CHAPITRE DEUXIEME : MATERIEL ET METHODES
II.1 Prélèvement
Le prélèvement des échantillons a
été fait au niveau des alimentations que nous avons
ciblées. Après prélèvement, 1g d'échantillon
a été dilué, homogénéisé dans 9ml
d'eau physiologique stérile dans un tube à essai. En suite une
série des dilutions décimales a été
réalisée jusqu'à 10-3
II.2 Dénombrement et isolement des
souches.
Un milli litre de la dilution 10-3 est
enrobé dans la gélose nutritive contenue dans une boite de
Pétri. Après incubation, à 37°C pendant 24 heures,
les colonies ont été dénombrés par comptage
direct. Nous avons effectué cette opération à raison de
deux boites par échantillon.
II.3 Conservation des souches
isolées
Les colonies ayant servi au dénombrement ont
été repiquées dans la gélose molle et gardée
à la température du laboratoire
II.4 Caractérisation des souches
isolées.
II.4.1 Coloration de Gram
Après préparation et fixation du frottis, nous
avons procédé comme suit :
- Couvrir la lame par le cristal violet pendant 60 secondes,
puis la rincer à l'eau ;
- Recouvrir la préparation avec le Lugol pendant 60
secondes et rincer de nouveau ;
- Décolorer à l'alcool pendant #177; 3 secondes
et laver rapidement à l'eau ;
- Recolorer ensuite à l'aide de la safranine pendant
#177; 10secondes ;
- Laver à l'eau et sécher.
Après séchage, observation au microscope
à l'objectif à immersion. Les bactéries à
Gram- sont colorées en roses ou orange et celles de
Gram+ en bleu ou violet.
II.4.2 Caractérisation biochimique et
physiologique
Les caractérisations biochimiques et physiologiques
étaient faite à travers le milieu de Kligler. Elle nous a permis
de caractériser les bactéries après la mise en
évidence du glucose, de la lactose, de la production du sulfure
d'hydrogène et du gaz. Pour procéder à cette
caractérisation, nous avons ensemencé les différentes
souches à étudier par piqûre dans le culot et par strie
sur la pente de la gélose de Kligler inclinée. (MARCHAL1997). Ces
résultats sont liés :
a) A la fermentation du glucose : le culot est
rouge jaune s'il y a fermentation. S'il n'y a pas de fermentation du glucose et
le culot est rouge.
b) A la fermentation de la lactose : Si la pente
du milieu incliné est rouge il n'y pas fermentation de la lactose. Si
c'est jaune c'est positif, il y a fermentation du lactose.
c) A la production du gaz : Si c'est positif, on
voit l'apparition des bulles d'air ou cassure d'agar de Kligler. Pas des
bulles, le résultat est négatif.
d) A la formation de Sulfate d'hydrogène :
Si c'est positif on voit la formation d'un anneau noir qui contourne le culot,
s'il n'y en a pas c'est négatif.
A travers ses différents renseignements on peut
directement identifier la bactérie à partir d'un tableau
synoptique offrant les différentes combinaisons liées à la
positivité ou à la négativité d'un résultat.
Ce tableau, peut être représenté de la manière
ci-dessous :
Tableau 8 : Tableau d'identification des
bactéries à partir des résultats optenus par le milieu de
Kligler
Bactérie correspondante
|
Formation de glucose
|
Fermentation du lactose
|
FormationdeH2S
(Sulfated'hydrogène)
|
Production du Gaz
|
Citrobacter freundii
|
Positive
|
Positive
|
Positive
|
Positive
|
Alcali gènes
Pseudomonas spp
|
Negative
|
Negative
|
Negative
|
Negative
|
Achromobacter spp
Escherichia coli
Klebsiella spp
Citrobacter inermedium
|
Negative
|
Positive
|
Negative
|
Positive
|
Providencia spp
Proteus morganii
Proteus rotgeri
Salmonella typhi
|
Positive
|
Negative
|
Negative
|
Positive
|
Proteus vilgaris
Arizona spp
Proteus mirabilis
Citrobacter
|
Positive
|
Negative
|
Positive
|
Positive
|
Shigella spp
Serratia spp
|
Positive
|
Negative
|
Negative
|
Negative
|
II.5 Antibiogramme
Il consiste à la détermination de la
sensibilité d'une bactérie aux antibiotiques. Pour l'effectuer on
prépare des disques qui son des rondelles de cellulose de 7mm de
diamètre. On prépare aussi une série d'antibiotiques qu'on
soumet dans des tubes stériles à raison des doses prévues
par antibiotiques.
Dans le cadre de cette recherche nous avons utilisées 7
antibiotiques. Ces antibiotiques sont : L'augmentin, le ciproxin, le
negram, le cefatoxe, l'érythromycine et la chloxacilline. Ces
antibiotiques sont représentés à travers la photo 1
ci-dessous selon l'ordre précité.
L'étude de la sensibilité des bactéries
est faite par la méthode de diffusion sur gélose de Muller
Hinton. Cette méthode consiste à déposer les disques
imbibés de solution d'antibiotique sur une gélose de Muller
ensemencée.
L'antibiotique contenu dans le disque va diffuser suivant un
gradient de concentration et les bactéries ne ses développent pas
pour les concentrations supérieures ou égales à la
concentration minimale inhibitrice. On obtient une zone d'inhibition autour du
disque plus ou moins grande selon la sensibilité de la souche et le
pouvoir de diffusion de l'antibiotique. Cette pratique est couramment
utilisée dans les laboratoires biomédical (Biomerieux, 1989,
Monica, 2000).
II.5.1 Lecture du test de
sensibilité
L'effet des antibiotiques sur les germes est mis en
évidence par l'apparition des zones d'inhibition. On considère
comme zone d'inhibition, le halo clair autour des disques où il y a
absence totale de croissance. Ainsi, la sensibilité des bactéries
aux antibiotiques est appréciée en mesurant le diamètre de
zone avec un compas ou une latte. La valeur obtenue est comparée
à celle du diamètre critique de l'antibiotique:
· Le diamètre de la zone d'inhibition est
inférieur au diamètre critique: conclure résistant;
· Le diamètre de la zone d'inhibition
supérieur au diamètre critique:conclure sensible;
· Les réponses intermédiaires sont
assimilées aux résistants (Institut Pasteur, 1983 ; Monica,
2000).
D'après les antibiotiques que nous
avons utilisés les diamètres des zones d'inhibitions ont
été mesurés (en mm) et consignés dans le tableau 9,
ci-dessous :
Tableau 9 : Diamètre critique de zone
d'inhibition (Monica, 2000)
N°
|
ANTIBIOTIQUES
|
RESISTANT
|
INTERMEDIAIRES
|
SENSIBLES
|
1
|
Augmentin
|
14
|
14 - 20
|
21
|
2
|
Cefatox
|
14
|
15 - 22
|
23
|
3
|
Ciproxin
|
15
|
16 - 20
|
21
|
4
|
Chloxacilline
|
20
|
#177;
|
20
|
5
|
Erythromycine
|
13
|
14 - 22
|
23
|
6
|
Negram
|
13
|
14 - 18
|
19
|
7
|
Rufampicine
|
14
|
14 - 18
|
19
|
|