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Fouille de données biologiques. étude comparative et expérimentation.


par Abdelhak MANSOUL
Université Ahmed Ben Bella Oran 1, Algérie - Magister Informatique et Automatique 2010
  

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Chapitre IV : Conception et expérimentation du système BIODM - 65 -

(5) Classe ASSOCIATION_RULES _PROCEDURES

C'est la classe qui contient toutes les méthodes de production des règles d'association telles que la recherche des Itemsets, calcul de fréquence, calcul de support. Elle permet la recherche des règles d'association. Elle fait appel à ses propres méthodes et à celles stockées dans la classe DATA_BASE_PROCEDURES. Cette classe fait aussi appel à une méthode Visualisation_Regles, qui permet de présenter à l'utilisateur les règles d'association obtenues, sous une forme textuelle. Une possibilité de validation des règles est offerte à l'utilisateur, pour décider de sauvegarder son expérimentation ou pas.

(6) Classe DATA_BASE_PROCEDURES

Elle regroupe toutes les méthodes de gestion de la base de données telles que la création d'une connexion à la base de données, la fermeture de la connexion, lecture et écriture dans une table, et toutes les différentes requêtes.

(7) Classe GRAPHE_INDUCTION_CREATION

Elle permet de créer le graphe d'induction en utilisant les règles d'association transformées pour créer un graphe sur lequel se base la classe CELLULAR_RULES_GENERATION pour produire des règles cellulaires.

(8) Classe CELLULAR_RULE_ GENERATION

Elle permet de créer les règles cellulaires et de les intégrer dans la base de connaissances selon le formalisme expliqué auparavant. Elle contient toutes les méthodes de création des couches CELFAIT et CELREGLE.

(9) Classe SAVE_EXPERIMENT

Elle permet de sauvegarder les résultats de l'expérimentation, sous les formats appropriés pour chaque type de donnée à savoir le format texte et base de données. L'utilisateur aura ainsi la possibilité de visualiser les résultats de son expérimentation ultérieurement.

IV.4.3 L'interface

L'interface permet à l'utilisateur d'explorer les séquences de données biologiques manipulées ceci afin de lire directement les données sur une séquence choisie.

De plus, l'utilisateur a la possibilité d'expérimenter l'ECD sur les séquences qu'il aura bien avant sélectionnées, puis paramétrera son expérimentation à travers le support

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"Entre deux mots il faut choisir le moindre"   Paul Valery