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Diversités phénotypique et moléculaire des microsymbiotes du Sulla du nord (Hédysarum Coronarium L. ) et sélection de souches rhizobiales efficientes

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par Sana Dhane Fitouri
Institut national agronomique de Tunisie - Doctorat en sciences agronomiques 2011
  

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2. 1. 2. 3. Tolérance au pH basique

Toutes les souches arrivent à croître normalement dans des milieux à pH variant entre 7 et 8. A partir d'un pH de 8,5, deux souches parmi les 45 testées cessent de se développer. Tandis que 82,2 % des souches ont été capables de croître normalement jusqu'à un de pH 9,5. Ce n'est qu'à partir d'un pH de 10 que le pourcentage des souches tolérantes baisse à 55,6%.

Le pH 10,5 représente ainsi une limite de tolérance des rhizobiums collectés (Tableau 12). En effet aucune souche n'a été capable de croitre à un pH de 11 (Figure 22).

Figure 22: Cinétique de tolérance des souches rhizobiales de sulla selon la variation du pH du milieu de culture liquide.

Sur 62 souches isolées de l'espèce Hedysarum coronarium L., El Boutari (2009) a rapporté une tolérance au pH des rhizobiums spécifiques variante entre 9 et 9,5. Ce résultat concorde avec les seuils de tolérance aux pH trouvés. Cette tolérance se trouve aléatoire d'une espèce à une autre (Jordan, 1984). En effet, Glenn et Dilworth (1994) ont rapporté que le groupe des souches bactériennes à croissance rapide a tendance à tolérer des milieux basiques allant jusqu'à un pH de10. Dans ce sens, Rao et al. (1994) ont isolé des rhizobiums de pois pouvant tolérer des pH supérieurs à 11,5. Quant à Diatloff (1970), il a rapporté que la le Bradyrhizobium japonicum présente une croissance limitée à pH 8,5.

2. 1. 2. 4. Tolérance au stress hydrique

L'ensemble des souches de la collection a supporté le stress hydrique jusqu'à -0,5 MPa. Ce niveau de stress a été la limite de tolérance pour 31 % des souches, alors que la majorité des isolats de la collection (60 %) ont présenté une tolérance jusqu'à -0,9 MPa. Uniquement quatre souches ont pu supporter le niveau -0,95 Mpa de stress hydrique (Figure 23, Tableau 12). Ce niveau a largement été dépassé par des souches isolées de nodosités de sulla par El Boutari (2009), qui a trouvé une marge de tolérance au stress hydrique entre 0 et - 1,5 MPa.

Figure 23: Cinétique de tolérance des souches rhizobiales de sulla selon la variation de stress osmotique du milieu de culture liquide.

2. 1. 2. 5. Tolérance au stress calcaire

L'analyse de la tolérance des souches de la collection au stress calcaire engendré par le CaCO3 a révélé une croissance normale de l'ensemble des 45 souches à des niveaux de calcaire variables de 0 à 2 M (Figure 24). En milieu liquide, l'addition progressive du CaCO3 provoque rapidement une saturation empêchant la lecture par spectrophotométrie.

La variation du calcaire jusqu'à 2 M n'a pas engendré d'effet inhibiteur sur la croissance des souches à l'état libre. Cette faculté de croissance à de fortes teneurs en calcium pourrait être en relation avec la nature des protéines Ca2+ dépendante et constituant la membrane bactérienne (Gobat, 1998; Dardanelli et al., 2003).

0 M 0,5 M 1M 1,5M 2 M

Figure 24: Croissance des souches sur milieu YEM/RC solide enrichi en calcaire.

Tableau 12: Origine des souches nodulant le sulla avec leurs limites de tolérance aux stress abiotiques.

Sites

Souches

pH

NaCl

PEG

 
 
 

(mM)

(Mpa)

 

HC1

9,5

150

-0,50

Medjez El

H

10,0

200

-0,90

Bab

HC3

9,0

200

-0,90

 

HC4

10,0

200

-0,90

 

HC5

8,5

400

-0,95

 

HC6

9,0

200

-0,90

Smadah

HC7

8,5

400

-0,95

 

HC8

9,0

200

-0,90

 

HC9

9,0

200

-0,90

 

HC10

10,5

700

-0,90

 

HC11

10,5

700

-0,90

Ghzéla

 
 
 
 
 

HC12

10,5

700

-0,90

 

HC13

10,5

700

-0,90

 

HC14

10,0

200

-0,90

 

HC15

10,0

200

-0,90

Oued Zarga

 
 
 
 
 

HC16

10,0

200

-0,90

 

HC17

10,5

700

-0,90

 

HC18

10,0

200

-0,90

 

HC19

10,0

200

-0,90

 

H0

10,0

200

-0,90

Téboursouk

H1

10,0

200

-0,90

 

H2

10,0

200

-0,90

 

H3

10,0

200

-0,90

 

H4

10,0

200

-0,90

 

H5

10,5

150

-0,50

 

H6

10,5

200

-0,90

 

H7

10,5

150

-0,50

 

H8

10,5

150

-0,50

Tunis

H9

10,5

200

-0,90

 

HC30

10,5

150

-0,50

 

HC31

10,5

150

-0,50

 

HC32

10,5

150

-0,50

 

HC33

10,5

400

-0,95

Ain Chalou

HC34

10,5

700

-0,90

 

HC35

9,0

400

-0,95

 

HC36

10,5

700

-0,50

 

HC37

10,5

700

-0,50

 

HC38

10,5

700

-0,50

 

HC39

10,5

700

-0,50

El Fahs

HC40

10,5

700

-0,90

 

HC41

10,5

700

-0,50

 

HC42

10,5

700

-0,50

 

HC43

10,5

700

-0,50

 

HC44

10,5

700

-0,90

 

HC45

10,5

700

-0,90

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