2. 1. 3. Analyse des critères phénotypiques
par UPGMA
La caractérisation phénotypique des 45 souches
bactériennes isolées des racines de sulla a été
basée sur 27 caractères. Les résultats ont
été traités par UPGMA, le dendrogramme qui en
dérive est représenté par la figure 25. Les
caractères les plus discriminants de cette analyse ont été
groupés et représentés dans le tableau 13.
A 65 % de niveau de similitude, les souches se trouvent
réparties en trois groupes:
- le groupe1 est formé par des souches isolées
essentiellement de deux stations (Tunis et El Fahs); seule la souche HC1 est
originaire de la station Medjez El Bab. Ces souches ont des critères
morphologiques communs relatifs aux colonies particulièrement au niveau
de la présence de relief, de la consistance épaisse et de
l'absence du noyau. Dix souches parmi les 13 de ce groupe forment des colonies
à diamètre variable de 3 à 4 mm après 5 jours
d'incubation. Concernant les critères physiologiques, les souches de ce
groupe sont caractérisées par un niveau de tolérance au
stress hydrique de -0,5 MPa, un pH majoritairement élevé (10,5)
et un niveau de tolérance au stress salin (NaCl) variable de 150
à 700 mM;
- le groupe 2 englobant 55 % des souches, est le plus
hétérogène de la collection avec des souches appartenant
à 6 stations différentes; et
- le groupe 3 renferme les souches ayant induit une nodulation
non reproductible. Elles sont originaires de 3 stations différentes. Ces
souches forment des colonies transparentes, majoritairement (6/7 colonies) non
visqueuses, sans relief et absorbent le rouge Congo. Ces isolats sont
particulièrement tolérants au stress salin (700 mM) et aux pH
élevés (10,5).
Groupe 1 Groupe 2 Groupe 3
Figure 25: Dendrogramme de similarité
entre les souches de la collection pour l'ensemble des caractères
phénotypiques (méthode UPGMA selon l'indice de Jaccard).
Tableau 13: Caractéristiques
phénotypiques des groupes de souches nodulant le sulla selon l'analyse
UPGMA.
|
Groupe 1
|
Groupe 2
|
Groupe 3
|
|
Nombre de souches
|
13
|
25
|
7
|
|
Infectivité:
|
|
|
|
|
Répétitive
|
10
|
24
|
0
|
|
Non répétitive
|
3
|
1
|
7
|
|
Diamètre des colonies:
|
|
|
|
|
1 à 2 mm
|
2
|
0
|
4
|
|
3 à 4 mm
|
10
|
20
|
2
|
|
5 à 6 mm
|
1
|
5
|
1
|
|
Absorption Rouge Congo:
|
|
|
|
|
absorbe
|
1
|
0
|
6
|
|
n'absorbe pas
|
12
|
25
|
1
|
|
Forme de la colonie:
|
|
|
|
|
circulaire
|
11
|
24
|
4
|
|
ovoïde
|
2
|
1
|
3
|
|
Présence de noyau:
|
|
|
|
|
avec noyau
|
0
|
1
|
3
|
|
sans noyau
|
13
|
24
|
4
|
|
Transparence:
|
|
|
|
|
transparente
|
8
|
4
|
7
|
|
opaque
|
5
|
21
|
0
|
|
Consistance:
|
|
|
|
|
Coulante
|
0
|
2
|
2
|
|
épaisse
|
13
|
23
|
5
|
|
Relief:
|
|
|
|
|
sans relief
|
0
|
0
|
6
|
|
avec relief
|
13
|
25
|
1
|
|
Viscosité:
|
|
|
|
|
non visqueuse
|
5
|
15
|
1
|
|
visqueuse pH:
|
8
|
10
|
6
|
|
8,5
|
0
|
2
|
0
|
|
9
|
0
|
5
|
0
|
|
9,5
|
1
|
0
|
0
|
|
10
|
0
|
12
|
0
|
|
10,5
|
12
|
6
|
7
|
|
NaCl:
|
|
|
|
|
150 mM
|
7
|
0
|
0
|
|
200 mM
|
0
|
18
|
0
|
|
400 mM
|
0
|
4
|
0
|
|
700 mM
|
6
|
3
|
7
|
|
PEG 6000:
|
|
|
|
|
-0,5
|
13
|
0
|
1
|
|
-0,9
|
0
|
21
|
6
|
|
-0,95
|
0
|
4
|
0
|
| 
