Memoire Online - Caracterisation genetique de glossina pallicera pallicera circulant dans le foyer de la maladie du sommeil de campo du sud forestier camerounais

Pour évaluer la similarité entre les espèces de glossines, un dendrogramme (contenant des bootsraps) a été construit. Ce dendrogramme regroupe les glossines en fonction des espèces (figue 19). Un total de 6 espèces a été analysé dans cette étude. Pour construire ce dendrogramme, nous avons regroupé les glossines en fonction des espèces. A la suite de ce regroupement, nous avons évalué les distances génétiques entre les espèces. Le dendrogramme résultant montre les distances génétiques entre les différentes espèces de glossines. Il ressort que les distances sont faibles entre G. p. palpalis et G. nigrofusca, G. fuscipes et G. p. pallicera. Par contre, ces distances génétiques sont élevées entre les autres espèces comme par exemple G. caligenea et toutes les autres espèces.

Caractérisation génétique de Glossina pallicera pallicera circulant dans le foyer de la maladie du sommeil de Campo du Sud forestier Camerounais rédigé par GOMSEU DJOUMSIE Emmanuel Boris

Figure 19: Dendrogramme illustrant les différences et les similarités génétiques entre les espèces de glossines.

Gpp : G. p. palpalis ; Gnigr : G. nigrofusca ; Gfus : G. fuscipes ; Gpal : G. p. pallicera ; Gmp : G. submorsitans ; Gcal : G. caligenea

Pour évaluer le niveau de polymorphisme génétique entre les populations de glossines, nous avons utilisé les génotypes multilocus pour caractériser chaque espèce. Par la suite, un dendrogramme de similarité a été construit à partir des données obtenues. Un total de 69 génotypes multilocus distincts a été identifié à partir des 72 échantillons examinés. Le dendrogramme généré indique un nombre important de génotypes différents (figure 20). Ce dendrogramme peut être subdivisé en quatre clusters : le premier cluster contenant 41 glossines dont la majorité appartenant à l'espèce G. p. pallicera provenant de Campo, deux G. p. palpalis de Rio Campo et G. fuscipes provenant de Bipindi. Le deuxième cluster, (contenant 10 échantillons) contient trois G. p. palpalis dont deux provenant de Campo et une autre de Fontem, deux G. caligenea de Campo, une G. nigrofusca provenant de Campo Beach et quatre G. p. pallicera de Campo. Le cluster 3 contient majoritairement l'espèce G. p. palpalis dont cinq provenant de Fontem et trois autres de Campo, une espèce G. submorsitans de l'Adamaoua. Le cluster 4 contient trois G. submorsitans provenant de l'Adamaoua et une G. caligenea provenant de Campo. Le Cluster 5 contient deux G. p. palpalis d'Edjabé et une G. p. pallicera provenant de Bipindi. D'une manière générale, on constate que les espèces de glossines sont isolées les unes des autres.

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Gmp : G. submorsitans Gpp : G. p. palpalis Gca : G. caligenea Gpa : G. p. pallicera Gni : G. nigrofusca Gfu : G. fuscipes Admw: Adamaoua Cmpo: Campo

Figure 20: Dendrogramme illustrant les différences et les similarités entre les populations de glossines

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Pour évaluer la structuration entre les différentes espèces de glossines étudiées, les valeurs de FST ont été déterminées entre elles (tableau 9). Ces valeurs de FST permettent d'estimer les différences génétiques entre les différentes populations de glossines. Lorsque les valeurs de FST sont proches ou égales à zéro, on conclut à une absence totale de structuration ; lorsqu'elles sont différentes de zéro, on conclut à une structuration de la population en sous populations. A la lumière de ces considérations, nous observons que toutes les valeurs de FST sont significatives entre G. p. pallicera et G. caligenea (0,1894), G. p. pallicera et G. p. palpalis (0,2006) ; G. p. pallicera et G. morsitans, G. p. palpalis et G. morsitans (0,2396).

Gpal : G. p. pallicera ; Gcal : G. caligenea ; Gpp : G. p. palpalis ; Gmp : G. submorsitans.

Pour évaluer la structuration entre les sous populations (ensemble des glossines du même village) de G. p. pallicera et de G. p. palpalis en fonction des villages (Campo, Edjabe, Fontem, Rio Campo), les valeurs de FST ont été calculées (tableaux 10 et 11). Ces valeurs sont faibles et non significatives entre les sous populations aussi bien pour G. p. pallicera que G. p. palpalis (tableaux 9 et 10).

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	Campo	Edjabe	Fontem	Rio Campo
Campo	0,0000	0,1195	0,0459	0,0277
Edjabe		0,0000	0,1009	0,0866
Fontem			0,0000	0,0464
Rio Campo				0,0000

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III.4.3. Différenciation génétique entre les populations