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Cytotoxicité larvaire et activités antimicrobiennes des extraits de Adansonia digitata L., Tamarindus indica L. et de Acacia nilotica L. delile sur des souches microbiennes multirésistantes au Bénin


par Afoussatou AMADOU
Universite d'Abomey Calavi - Master en Microbiologie Moleculaire et medicale 2022
  

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2.3.3 Evaluation de l'activité antimicrobienne des extraits des plantes

Dans cette partie de l'étude, le profil de résistance aux antifongiquesdes souches cliniques isolées de prélèvements des sécrétions cervico-vaginales et des urines a été déterminé. Pour ce faire, les souches jeunes obtenues après culture de 24 h sur la gélose Potatose Dextrose Agar (PDA) ont été utilisées.

2.3.3.1. Confirmation des souches cliniques

Les souches présentant un profil de résistance aux antibiotiques ont été vérifiées à la biologie moléculaire pour la détermination des gènes de résistance ont été confirmées par des tests morphologiques (Gram contrôle) et des tests biochimiques de galerie de Leminor. Le profil de résistance des souches a été confirmé par la réalisation des tests l'antibiogramme avec les disques concernés.

L'identification des levures a été effectuée selon la méthode décrite par Ghaddar et al. (2020) et légèrement modifiée. Elle se base sur l'étude de l'aspect morphologique des souches à l'examen direct sur milieu gélosé et la recherche de la production de tube germinatif in vitro.

En effet, chaque isolat a d'abord été examiné à l'examen direct dans une solution physiologique entre lame et lamelle. Ensuite, le test de filamentation (test de blastèse) consistant à incuber l'isolat dans du sérum à 37 °C pendant trois (3 h) a été réalisé pour chaque isolat. Enfin, les aspects des colonies produites sur le milieu ChromAgar Candida (Conda, Espagne) couplés de la réduction du sel de Tétrazolium sur milieu Sabouraud au Tétrazolium (TRM ou Tetrazolium réduction Medium) ont été notés (Tableau XII) après 24 h à 48 h d'incubation à 37 °C.

Tableau XII : Aspects de souches de Candida sur milieu ChromAgar Candida (Conda, Espagne) et sur milieu TRM.

Espèces fongiques

Couleur au ChromAgar

Couleur au TRM

 
 
 

C. albicans

Vert clair

Rose pâle et luisant parfois à centre marron

C. glabrata

Rose luisant

Rose luisant (croissance lente)

C. krusei

Rose pâle à bord blanchâtre

Rose mât

C. parapsilosis

Beige ou jaunâtre

Rose violacé

 
 
 
2.3.3.2. Test d'activité antifongique des extraits de plantes

L'identification des extraits actifs a été faite par la méthode de diffusion en milieu solide selon Alsubhi et al. (2019) et la détermination des concentrations minimales inhibitrices (CMI) et fongicide (CMF) par la méthode de microdilution selon Lagane (2007).

Préparation des milieux de culture

La gélose PDA a été préparée, stérilisée, puis coulée dans les boîtes de Pétri.

Préparation des suspensions fongiques

Deux colonies moyennes de 24 h de la souche à tester ont été cultivées sur gélose PDA et prélevées et émulsionnées dans 5 ml de solution saline à 9 %o. Les suspensions fongiques ainsi préparées ont été ajustées à la densité 0,5Mc Farland correspondant à 1,5X105UFC/mL.

Préparation des dilutions d'extraits

100 mg de chaque extrait a été pesé et dissous complètement dans 1000 uL d'eau distillée stérile. La suspension ainsi préparée a ensuite été bien vortexée avant chaque utilisation.

Activité antifongique proprement dite

En effet, deux plaques gélosées de Potatose Dextrose Agar (PDA) ont été ensemencées avec la suspension fongique préparée pour chaque type d'extrait. Six puits de 7 mm de diamètre ont ensuite été réalisés de façon stérile dans les milieux gélosés à l'aide de pipette Pasteur. Les cinq puits périphériques ont servi de puits tests et le puits central utilisé pour le contrôle négatif. Ainsi, 100 uL de chaque extrait (Extraits aqueux ou hydro éthanolique) a été mis dans les puits et 100 uL de Clotrimazole (CLT) (100 ug/ml) dans les deux suivants dont un pour le témoin positif, puis 100 uL d'eau distillée dans le second puits contrôle négatif. Les plaques ainsi traitées ont été couvertes, laissées deux heures sur la paillasse puis incubées à 37 °C pendant 24 h. Les diamètres d'inhibition observés autour des puits après l'incubation ont ensuite été mesurés à l'aide d'un doubledécimètre pour chaque type d'extrait étudié. L'extrait le plus actif correspond à celui ayant présenté le plus grand diamètre d'inhibition.

La détermination des concentrations minimales inhibitrices (CMI) a été faite en milieu liquide selon Lavaee et al. (2019). Les tests ont été réalisés sur des dilutions successives (1/2?; 1/4?; 1/8?; 1/16?; et 1/32) d'extrait. 100 uL de chaque extrait dilué ont ensuite été déposés dans les puits réalisés sur la gélose PDA contenant la souche de 24H précédemment ensemencée. Après 45 min de diffusion sur paillasse, les boîtes de gélose ont été incubées à 37 °C pendant 24heures. Un témoin positif en remplacement de l'extrait au Clotrimazole (CLT) a été mélangé à l'inoculum fongique et pour le témoin négatif, seule l'eau distillée stérile a été mise en contact avec les puits. Cette partie de l'étude a été réalisée suivant la méthode appliquée par Lègba et al. (2017).

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"Je ne pense pas qu'un écrivain puisse avoir de profondes assises s'il n'a pas ressenti avec amertume les injustices de la société ou il vit"   Thomas Lanier dit Tennessie Williams