Chapitre IV : Conception et expérimentation du
système BIODM - 66 -
et la confiance. Une fois l'expérimentation
réalisée, les résultats sont affichés pour une
interprétation possible par l'expert du domaine.
Figure 4.5 : Interface du système
BIODM.
IV.5 L'expérimentation
Nous avons implémenté l'algorithme
Apriori en langage JAVA sur une plate-forme Windows. Les tests
expérimentaux ont été conduits sur une machine Intel
Celeron CPU 540 à 186 GHz 512 Mo RAM. Pour examiner l'efficacité
pratique de notre algorithme, nous avons mené une sérié
d'expérimentations sur des données réelles, dont les
caractéristiques sont détaillées dans ce qui
suit.
La base de test
En se basant sur les souches complètement
annotées (voir Tableau 0.2), que nous avons
considérées comme souches échantillon, nous relevons le
nombre de gènes total par souches ainsi que les gènes constituant
l'échantillon de l'ECD sur le Tableau 4.1 et la Figure
4.6.
|
Souche
|
Nombre de
gènes existants
|
Nombre de gènes de
l'échantillon
expérimental
|
|
1
|
Mt CDC1551
|
4293
|
20
|
|
2
|
Mt F11
|
3998
|
20
|
|
3
|
Mt H37Ra
|
4084
|
20
|
|
4
|
Mt H37Rv
|
4048
|
20
|
Tableau 4.1 : Base de test servant à
l'expérimentation.
| 
