1.2 Hypothèses
Nous admettons dans nos travaux:
~ L'hypothèse de la théorie de
l'évolution [5], qui stipule que tous les êtres vivants sont issus
d'un ancêtre commun;
~ Les arbres d'espèces utilisés dans les
applications de nos algorithmes sont corrects.
1.3 Objectif général
L'objectif général est de proposer un
modèle d'évolution, un algorithme associé, ainsi qu'une
implémentation de l'algorithme pour la reconstruction de
l'évolution d'une famille de gènes en tenant compte de toutes les
protéines de chaque gène.
1.4 Objectifs spécifiques
~ Modéliser le mécanisme de production de
plusieurs protéines par un même gène;
~ Modéliser l'évolution de l'ensemble des
protéines au sein d'une famille de gènes;
1. les eucaryotes sont un domaine du vivant regroupant toutes
les espèces, unicellulaires ou pluricellulaires, qui se
caractérisent par la présence d'un noyau dans leurs cellules. Il
s'oppose aux domaines des procaryotes.
2. les gènes homologues sont des gènes qui sont
issus d'un gène ancêtre commun qui a divergé par la suite.
Ces gènes peuvent appartenir à la même espèce ou
non.
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