d)
Epissage in vivo
Les cellules sont récoltées 24 heures
après la transfection. La co-transfection avec le plasmide
pCMV-luciférase permet la standardisation de la RT en fonction des
différences observées dans l'efficacité de transfection.
Une fraction aliquotée de ces cellules est utilisée pour mesurer
l'activité luciférase et le reste est utilisé pour
effectuer une extraction totale des ARNs. Les ARNs totaux sont
préparés à partir des cellules en utilisant le protocole
de purification d'ARN et d'après les instructions du fournisseur
(RNeasy, Qiagen) et traité deux fois par la Dnase I (Qiagen). La
qualité des ARNs obtenus est observée par migration sur un gel
d'agarose dénaturant. Les isoformes de l'ARN E1A sont analysées
par RT-PCR comme décrit précédemment (Hallier et coll.,
1998). Un microgramme d'ARN est rétro-transcrit par la SuperscriptII
transcriptase reverse du virus de la leucémie murine de Moloney
(Gibco-BRL) en présence de 50 uM de dNTP et 2 picomoles du primer 3'RT
E1A dans une solution de 8 ul. Environ un dixième de l'ADNc est
utilisé pour la réaction d'amplification (PCR)
réalisée avec la Taq polymérase ADN (Perkin
Elmer) en présence de l'amorce 5'E1A marquée à son
extrémité 5' par la T4 polynucléotide kinase (Boehringer)
et de l'ATP P32 (Amersham) comme précédemment
décrit (Hallier et coll., 1998). Le minimum de cycles PCR est
utilisé (18 à 22 cycles) afin de détecter le signal dans
une fenêtre de détection adéquate. Les réactions de
contrôle de la RT-PCR contiennent une matrice ARN n'ayant pas subi de
transcription inverse. Les produits de la RT-PCR de E1A sont mis à
migrer sur un gel de polyacrylamide/urée 6 % dénaturant,
autoradiographiés et quantifiés avec un système Biorad..
L'expression des protéines codées par les plasmides est
vérifiée par la technique du Western Blot effectuée sur
des échantillons de cellules transfectées d'où viennent
les ARNs totaux.
e)
Test de transactivation
La veille de la transfection, les cellules Cos-6 sont mises en
puits, dans 5ml de DMEM-6% SVF décomplémenté à
raison de 0,6x106 par puits. Le jour suivant, le milieu est
changé pour 4 ml de milieu frais. Dans chaque puits, sont ajoutés
une solution de 1 ml préalablement incubée à
température ambiante comprenant une solution plasmidique (TKGal,
RARE-Luciférase,...), 450 ug d'eau bi-distillée en plus de 50 ul
de CaCl2 (2,5 M) et 500 ul de HBS 2X (NaCl 280 mM, KCl 10 mM,
Na2HPO4 1,2 mM, Glucose 12 mM, Hépès
50 mM).
Les cellules HL-60 sont électroporées avec une
solution plasmidique équivalente.
Après une incubation de 12 heures à
37oC, les cellules sont lavées 2 fois au PBS 1X. Un tampon de
lyse (200 ul) est ajouté dans chaque puits et les cellules sont
décollées à l'aide d'un grattoir. Les cellules sont
récupérées dans des tubes Eppendorff, vortexées et
centrifugées 2 min. à 12000g et à 4oC.
L'activité de la luciférase (selon le protocole de Luciferase
Assay System, Promega, Madison, EUA) dans le lysat est mesurée dans un
luminomètre et exprimée en unité arbitraire.
L'activité de la -Galactosidase (selon le protocole de BM
Chemiluminescence ELISA Substrate -Gal, Boehringer Mannheim, Mannheim,
République Fédérale d'Allemagne) est également
mesurée afin de normaliser les mesures obtenues de l'activité
luciférase.
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