Chapitre I : synthèse bibliographique
composants (ADN-A et ADN-B) possède des gènes
qui codent pour plusieurs protéines et une région
intergénique (Intergenic Region, IR) d'environ 200 paires de bases
comprenant l'origine de réplication (ori), les itérons (courtes
séquences répétées), la région commune
(Common Region, CR) et la tige boucle (5' TAATATT?AC 3') (Brown et
al., 2011; Zerbini et al., 2017) (figure 5).
Figure 5: Représentation de
l'organisation génomique des Begomovirus (monopartites et
bipartites). LIR (Long Intergenic Region); SIR (Short Intergenic
Region); CR (Common Region) (Zerbini et al., 2017).
L'ADN-A porte une région intergénique (IR) et 6
cadres ouverts de lecture ou ORFs (Open Reading Frames) dont certains
sont chevauchants (Brown et al., 2011; Fondong, 2013). Sur le brin
viral, l'ORF V1 (AV1 chez les bipartites) code pour la Protéine de
Capside CP qui est l'unité de base dans la constitution de la particule
virale en doublet des Begomovirus. L'ORF V2 (AV2 chez les bipartites)
code pour la Protéine de Mouvement MP qui associé à la CP
permet de diffusion du virus dans la plante hôte (Brown et al.,
2011; Fondong, 2013). Par ailleurs, des études ont montré que les
Begomovirus bipartites du Nouveau Monde ne possèdent pas l'ORF
AV2 (Rojas et al., 2001; Bull et al., 2007; Fondong, 2013;
Hanley-Bowdoin et al., 2013). Les ORFs portés par le brin
complémentaire codent pour la protéine associée à
la réplication (Rep) du virus au sein de la plante (ORF C1), la
protéine activatrice de la transcription (TrAP) (ORF ) (Wezel et
al., 2001), la protéine activatrice de la réplication (REn)
(ORF C3) et la protéine C4 (ORF C4). La protéine C4 semble
intervenir dans l'expression de la sévérité des
symptômes et dans le déplacement du virus dans la gamme
d'hôtes (Krake et al., 1998; Vanitharani et al., 2005).
Associé à la REn, la Rep permet
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Chapitre I : synthèse bibliographique
l'accumulation de la charge virale dans les cellules de la
plante (Hanley-bowdoin et al., 1989).
L'ADN-B des Begomovirus bipartites porte deux ORFs
non chevauchants qui codent pour deux protéines. La protéine MP
(ORF BC1) qui est impliquée dans le mouvement de cellule à
cellule de l'ADN viral et la protéine NSP (Nuclear Shuttle
Protein, ORF BV1) qui est impliquée dans le transport de l'ADN
viral du noyau vers le cytoplasme à travers la membrane nucléaire
(Sanderfoot et al., 1996; Gafni et Epel, 2002).
3.2. Association des Begomovirus avec des satellites
Les Begomovirus monopartites de l'Ancien Monde ont
été associés à la description de trois types de
molécules d'ADNsb circulaires. Il s'agit des á satellites et des
f3 satellites d'une taille d'environ 1350 nucléotides chacun (Briddon et
Stanley, 2006; Zhou, 2013) et les satellites défectifs d'une taille
d'environ 682 nucléotides (Lozano et al., 2016 ; Zhou,
2013).
Les á satellites sont capables d'autoréplication
dans les cellules végétales, mais dépendent de leurs
Begomovirus assistants, également nommés «
helper », pour le mouvement au sein de la plante hôte et la
transmission inter-plantes via l'insecte vecteur (Mansoor et al.,
1999; Saunders et Stanley, 1999). Ils codent pour une seule protéine
associée à la réplication (Zhou, 2013). Ils semblent jouer
un rôle de modulation de la virulence du complexe Begomovirus-f3
satellite (Idris et al., 2011) en diminuant, voire en supprimant
l'expression des symptômes de certaines maladies à
Begomovirus.
Les f3 satellites quant à eux sont entièrement
dépendants de leur association avec les Begomovirus pour leur
réplication, leur encapsidation et leur dissémination. Ils
contiennent trois régions conservées : une séquence riche
en Adénine (A-richsequence), une séquence
conservée connue sous le nom de région conservée des
satellites (satellite conserved region, SCR) et un seul gène
dans le sens complémentaire qui code pour une petite protéine
(~118 acides aminés) connue sous le nom de f3C1. La protéine f3C1
est une protéine multifonctionnelle intervenant dans la
sévérité de la maladie et la suppression de certains
mécanismes de résistance de la plante.
Les satellites défectifs (deltasatellites),
troisième classe d'ADN satellites en association avec des
Begomovirus, ont récemment été définis
(Fiallo-Olivé et al., 2012; Zhou, 2013; Lozano et al.,
2016). Ils sont distincts des á satellites et des f3 satellites en
raison de la petite taille de leur génome (~ 682 nucléotides) et
de l'absence d'ORF.
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