2.1.2 - Richesse allélique
La richesse allélique d'une population, définie
comme le nombre d'allèles présents à un locus
donné, est connue pour dépendre de la taille de
l'échantillon, puisque les chances de découvrir un nouvel
allèle augmentent chaque fois qu'un nouvel individu est observé
(Foulley et Ollivier, 2006). Dans ce travail, le nombre moyen d'allèle
par locus varie de 3,33 pour Kebili à 3,87 pour Tataouine. Il est de
4,25 pour la population globale, ce qui est relativement important.
2.1.3- Taux de loci polymorphe
Tous les loci sont révélés polymorphes
100% au seuil de 95% dans les trois populations. Ce résultat indique
l'efficacité des loci microsatellites utilisé pour l'étude
de la diversité génétique des populations
étudiées.
2.1.4- Hétérozygotie
Les taux d'hétérozygotie observée et
attendue ont été calculés pour chaque locus et population
sous l'hypothèse d'équilibre de Hardy Weinberg. Afin d'estimer
l'importance du polymorphisme génétique nous avons comparé
les deux taux d'hétérozygotie. Pour la population totale sur la
base de multilocus, l'hétérozygotie attendue non biaisée
(0,61) est supérieure à celle observé (0,52), traduisant
un écart positif suggérant un déficit en
hétérozygotie dans la population (tableau 13). La valeur de (Hnb
=0,61) est comparable à celle de dromadaires en Afrique du Sud (0,604),
inférieure à la valeur enregistrée chez la population
soudanaise (0,68) (Nolte et al., 2005) et elle est strictement
supérieure aux valeurs trouvées chez les populations de Kenya
(0,53) et Emirats Arabes (0,51) (Mburu et al., 2003). Cependant,
HO=0,52 est moins importante que d'autres valeurs trouvées dans d'autres
études
comme Vijh et al. (2007) qui ont signalé que
les valeurs de HO pour les races camelines indiennes sont respectivement 0,58,
0,57, 0,56, et 0,60 pour Bikaneri, Jaisalmeri, Kutchi et Mewari.
Tableau 12: Fréquences allèliques
dans chaque population (allèles abondants, rares et privés)
|
Loci Population
|
N
|
|
|
Fréquences allèliques
|
|
|
|
A
|
B
|
C
|
D
|
E
|
F
|
G
|
|
Kebili
|
30
|
0.100
|
0.516
|
0.317
|
0.017
|
0.050
|
0
|
|
|
CVRL01 Médenine
|
30
|
0.517
|
0.217
|
0.133
|
0.017
|
0
|
0.116
|
|
|
Tataouine
|
30
|
0.317
|
0.116
|
0.250
|
0.017
|
0
|
0.300
|
|
|
Tailles des allèles (pb)
|
|
253
|
249
|
240
|
235
|
220
|
210
|
|
|
Kebili
|
30
|
0.850
|
0.150
|
|
|
|
|
|
|
CVRL02 Médenine
|
30
|
0.950
|
0.050
|
|
|
|
|
|
|
Tataouine
|
30
|
0.883
|
0.117
|
|
|
|
|
|
|
Tailles des allèles (pb)
|
|
210
|
200
|
|
|
|
|
|
|
Kebili
|
30
|
0.767
|
0.117
|
0.116
|
|
|
|
|
|
CVRL05 Médenine
|
30
|
0.617
|
0.250
|
0.133
|
|
|
|
|
|
Tataouine
|
30
|
0.450
|
0.450
|
0.100
|
|
|
|
|
|
Tailles des allèles (pb)
|
|
170
|
165
|
150
|
|
|
|
|
|
Kebili
|
30
|
0.517
|
0.267
|
0
|
0.216
|
|
|
|
|
CVRL06 Médenine
|
30
|
0.417
|
0.300
|
0.033
|
0.250
|
|
|
|
|
Tataouine
|
30
|
0.517
|
0.217
|
0.033
|
0.233
|
|
|
|
|
Tailles des allèles (pb)
|
|
205
|
200
|
195
|
180
|
|
|
|
|
Kebili
|
30
|
0.533
|
0.117
|
0
|
0.350
|
0
|
0
|
|
|
CVRL07 Médenine
|
30
|
0.267
|
0.466
|
0.033
|
0.234
|
0
|
0
|
|
|
Tataouine
|
30
|
0.383
|
0.133
|
0
|
0.300
|
0.134
|
0.050
|
|
|
Tailles des allèles (pb)
|
|
315
|
310
|
300
|
280
|
270
|
265
|
|
|
Kebili
|
30
|
0
|
0.017
|
0
|
0.183
|
0.233
|
0.567
|
0
|
|
VOLP03 Médenine
|
30
|
0.084
|
0.250
|
0.200
|
0.050
|
0.383
|
0.033
|
0
|
|
Tataouine
|
30
|
0.017
|
0.083
|
0.100
|
0.15
|
0 .367
|
0.133
|
0.150
|
|
Tailles des allèles (pb)
|
|
180
|
170
|
165
|
160
|
155
|
145
|
140
|
|
Kebili
|
0
|
0
|
0
|
|
|
|
|
|
|
VOLP32 Médenine
|
09
|
0.444
|
0.556
|
|
|
|
|
|
|
Tataouine
|
30
|
0.483
|
0.517
|
|
|
|
|
|
Tailles des allèles (pb) 260 258
Kebili 0 0 0 0 0
YWLL02 Médenine 0 0 0 0 0
Tataouine 15 0.200 0.233 0.367 0.200
Tailles des allèles (pb) 310 306 302
298
N : Nombre d'individus
génotypés
Tableau 13 : Richesse allèlique et
hétérozygotie dans la population totale
|
Locus
|
N
|
NA
|
Ho
|
Hnb
|
He
|
|
CVRL01
|
90
|
6
|
0,46
|
0,75
|
0,759
|
|
CVRL02
|
90
|
2
|
0,21
|
0,19
|
0,18
|
|
CVRL05
|
90
|
3
|
0,43
|
0,55
|
0,54
|
|
CVRL06
|
90
|
4
|
0,89
|
0,65
|
0,64
|
|
CVRL07
|
90
|
6
|
0,14
|
0,70
|
0,69
|
|
VOLP03
|
90
|
7
|
0,60
|
0,78
|
0,78
|
|
VOLP32
|
39
|
2
|
0,92
|
0,51
|
0,49
|
|
YWLL02
|
15
|
4
|
0,53
|
0,76
|
0,73
|
|
Moyenne
|
|
4,25
|
0,52
|
0,61
|
0,60
|
N : Nombre d'individus analysés, NA : Nombre
d'allèles, Ho : Hétérozygotie observée Hnb :
Hétérozygotie calculée (non biaisée), He :
Hétérozygotie attendue.
