I.3.2 Cycle viral
La première étape de synthèse d'ARN est
la transcription primaire qui assure la synthèse des ARNm. Elle
est effectuée par le complexe de transcription associé aux RNP.
Chez les virus de cette famille, la transcriptase utilise un mécanisme
particulier, décrit à l'origine pour les Myxovirus, qui
consiste à initier la synthèse des ARNm avec un
oligoribonucléotide coiffé. C'est la capture de coiffe ou
"cap-snatching".
L'oligonucléotide amorce est
généré par clivage de l'extrémité 5' d'ARNm
cellulaires ; il comprend la coiffe et les 10-18 nucléotides suivants.
Le clivage est effectué par l'activité endonucléasique
associée à la protéine L.
Ainsi, tous les ARNm possèdent à leur
extrémité 5' une coiffe suivie d'une petite séquence
variable de 10 à 18 nucléotides qui représente une
extension par rapport à l'extrémité 3' de la matrice
génomique. Dans la plupart des cas, l'amorce s'apparie avec
lenucléotide en position +1 de l'extrémité 3' de la
matrice mais, parfois, elle s'apparie en position +2 ou +3, est allongée
de quelques bases, se décroche puis se repositionne en position +1 selon
un mécanisme de réalignement de l'amorce.
Le mécanisme de capture de coiffe s'applique aussi au
génome ambisens. Malgré la capacité de
l'ARN de sens génomique à coder pour la protéine NSs, cet
ARN ne sert pas directement d'ARNm. Cette protéine est
synthétisée à partir d'un ARNm spécifique transcrit
en utilisant l'antigénome comme matrice et initié par une amorce
cellulaire.
L'ARNm M est polyadénylé à son
extrémité 3' et le site de terminaison est situé à
quelque 70-140 nucléotides de l'extrémité 5' du
génome. Quant au segment L, il ne possède pas de site de
terminaison de transcription spécifique et son ARNm est un transcrit
complet.
(http://www.john-libbey-eurotext.fr/fr/revues/bio_rech/vir/e-docs/00/03/F8/4E/article.phtml)
LOPEZ et al. (1995) ont montré que le complexe
de transcription du virus de la FVR peut être reconstitué en
exprimant les protéines recombinantes L et N. Ce complexe est capable de
transcrire des ARN exogènes synthétisés in vitro.
Les séquences de l'ARN viral reconnues par le complexe
correspondent aux 14 nucléotides de l'extrémité 3' qui
sont conservés dans les trois segments de tous les Phlebovirus.
Outre la synthèse des ARNm, la transcriptase
synthétise les antigénomes, molécules qui servent de
matrice de réplication pour la synthèse des
génomes. Les molécules génomiques et
antigénomiques ont un ribonucléotide triphosphate à la
position +1 de la séquence virale, ce qui laisse penser que la
réplicase n'utilise pas d'amorces. La nature exacte de cette enzyme
n'est pas connue. La protéine NSs serait une protéine accessoire
ou, si elle est nécessaire, sa fonction est compensée par
d'autres protéines telles que la polymérase L des
Nairovirusou la protéine N des Nairoviruset des
Hantavirus, qui contiennent deux fois plus d'information que celle des
Phlebovirus.
La question du rôle essentiel ou accessoire de la
protéine NSs du VFVR doit être débattue sachant qu'il
existe un mutant naturel Clone 13 dans lequel le gène NSs est
déleté de 70 % et cette délétion interne conserve
en phase de lecture les régions N et C terminales. Pourtant, le virus
n'a pas perdu sa capacité à infecter vertébrés et
moustiques. La possibilité de manipuler le génome de ce virus au
moyen de la génétique inverse, comme cela vient d'être
réalisé par BRIDGEN et ELLIOTT pour le virus Bunyamwera
(prototype du genre Bunyavirus) devrait être la meilleure
approche expérimentale pour aborder ces questions (LOPEZ et
al., 1995).
Bien que le cycle viral se déroule dans le cytoplasme,
des structures filamenteuses contenant la protéine NSs sont
détectées au niveau du noyau des cellules infectées.
Depuis quelques années, certains chercheursont mis en évidence le
rôle essentiel que joue la protéine NSs dans la
pathogénicité du RVFV. Ils ont tout d'abord montré que la
protéine NSs est un facteur de virulence puisque les virus naturellement
délaités de cette protéine ne sont plus pathogènes.
Ils ont aussi démontré que la protéine NSs bloque la
production d'interféron de type I. (BOULOY et al.
cités par Lopez et al., 1995).
L'infection par le VFVR entraîne une inhibition rapide
et importante de la synthèse des ARN cellulaires qui s'accompagne d'une
diminution de la concentration du facteur de transcription TFIIH. En ce qui
concerne ce facteur, outre son rôle dans l'induction de la transcription,
il serait impliqué dans la réparation de l'ADN et probablement
aussi dans la régulation du cycle cellulaire. La protéine NSs, en
limitant la quantité de TFIIH fonctionnel, inhibe la transcription des
gènes cellulaires et permet ainsi au virus d'échapper à la
réponse antivirale de l'hôte (LOPEZ et al., 1995).
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