II- CADRE
MÉTHODOLOGIQUE
Cette section présente les sources de données,
les différents traitements de données et une analyse critique des
différentes sources de données.
II.1 Description des sources de
données
Les données proviennent de deux sources
principales : HEXAFLUX et ATB expression.
II.1.1 HEXAFLUX
HEXAFLUX est le logiciel de gestion de laboratoire qui permet
d'enregistrer toutes les demandes d'analyses ainsi que leurs résultats.
Pratiquement, voici le circuit d'une demande d'analyse :
· saisie de demande : il s'agit d'entrer dans le
logiciel les données démographiques et financières du
patient (assurance, mode de paiement...etc.), le médecin prescripteur,
les analyses prescrites par le médecin. Une fois la demande saisie elle
est disponible au niveau du laboratoire sous forme de feuille de
paillasse ;
· les feuilles de paillasse permettent au technicien de
savoir quelles sont les analyses à effectuer pour chaque
échantillon. Elles peuvent être paramétrées de
façon à regrouper les analyses ou des séries d'analyses.
Une fois l'analyse effectuée, le résultat est reporté sur
la feuille de paillasse ;
· à partir de la feuille de paillasse, les
résultats sont saisis dans le logiciel, par analyse, par demande, par
feuille de paillasse ;
· lorsque l'ensemble des résultats d'une demande
est saisi, le compte rendu est imprimé automatiquement, puis le dossier
est archivé (l'archivage des dossiers complets se fait chaque jour
à 23 heures). C'est l'ensemble des résultats archivés qui
constitue la base de données à partir de laquelle des
études peuvent être faites.
HEXAFLUX dispose de deux modules
épidémiologiques : le logiciel d'épidémiologie
et une station épidémiologie. Le module logiciel
d'épidémiologie qui permet de réaliser les fonctions de
programmation et de constitution d'une bibliothèque de requêtes,
d'extraction sélective de données, de formatage de données
extraites et sorties sur une imprimante du système central. Le module
station épidémiologie permet d'assurer la mise en forme
sophistiquée des données extraites par le module logiciel
épidémiologie. Ce logiciel fonctionne sur le système
d'exploitation UNIX.
II.1.2 ATB expression
L'ATB expression est un automate de lecture et
d'interprétation des antibiogrammes. Cet automate enregistre, imprime et
archive les résultats des antibiogrammes des patients du CPC.
Lorsqu'une culture d'urine est positive, un antibiogramme est
réalisé. Cet antibiogramme est lu par l'ATB expression
après enregistrement des données concernant le
prélèvement auquel appartient l'antibiogramme : Nom
prénom, Numéro d'analyse, type de prélèvement, type
d'antibiogramme.
Les archives de l'ATB constituent une base de données
à partir de laquelle nous avons pu extraire les fichiers concernant les
antibiogrammes d'ECBU.
Seul le personnel du CPC a accès à cet appareil.
De ce fait, nous avons reçu des antibiogrammes de notre encadreur sans
manipuler l'automate.
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