Le tableau (14) résume la richesse allélique et les
taux d'hétérozygotie pour les populations individuelles.
Tableau 14 : Nombre d'allèles et
hétérozygotie par locus et par population
|
Locus
|
|
|
Kebili
|
|
|
|
|
Médenine
|
|
|
|
Tataouine
|
|
|
N
|
NA
|
Ho
|
Hnb
|
He
|
N
|
NA
|
Ho
|
Hnb
|
He
|
N
|
NA
|
Ho
|
Hnb
|
He
|
|
CVRL01
|
30
|
6
|
0,53
|
0,64
|
0,63
|
30
|
6
|
0,47
|
0,66
|
0,65
|
30
|
6
|
0,37
|
0,75
|
0,73
|
|
CVRL02
|
30
|
2
|
0,30
|
0,26
|
0,25
|
30
|
2
|
0,10
|
0,09
|
0,09
|
30
|
2
|
0,23
|
0,21
|
0,21
|
|
CVRL05
|
30
|
3
|
0,27
|
0,39
|
0,38
|
30
|
3
|
0,13
|
0,25
|
0,62
|
30
|
3
|
0,73
|
0,59
|
0,58
|
|
CVRL06
|
30
|
4
|
0,90
|
0,62
|
0,61
|
30
|
4
|
0,77
|
0,68
|
0,67
|
30
|
4
|
1,00
|
0,64
|
0,63
|
|
CVRL07
|
30
|
6
|
0,10
|
0,59
|
0,58
|
30
|
6
|
0,067
|
0,68
|
0,67
|
30
|
6
|
0,27
|
0,74
|
0,72
|
|
VOLP03
|
30
|
7
|
0,47
|
0,51
|
0,50
|
30
|
7
|
0,80
|
0,76
|
0,74
|
30
|
7
|
0,53
|
0,77
|
0,76
|
|
VOLP32
|
|
|
|
|
|
09
|
2
|
1,00
|
0,53
|
0,50
|
09
|
2
|
0,90
|
0,51
|
0,50
|
|
YWLL02
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
15
|
4
|
0,53
|
0,76
|
0,73
|
|
Moyenne
|
|
3,33
|
0,43
|
0,50
|
0,50
|
|
3,71
|
0,50
|
0,57
|
0,55
|
|
3,87
|
0,57
|
0,62
|
0,61
|
N: Nombre d'individus analysés, NA : Nombre
d'allèles, Ho : Hétérozygotie observée, Hnb :
Hétérozygotie calculée (non biaisée), He :
Hétérozygotie attendue
Remarquons que certains loci sont en écart significatif
par apport à l'équilibre de Hardy Weinberg, le tableau 15 montre
les résultats du test d'équilibre vérifié par le
logiciel Popgene (Yeh, 1999). Notons que tous les loci sont en
déséquilibre dans la population totale, à l'exception du
locus CVRL02, qui vérifie aussi bien l'équilibre dans toutes les
populations individuelles.
Tableau 15: Test de l'équilibre de
Hardy-Weinberg
|
Locus
|
|
Populations
|
|
|
Kebili
|
Médenine
|
Tataouine
|
Totale
|
|
CVRL01
|
-
|
***
|
***
|
***
|
|
CVRL02
|
-
|
-
|
-
|
-
|
|
CVRL05
|
**
|
***
|
***
|
***
|
|
CVRL06
|
***
|
***
|
***
|
***
|
|
CVRL07
|
***
|
***
|
***
|
***
|
|
VOLP03
|
-
|
***
|
***
|
***
|
|
VOLP32
|
|
**
|
***
|
***
|
|
YWLL02
|
|
|
**
|
**
|
** : P<0,05 *** : P<0,01 - : P>0,05
|
|
