II.3.3. Perte par
dénitrification
La dénitrification est un processus de réduction
microbienne par le quel les nitrates (et accessoirement les nitrites) sont
réduit à l'état de produits gazeux (azote
moléculaire, les oxyde d'azote gazeux) qui sont ainsi perdus pour le
sol.
Il s'agit d'une succession de réductions des oxydes
d'azote (NO3-, NO2-,
N2O, NO) jusqu'au stade de l'azote moléculaire
(N2).
La dénitrification est effectuée par un nombre
restreint de genres bactériens (Pseudomonas, Agrobactérium,
Spirillum, Bacillus, bactéries hétérotrophes), il s'agit
de bactéries anaérobies très répandus dans les
sols, dont la présence n'est pas limitant.
Les étapes de la dénitrification sont
schématisées comme suit :
NO3- NAR NO2-
NIR NO NOR N2O
N2OR N2
Nitrate Nitrite Oxyde nitrique
Oxyde nitreux Azote Gazeux
Chaque étape est catalysée par une enzyme
spécifique: nitrate réductase (NAR), nitrite réductase
(NIR), oxyde nitrique réductase (NOR) et enfin oxyde nitreux
réductase (N2OR) (BOUGARD, 2004).
Les facteurs régulant ces transformations sont
(FERRUGIA, 2001) :
Ø La faible teneur du milieu en oxygène,
Ø La présence d'azote sous forme nitrique ou
nitreuse utilisée comme accepteur final d'électrons dans la
chaîne respiratoire à la place de l'oxygène manquant;
Ø La présence d'un substrat carboné
assimilable,
Ø Les conditions de pH : la dénitrification
maximale est atteinte entre 6 et 8, un pH plus acide entraînant un
dégagement important de protoxyde d'azote (N2O),
Ø La température, qui régule non
seulement les transformations décrites ci-dessus, mais également
les réactions consommatrices d'oxygène,
Ø La présence des substances donatrices
d'électrons en quantité suffisante (la matière organique
fraiche métabolisable),
Ø La teneur en eau élevée (sol pauvre en
O2 : anaérobie)
Ø La teneur en carbone organique élevée,
car les bactéries ont besoin du carbone organique pour leur
respiration.
Le phénomène de dénitrification n'est
plus possible dès que l'oxygène est disponible car, de
très nombreuses bactéries capables de "respiration nitrate" sont,
généralement, aussi capables de "respiration oxygène" et
elles s'abstiennent de respirer le nitrate dès que de l'oxygène
devient disponible, parce qu'il est énergétiquement plus rentable
de respirer sur l'oxygène que sur le nitrate.
A ces pertes, nous associons le phénomène
d'organisation de l'azote qui consiste à l'assimilation de
l'élément azote par les microorganismes du sol pendant
l'oxydation de substrats carbonés. Ce phénomène est aussi
appelé immobilisation, car les plantes étant moins
compétitrices que les microorganismes ne peuvent accéder a
l'azote incorporé dans la biomasse microbienne.
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