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Production de domaines recombinants PRODH en vue de l'analyse structurale & Caractérisation de la région 51-160 de la protéine KIN17 humaine par RMN et Modélisation Moléculaire

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par Ludovic Carlier
Université de Rouen - Doctorat de biologie structurale 2006
  

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3) Conclusions

La stratégie de surexpression du domaine K2 dans le cadre d'une facilité de production à moyen débit s'est avérée très fructueuse. En effet, le criblage systématique de plusieurs conditions d'expression en amont de la production à grande échelle a permis d'augmenter les chances de déterminer une condition qui réponde aux exigences inhérentes à l'étude par RMN. Ainsi, nous avons préparé une quantité suffisante de protéine soluble simplement marquée 15N, et doublement marquée 15N / 13C, pour envisager une attribution complète des noyaux 1H, 15N, et 13C du domaine K2 (3 tubes simplement marqués 15N à ~0.8 mM, et 3 tubes doublement marqués 15N / 13C à ~ 0.7 mM). De plus, les différentes analyses

qui ont été menées montrent que la protéine est pure, stable, et structurée. D'un point de vue matériel, l'optimisation de l'expression en milieux marqués, associée aux choix portés sur les méthodes de purification, ont permis de réduire le coût de production des échantillons, qui reste cependant très onéreux.

Au cours de cette étude préliminaire, nous avons également caractérisé une organisation monomérique du domaine K2 dans des conditions chimiques proches de l'échantillon RMN. Et enfin, nous avons optimisé les conditions de l'analyse RMN avant d'aborder une caractérisation structurale complète par RMN et modélisation moléculaire qui

fait l'objet du prochain chapitre.

Chapitre 3 : Stratégie d'étude par RMN et Modélisation Moléculaire du domaine K2

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