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Les bactéries hautement résistantes émergentes.


par BOUHAFS KHAWLA
Département de pharmacie faculté de médecine Constantine 3 - Docteur en pharmacie 2019
  

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Table des matières

Liste des figues Liste des tableaux

Liste des abréviations

? Introduction

..2

? La partie bibliographique

..4

Chapitre I : Les BHRe

6

I. Généralités et définitions :

6

II. Classification :

6

III. Les caractères bactériologiques :

7

III.1 Pour les entérobactéries :

7

III.1.1 Les caractères morphologiques :

7

III.1.2 Les caractères culturaux :

7

III.1.3 Les caractères biochimiques :

8

III.1.4 Les caractères antigéniques :

8

III.2 Pour les entérocoques :

9

III.2.1 Les caractères morphologiques :

9

III.2.2 Les caractères culturaux :

9

III.2.3 Les caractères biochimiques :

9

III.2.4 Les caractères antigéniques :

9

IV. Le pouvoir pathogène :

10

V. L'épidémiologie des BHRe

11

V.1 Les ERG:

11

V.1.1 Dans le monde:

11

V.1.1.1 Aux Etats Unis:

11

V.1.1.2 En Turquie:

12

V.1.1.3 En Europe: 12

V.1.1.4 En Algerie: 15

V.2 Les EPC: 16

V.2.1 KPC : 18

V.2.2 NDM: 19

V.2.3 OXA : 19

VI. Conduite à tenir : 20

VI.1 Pour les EPC : 21

VI.2 Pour les ERV : 21

VI.2.1 Mesures techniques : 22

VI.2.2 Mesures organisationnelles : 22

VI.2.3 Mesures administratives : 23

VI.3 Le rôle du laboratoire de microbiologie pour la détection des BHRe : 23

VI.4 Les stratégies recommandées par le haut conseil de santé : 24

Chapitre II : Les antibiotiques 26

I. Définition des antibiotiques : 26

II. Classification : 26

II.1 La nature chimique : 26

II.2 Le spectre antibactérien : 26

II.3 Les modalités d'action : 26

II.4 Le site d'action : Il est spécifique à chacun 27

II.4.1 Les antibiotiques agissent sur la paroi : 27

II.4.1.1 Les bétalactamines: 27

II.4.1.1.1 Les pénicillines : 27

II.4.1.1.2 Les céphalosporines 27

II.4.1.1.3 Les monobactames : 28

II.4.1.1.4 Les carbapénèmes : 28

II.4.1.2 Glycopeptides : 30

II.4.1.3 Fosfomycine :

 

32

II.4.2 Les antibiotiques inhibent la synthèse protéique :

 

32

II.4.2.1 Les aminosides :

 

32

II.4.2.2 Les tétracyclines :

 

32

II.4.2.3 Les phénicolés :

 

32

II.4.2.4 Les macrolides :

 

32

II.4.3 Les antibiotiques agissent sur les acides nucléiques :

 

32

II.4.3.1 Les sulfamides :

 

32

II.4.3.2 Les fluoroquinolones :

 

33

II.4.3.3 Les nitroimidazolés :

 

33

II.4.3.4 Rifamycine :

 

33

II.4.4 Les antibiotiques agissants sur la membrane :

 

33

II.4.4.1 Les polymyxines :

 

33

Chapitre III : La résistance bactérienne aux antibiotiques :

 

35

I .Définition de la résistance aux antibiotiques :

 

35

II .Types de résistance :

 

35

II.1 La résistance naturelle :

 

35

II.2 La résistance acquise :

 

35

III. Les mécanismes génétiques de la résistance aux antibiotiques :

 

36

III.1 La résistance chromosomique :

 

36

III.2 Résistance extra-chromosomique «évolution horizontale» :

 

36

IV. Les mécanismes biochimiques de la résistance aux antibiotiques

:

37

IV.1 Inactivation enzymatique :

 

37

IV.2 La modification de la cible de l'antibiotique :

 

37

IV.3 Diminution de la perméabilité :

 

38

IV.4 Excrétion de l'antibiotique par un mécanisme d'efflux :

 

38

V. Bêta lactamases :

 

38

V.1 Généralités sur les bêta-lactamases chez les entérobactéries :

 

38

V.2 Classification des bêta lactamase : 39

V.3 Les bêta-lactamases à spectre étendu (ESBL ou BLSE) : 39

V.4 Carbapénèmases: 39

V.4.1 Carbapénèmes : 39

V.4.2 Mécanisme de la résistance aux carbapénèmes : 40

VI. La résistance aux glycopeptides : 42

VI.1 Généralités sur les entérocoques résistants aux glycopeptides : 42

VI.2 Mécanismes de résistance aux glycopeptides : 43

? Partie pratique :

Chapitre I : Matériel et méthodes 47

I. Cadre d'études : 47

II. Matériel et méthodes : 47

II.1 Matériel : 47

II.2 Méthodes : 47

II.2.1 Modalités de collecte des données : 47

II.2.2 Méthodologie microbiologique : 47

II.2.2.1 Prélèvements : 47

II.2.2.2 Diagnostic microbiologique : 49

a. Examen macroscopique : 49

b. Examen microscopique : 49

c. La mise en culture et isolement : 50

d. L'identification : 50

e. L'antibiogramme : 54

Chapitre II : Résultats 61

I. Le taux d'isolement des BHRe : 61

II. Les données épidémiologiques : 62

II.1 Répartition des BHRe selon le sexe : 62

II.1.1 Les entérocoques résistants à la vancomycine : 62

II.1.2 Les entérobactéries résistantes aux carbapénèmes : 63

II.2 Répartition des BHRe selon le service d'hospitalisation : 64

II.2.1 Répartition des ERV selon le service d'hospitalisation : 64

II.2.2 Répartition des EPC selon les services d'hospitalisation : 66

II.3 Répartition des BHRe selon la nature du prélèvement : 68

II.3.1 Répartition des ERV selon la nature du prélèvement : 68

II.3.2 Répartition des EPC selon la nature du prélèvement : 70

II.4 Répartition des BHRe selon la fréquence d'isolement par mois : 72

II.4.1 Répartition des ERV selon la fréquence d'isolement par mois : 72

II.4.1 Répartition des EPC selon la fréquence d'isolement par mois : 74

III. Données microbiologiques : . ....76

III.1 Répartition des BHRe selon l'espèce : 76

III.1.1 Répartition des ERV selon l'espèce : 76

III.1.2 Répartition des EPC selon l'espèce : 77

III.2 La co-résistance aux antibiotiques : 79

III.2.1 La co-résistance des ERV aux antibiotiques : 76

III.2.2 La co-résistance des EPC aux antibiotiques : 81

III.2.3 Le niveau de résistance des EPC aux carbapénèmes : 83

Chapitre III : Discussion

I. Entérobactéries résistantes aux carbapénèmes : 86

II. Les entérocoques résistants à la vancomycine : 90

? Conclusion : 94

? Références bibliographiques : 96

? Annexes : 109

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