1.1. Généralités
Une bactérie est un organisme unicellulaire de l'ordre
des procaryotes (ne possédant donc pas de noyau, mais un ADN
chromosomique circulaire situé dans le cytoplasme), dont la taille varie
de 1 à 10 um. Chaque genre de bactéries a une morphologie et des
caractéristiques propres. (12)(13)
Pour les différencier et ainsi mieux les identifier, on
utilise de nombreux critères de classification des bactéries. Les
critères les plus utilisés sont leur morphologie
microscopique,
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ainsi que le résultat de la coloration de Gram (14).
L'identification se fait aussi grâce à d'autres caractères,
comme leur forme (les coques ou cocci, soit une forme sphérique, les
bacilles, en forme de bâtonnets, ou les spirales/hélices),
l'aspect macroscopique des colonies, leur mode de groupement, leur taille, leur
mobilité, la présence de spores, la présence d'une capsule
ou encore des critères biochimiques (mode de respiration, fermentation
de différents substrats) (15).
La majorité des bactéries n'est en conditions
normales pas pathogène, et est présente en grande quantité
dans le corps, notamment au sein du microbiote. Elles colonisent alors un
organisme avec lequel elles forment une symbiose ou du commensalisme (16).
Néanmoins, des bactéries présentes en concentration trop
importante, ou dans des zones où elles sont normalement absentes,
peuvent êtres responsables d'états maladifs : certaines sont
responsables de maladies infectieuses courantes en médecine
vétérinaire.
1.2. Classification de Gram
La coloration de Gram permet de différencier les
bactéries en 2 catégories : les bactéries Gram positif et
les bactéries Gram négatif. Elles se différencient
principalement par la structure de leur paroi. Cette différenciation
permet une première classification des bactéries, qui sera utile
dans leur étude.
Ø Les bactéries à Gram positif
ont une paroi composée jusqu'à 90% de peptidoglycane (ou
muréine), un polymère complexe, composé d'une chaîne
de N-acétylglucosamine et d'acide N-acétylmuramique, ainsi que
d'un ensemble de chaînes latérales peptidiques. Leur paroi est
épaisse, composée de peu ou pas de protéine (17). Elles
apparaissent bleues/violettes suite à une coloration de Gram, le violet
de gentiane, ou crystal violet CV+ se fixant aux composants
cytoplasmiques chargés négativement, et n'étant pas
expulsés grâce à la paroi imperméable (18).
Ø Les bactéries à Gram
négatif ne comportent qu'une voir deux couches de
peptidoglycane, qui ne représentent que 10 à 20% de la paroi :
celle-ci est plus fine que chez les bactéries à Gram positif. Ces
bactéries comportent également une membrane externe,
composée d'une double couche de phospholipides, et de
lipoprotéines. Elles apparaissent roses suite à une coloration de
Gram, les complexes violets étant expulsés suite à la
perte de la membrane externe durant la décoloration, et les
bactéries étant ensuite recolorées à la fuschine
(19)(20)(21)(22).
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