Acteurs de la filière 16

III.2. Importation 16

IV. Atouts et contraintes de la filière avicole 18

IV.1. Atouts 18

IV.1.1. Filière traditionnelle 18

IV.1.2. Filière moderne 19

IV.2. Contraintes 20

IV.2.1. Filière traditionnelle 20

IV.2.1.1. Contraintes zootechniques 20

IV.2.1.2. Contraintes Pathologiques 20

IV.2.2. Filière moderne 21

IV.2.2.1. Contraintes financières et techniques 21

IV.2.2.2. Contraintes institutionnelles 21

IV.2.2.3. Contraintes Zootechniques 21

IV.2.2.4. Contraintes sanitaires et pathologiques 22

Chapitre II : GENERALITES SUR L'INFLUENZA AVIAIRE HAUTEMENT 23

PATHOGENE 23

I Définition - Importance 23

I.1 Définition 23

I.2 Importance 23

I.1.1 Sur le plan médical 23

I.1.2 Sur le plan économique 23

I.1.3 Sur le plan hygiénique : Risque pandémique 24

II Étiologie 25

II.1 Morphologie et structure de l'influenzavirus 25

II.2 Classement phylogénétique 26

II.3 Caractères physico-chimiques, culturaux et biologiques de l'influenzavirus 27

II.4 Propriétés biologiques 27

II.4.1 Pouvoir pathogène 27

II.4.2 Variabilité génétique des influenzavirus 29

II.4.2.1 Mutations ponctuelles 29

II.4.2.2 Réassortiments génétiques 30

II.4.3 Support moléculaire de la virulence 31

III Eléments d'épidémiologie 32

III.1 Espèces affectées 32

III.2 Réservoir 33

III.3 Transmission dans l'Avifaune 34

III.4 Transmission d'influenzavirus d'origine aviaire à l'homme 34

IV Symptômes et lésions 36

IV.1 Symptômes 36

IV.2 Lésions 36

V Diagnostic 38

V.1 Diagnostic sur le terrain 38

V.2 Diagnostic de laboratoire 38

V.2.1 Méthodes virologiques directes 39

V.2.2 Méthodes virologiques indirectes ou sérologiques 40

VI Prophylaxie et mesures de polices sanitaires 40

Deuxième partie : Bilan de l'Influenza Aviaire Hautement Pathogène en Afrique en 2006 et 2007 44

Chapitre I - Cadre d'étude et approche méthodologique 45

I Cadre d'Étude 45

I.1 Milieu d'étude 45

I.2 Repères géographiques des pays africains affectés par le virus H5N1 45

I.2.1 Bénin 45

I.2.2 Burkina Faso 45

I.2.3 Cameroun 46

I.2.4 Côte-d'Ivoire 47

I.2.5 Djibouti 47

I.2.6 Égypte 48

I.2.7 Ghana 48

I.2.8 Niger 49

I.2.9 Nigeria 49

I.2.10 Soudan 50

I.2.11 Togo 50

II Méthodologie 51

II.1 Période d'étude 51

II.2 Approche méthodologique 51

II.3 Origine des données 52

II.3.1 OIE 52

II.3.1.1 Présentation 52

II.3.1.2 Collecte et diffusion d'informations sanitaires 52

II.3.1.3 Rapport d'urgence 53

II.3.1.4 Rapport de suivi 54

II.3.2 FAO 55

II.3.2.1 Missions générales. 55

II.3.2.2 L'unité spéciale « influenza aviaire » 56

II.3.2.3 Suivi de l'épizootie 56

II.3.2.4 Complémentarité des deux agences de santé animale 57

II.3.3 OMS 57

II.3.3.1 Réseau de surveillance de la grippe 57

II.4 Utilisation des données 58

II.5 Estimation du nombre de cas humains 58

II.6 Saisie et traitement des données 59

Chapitre II - Résultats 60

I.1. Répartition et caractéristiques de l'influenza aviaire en Afrique 60

I.1.1. Répartition géographique des foyers 60

I.1.2. Caractéristiques générales de l'IAHP en Afrique 61

I.1.2.1. Chez les animaux 61

I.1.2.2. Chez l'Homme 65

I.2. Bilan par pays 66

I.2.1. Bilan chez les volailles domestiques 66

I.2.1.1. Cas du Nigeria 67

I.2.1.2. Cas de l'Égypte 70

I.2.1.3. Cas du Niger 74

I.2.1.4. Cas du Cameroun 77

I.2.1.5. Cas du Burkina Faso 79

I.2.1.6. Cas du soudan 80

I.2.1.7. Cas de la Côte d'Ivoire 81

I.2.1.8. Cas de Djibouti 83

I.2.1.9. Cas du Ghana 84

I.2.1.10. Cas du Togo 85

I.2.1.11. Cas du Bénin 86

I.3. Origine et mode de propagation du H5N1 en Afrique 87

I.4. Conséquences socio-économiques de la maladie en Afrique 88

I.4.1. Budget de la FAO 89

I.4.2. Pertes économiques : Exemple de la Côte d'Ivoire 89

I.4.3. Psychose « Grippe aviaire » : Exemple du Cameroun 91

I.5. Information, Sensibilisation et formation 92

I.6. Actions contre l'influenza aviaire hautement pathogène 92

I.6.1. Action internationale 93

I.6.2. Action au niveau africain 93

I.6.3. Cas des actions menées par l'EISMV de Dakar 97

Chapitre III - Discussion et recommandations 99

I. Discussion 99

I.1. Cadre d'étude et méthodologie 99

I.2. Répartition et caractéristiques de l'influenza aviaire en Afrique 100

I.2.1. Origine et mode de propagation de l'IAHP 100

I.2.2. Délais entre confirmation de laboratoire, début présumé de la maladie et rapport à l'OIE 102

I.2.3. Nombre de foyers chez la volaille 102

I.2.4. Cas du bénin 103

I.2.5. Espèces Affectées 103

I.3. Cas humains 104

I.4. Conséquences socio-économiques en Afrique 104

I.5. Information, Sensibilisation et formation 105

II. Recommandations 105

II.1. Aux éleveurs 105

II.2. Aux États 105

II.3. Aux organisations internationales de santé publique et bailleurs de fonds. 106

III. Perspectives de recherches 106

Conclusion 107

Bibliographie 110