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Caractérisation biochimique et applications potentielles des glucosidases et de la a-galactosidase du suc digestif de la larve de rhynchophorus palmarum (curculionidae)

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par Assoi Yapi Désiré Patrice YAPI
Université ABOBO-ADJAMà‰ Abidjan - Doctorat 2008
  

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2-6-Détermination des propriétés moléculaires

2-6-1- Détermination des masses moléculaires par gel filtration

Pour la détermination des masses moléculaires des glycosidases purifiées à homogénéité électrophorétique, des protéines de référence ont été utilisées. Ce sont : la âamylase (MM= 200 kDa), le sérum albumine bovine (MM= 66 kDa), l'ovalbumine (MM= 45 kDa) et le cytochrome C (MM= 12,4 kDa). Ces protéines ont été chargées séparément sur la colonne TSK (7,8 mm × 15 cm). La phase mobile utilisée a été le tampon acétate de sodium 100 mM contenant de l'azide de sodium (0,5 % , m/v). Le débit de la chromatographie a été de 30 ml/h. Il a été maintenu constant grâce à une pompe péristaltique de marque GILSON. Des fractions de 1 ml ont été collectées. Le temps d'élution de chaque protéine a été inscrit sur le chromatogramme. Connaissant les masses moléculaires des différentes protéines de

référence et leur temps d'élution, la courbe des masses moléculaires en fonction des temps d'élution a pu être tracée. Cette courbe d'étalonnage a permis de déterminer les masses moléculaires de l'á-glucosidase, de la â-glucosidase et de la â-galactosidase de la larve du charançon Rhynchophorus palmarum (Curculionidae) connaissant leurs temps d'élution.

2-6-2- Détermination des masses moléculaires par électrophorèse

sur gel de polyacrylamide en présence de SDS

L'électrophorèse sur gel de polyacrylamide en présence de dodécyle sulfate de sodium (SDS-PAGE) a été réalisée selon la méthode de Laemmli (1970). Les enzymes, dans un tampon Tris-HCl 125 mM pH 6,8 contenant du SDS (10 %, m/v), du â-mercaptoéthanol (1 %, v/v), du glycérol (20 %, m/v) et du bleu de bromophénol (0,025 %, m/v), ont été dénaturées par un traitement thermique à l'eau bouillante (5 min). Dans ces conditions, les protéines se dissocient en leurs sous-unités en fixant de grandes quantités de détergent (environ 1,4 g de détergent par gramme de protéine), ce qui masque complètement la charge naturelle de la sous-unité protéique et lui confère une charge nette négative. Plus les molécules sont volumineuses, plus la charge en SDS est importante, ce qui signifie que la mobilité électrophorétique d'une molécule dépend de sa taille (poids moléculaire). L'électrophorèse sur gel de polyacrylamide en conditions dénaturantes (SDS-PAGE) des trois enzymes purifiées à partir de la larve du charançon Rhynchophorus palmarum (Curculionidae) a été réalisée sur des plaques de gel d'acrylamide (7 x 8 cm). L'épaisseur du gel a été de 1,5 mm. Il contient 12 % d'acrylamide, du tampon Tris-HCl 375 mM (pH 8,8) et du S.D.S (10 %, m/v). Une fois polymérisée, le gel a été transféré sur un dispositif HOEFFER SCIENTIFIC INSTRUMENT (Mighty Small II Unit) et refroidi par une circulation d'eau. L'électrophorèse a été réalisée avec un courant électrique de 15 mA dans le tampon de migration Tris (25 mM)/glycine (192 mM) contenant du S.D.S (0,1 %, m/v). Des marqueurs Bio-Rad de faibles poids moléculaires [Phosphorylase B (91.000 Da), le sérum albumine bovine (66 kDa), l'ovalbumine (49,9 kDa), l'anhydrase carbonique (35,1 kDa), l'inhibiteur trypsique de soja (28,4 kDa) et le lysozyme (20,8 kDa)] ont été utilisés.

Les protéines ont été révélées au nitrate d'argent (Blum et al., 1987) ou au bleu de Coomassie R-250, (0,1 % , m/v) ; solution contenant du méthanol (40 %, v/v) et de l'acide acétique (10 %, v/v). La décoloration a été réalisée par lavages successifs dans le mélange méthanol/ acide acétique/ glycérol/eau (20/7/3/70, v/v/v/v).

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"Il faut répondre au mal par la rectitude, au bien par le bien."   Confucius