IV. Suivis phénotypiques et phénologiques
de la collection de ressources
génétiques 39
A. Matériel et méthode 39
1. Matériel végétal suivi 39
2. Suivis des stades phénologiques 41
3. Phénotypage 43
4. Données à disposition 44
B. Résultats et discussion 45
1. Données de floraison 45
2. Estimation des dégâts de gel 46
3. Analyse des dates de fructification 48
4. Analyse de la qualité des fruits 49
CONCLUSION 52
Liste des figures 54
Liste des tableaux 55
Liste des annexes 56
Bibliographie 57
ANNEXES 61
1
Introduction
Le changement climatique affecte la production agricole
mondiale. Dans le futur les phénomènes
météorologiques intenses et nouveaux vont se multiplier,
engendrant de nouveaux stress biotiques et abiotiques et impactant le cycle de
développement du monde végétal et animal et donc des
cultures.
En France, l'arboriculture est une filière fragile,
dont certaines productions sont en déclin, car déjà
grandement affectées par la concurrence internationale, elles sont
aujourd'hui en proie aux maladies et aux ravageurs émergents comme
la Drosophila Suzukii ainsi qu'aux accidents
climatiques répétitifs tels que les sécheresses et les
épisodes de gel.
Cet impact climatique est également observé chez
le cerisier doux (Punus avium), chez qui les besoins
en froid conditionnent la date de floraison et la production en fruits
(Beauvieux,2017). Pour faire face à ces problématiques, une
réelle adaptation de la filière est nécessaire avec un
travail en synergie entre producteurs et organismes de recherches. Cette
évolution de la filière est un travail long et difficile puisque
les nouveaux enjeux et nouveaux freins à la production ne cessent de se
multiplier.
Le Centre de Ressources Biologique (CRB) Prunus-Juglans
basé dans le sud-ouest de la France, permet la conservation de centaines
d'accessions de cerisiers et d'espèces apparentées. Cette
collection est un conservatoire et le support de recherche de l'équipe
A3C (Adaptation du cerisier au changement climatique). Chaque année
depuis 2015, des données ont été relevées sur les
stades phénologiques et la production de fruits pour mieux
connaître ce matériel végétal et pouvoir le
valoriser. Il s'agit notamment d'avoir une meilleure compréhension des
mécanismes de fonctionnement du cerisier doux face aux aléas
climatiques mais également d'augmenter les ressources
génétiques connues disponibles.
Ainsi, l'objectif de mon stage est de répondre à la
problématique suivante :
En quoi l'étude des ressources
génétiques chez le cerisier peut permettre de faire face aux
conditions de production futures ?
Tout d'abord en expliquant le rôle de l'INRAE et ses
différentes structures, en s'intéressant aux
caractéristiques du cerisier, puis en abordant le contexte historique et
économique du cerisier à l'échelle mondiale et
française et enfin, en étudiant les caractères
intéressants chez les arbres de la collection.
I. Présentation de l'organisme
d'accueil
2
A. L'INRAE, l'UEA et ses objectifs
L'Institut National de Recherche pour l'Agriculture,
l'Alimentation et l'Environnement (INRAE) est un EPST (Etablissement public
à caractère scientifique et technologique) organisme public de
recherche et d'innovation. L'INRAE nait d'une fusion entre l'INRA (Institut
National de la Recherche Agronomique) et l'IRSTEA (l'Institut National de
Recherche en Sciences et Technologies pour l'Environnement et l'Agriculture) en
2020. L'INRAE concentre ses recherches dans le but de répondre aux
enjeux actuels tels que la transition des pratiques agricoles, la sauvegarde de
la biodiversité et la protection des ressources naturelles ou encore la
sécurité alimentaire. Actuellement, l'INRAE est composé de
18 centres de recherches situés en France métropolitaine et dans
les territoires d'outre-mer (ANNEXE A).
Le découpage s'effectue également par
départements de recherche qui sont au nombre de 14, allant du
développement territorial à l'innovation génétique
en passant par la santé animale (ANNEXE B). L'Unité
Expérimentale Arboricole (UEA) est rattachée au centre de
recherche de l'INRAE Bordeaux Nouvelle-Aquitaine et elle s'inscrit dans les
objectifs du département BAP (Biologie et amélioration des
plantes) (ANNEXE C). L'UEA regroupe actuellement 2 domaines
d'expérimentations qui sont Toulenne (33) et Bourran (47). Ses
principaux objectifs sont la conduite de forêts et de vergers,
l'expérimentation et le phénotypage pour produire,
caractériser et mettre à disposition du matériel
végétal et les données associées nécessaires
aux programmes de recherches des équipes de I'INRAE, voire d'autres
organismes de recherche publiques, français ou européens. L'UEA
collabore également avec des acteurs de la filière tels que des
stations d'expérimentation ou des interprofessions. L'UEA est
divisée en 3 pôles expérimentaux (ANNEXE D) :
3
- Evaluation du matériel végétal
et innovation variétale (EMV-IV) dont les objectifs sont
principalement le phénotypage du matériel végétal
présent ainsi que la sélection d'hybrides pour appuyer les
recherches de l'équipe A3C (adaptation du cerisier aux changements
climatiques) de l'Unité BFP (Biologie du Fruit et Pathologie), celles de
l'équipe virologie de l'Unité BFP ainsi que les recherches
conduites par l'Unité BioGéCo (Biologie Gène et
communauté) sur arbres forestiers. Ces programmes de recherche
s'intéressent aux adaptations face aux modifications climatiques ainsi
qu'à la sensibilité à certains bioagresseurs
- Systèmes de cultures innovants (SCI)
qui s'intéressent à la conduite de cultures innovantes avec de
faibles niveaux d'intrants, s'inscrivant dans une démarche de
modifications des pratiques culturales propulsées par la prise en compte
des effets environnementaux négatifs induits par l'utilisation de
produits phytosanitaires ainsi que la volonté de développer des
systèmes moins dépendants des ressources naturelles et fossiles
(uniquement pruniers). Ce travail vient en appui à la filière de
la prune de séchage, dans le cadre d'une convention de recherche.
- Ressource génétique (RG) qui
doit gérer le CRB Prunus-Juglans avec pour objectifs de
collecter, authentifier, conserver et caractériser les
variétés patrimoniales et de diffuser du matériel
végétal à des fins de recherches. (ANNEXE E)
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