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Caractérisation de la population des dromadaires (camelus dromedarius) en Tunisie

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par Mohamed OULD AHMED
Institut national agronomique de Tunisie - Doctorat d'univérsité  2009
  

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10.2.3- Flux des gènes

( 1 - FST )

=

m 4F ST

N

(17)

La différentiation génétique entre populations est favorisée par la dérive et limitée par les flux génétiques entre les populations. Le nombre de migrants effectifs par génération (Nm) est relié à la différentiation génétique FST par la relation (16). Ce paramètre a été calculé à l'aide du logiciel Genetix version 4.05.2 (Belkhir et al., 2004).

III- RESULTATS ET DISCUSSION

Cette étude s'inscrit dans le cadre de la caractérisation moléculaire de la population de dromadaires en Tunisie. Elle porte sur un ensemble de marqueurs microsatellites étudiés sur des individus échantillonnés et représentatifs de cette population dans les régions de l'étude.

1- Extraction, quantité et qualité de l'ADN

Une importante quantité d'ADN est en effet extraite. Afin d'évaluer la qualité de l'extraction le rapport R = DO260 /DO280 a été calculé, et les rapports ont été au voisinage de l'intervalle 1,7 et 2 ce qui indique une très bonne pureté de l'ADN. La qualité de l'ADN génomique a été aussi testée par électrophorèse sur gel d'agarose (0,8%) mis à migrer, pendant 1 heure et sous 120 voltes, avec un marqueur de taille permettant d'estimer le poids moléculaire de l'ADN, puis est visualisé lors d'une exposition aux rayons ultraviolets (UV). Signalons que le gel est traité par le Bromure d'Ethidium (BET) qui se fixe et s'intercale entre les brins de la molécule de l'ADN. Il a de plus la propriété de devenir fluorescent lorsqu'il est soumis aux UV. Le BET fixé sur l'ADN fluoresce en révélant l'ADN. Cette étape a permis de s'assurer de la présence de l'ADN. Un système de prise d'image (Transluminateur pourvu d'un appareil photo) connecté à un ordinateur permettant de réaliser une vue du gel.

2- Diversité génétique

2.1- Diversité génétique intra population 2.1.1- Fréquences alléliques

D'une manière générale, la distribution des allèles dont le nombre varie de 2 pour les loci CVRL02 et VOLP32 à 7 pour le locus VOLP03, il est assez identique dans la plus part des cas, les allèles les plus fréquents étant toujours les mêmes. C'est notamment le cas de l'allèle A qui apparaît souvent, sinon toujours le plus abondant dans les différents loci de toutes les populations étudiées. Les fréquences alléliques calculées pour chaque locus et chaque population varient de 0,017 pour plusieurs allèles dans quelques populations à 0,95 pour l'allèle A du CVRL02 au niveau de la population de Médenine. Le tableau 12 présente les fréquences et les tailles des allèles des différentes populations. Au niveau du locus CVRL02 qui compte deux allèles, la dominance de l'allèle A est assez remarquable et sa fréquence est supérieure à 0,850 dans toutes les populations. Quant à VOLP32, il exhibe deux allèles, qui ne sont présents que dans les populations de Médenine et de Tataouine. Ces

dernières régions sont géographiquement très proches l'une de l'autre. Le schéma de distribution de ces deux allèles présente une similarité dans les deux populations. La présence exclusive du locus YWLL02 avec ses 4 allèles chez la population de Tataouine a été notée, avec une légère différence des fréquences de ces 4 allèles en faveur de l'allèle C.

L'examen de des fréquences alléliques dans le tableau 12 permet d'identifier les allèles abondants dans chaque population, les allèles rares qui présentent des fréquences inférieures ou égales à 0,05 et les allèles privés ou spécifiques qui sont présents exclusivement dans une population.

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