Chapitre II
2.1-Ecosystème microbien et immunité
mucosale :
Notre connaissance de la composition microbienne de
l'écosystème intestinal chez le sujet bien portant ou malade est
encore limitée (Figure 3).
· L'intestin contient une grande flore microbienne --
100,000 billions de bactéries, situées surtout dans le colon et
comprenant plusieurs centaines d'espèces de bactéries. La plupart
des cellules bactériennes issues de spécimens fécaux ne
peuvent pas être étudiées en culture.
· Au niveau des espèces et des souches, la
diversité microbienne entre individus est hautement remarquable : chaque
individu héberge sa propre composition bactérienne,
déterminée en partie par le génotype de l'hôte et
par la colonisation initiale à la naissance via une transmission
verticale.
· Chez l'adulte en bonne santé, la composition
fécale reste stable au cours du temps. Dans l'écosystème
de l'intestin humain, trois divisions bactériennes dominent : les
Bacteroidetes, les Firmicutes, et à un moindre niveau les
Actinobacteries.
Figure 4. Flore intestinale microbienne
La flore intestinale microbienne : un écosystème
diversifié et dynamique incluant des bactéries, Archaea et
Eukarya qui se sont adaptées à vivre sur la surface de la
muqueuse intestinale ou dans l'intestin humain
Ø Estomac et duodénum
- Héberge de très petites quantités de
micro-
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organismes : < 10 de cellules bactériennes par gramme
de
contenu
- Surtout des lactobacilles et des streptocoques
- L'acide, la bile et les secrétions pancréatiques
suppriment la plupart des microbes ingérés
- L'activité motrice phasique propulsive empêche une
colonisation stable de l'humain
Ø Jéjunum et ileon
- Le nombre de bactéries augmente progressivement
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d'environ 10 cellules dans le jéjunum à 10
cellules par
gramme de contenu dans l'iléon terminal
Ø Gros intestin
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- Forte population de anaérobies: 10 cellules par
gramme de contenu luminal
L'interaction normale entre les bactéries de l'intestin et
leur hôte est une relation symbiotique. Une influence importante des
bactéries du haut de l'intestin sur la fonction
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immunitaire est suggérée par un grand nombre de
structures lymphoïdes organisées dans la muqueuse de l'intestin
grêle (plaques de Peyer). Leur épithélium est
spécialisé dans la présentation, la transformation et le
transport des antigènes, et elles contiennent des centres
lymphoïdes germinatifs pour l'induction de réponses immunitaires
adaptées. Dans le colon, des micro-organismes peuvent proliférer
par fermentation de substrats disponibles à partir du bol alimentaire ou
de secrétions endogènes.
L'intestin est l'organe le plus important sur le plan de la
fonction immunitaire : approximativement 60 % des cellules immunitaires du
corps sont présentes dans la muqueuse intestinale. Le système
immunitaire contrôle les réponses immunitaires contre:
· Les protéines alimentaires
-Prévention des allergies alimentaires
· Micro-organismes pathogènes
-Virus (rotavirus, poliovirus)
-Bactéries (Salmonella, Listeria, Clostridium,
etc.)
-Parasites (Toxoplasma)
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