Chapitre 2 :Outils de
détection de la résistance bactérienne
1. Antibiogramme
C'est la méthode de référence pour la
détermination des phénotypes de résistance des
bactéries après isolement. Il peut se faire sur milieu
gélosé comme en milieu liquide (automatisé).
On distingue principalement 2 types sur milieu solide: la
diffusion en milieu gélosé et la méthode de gradient en
gélose (Etest).
La méthode en diffusion gélosée reste
largement utilisée et est basée sur la formation d'un gradient de
concentration en gélose de l'antibiotique (ATB) par diffusion radiale
à partir d'un disque imprégné de cet ATB et placé
sur gélose. Certains ATB diffusent mal en milieu gélosé et
le CA-SFMdéconseille la technique pour ces antibiotiques comme la
colistine, et la vancomycine (CA-SFM 2018).La méthode en diffusion
gélosée est applicable à la majorité des
bactéries. Il existe actuellement des systèmes de lecture
automatisée.
La méthode en gradient de concentration sur
gélose se fonde sur l'utilisation d'une bandelette au verso de laquelle
des spots en quantité croissante de l'ATB étudié sont
placés.Lorsque la bandelette est placée sur une gélose
préalablement ensemencée, un gradient continu d'ATB croissant du
bas vers le haut se crée. Après incubation, une zone d'inhibition
en forme d'ellipse est apparente permettant la lecture de la CMI à
l'intersection basse avec la bandelette. C'est une méthode
évaluée pour de nombreux ATB et largement utilisée au
laboratoire surtout quand la détermination de CMI est recommandée
(CA-SFM 2018).
2. Outils de détection
rapide
2.1 Tests
immunochromatographiques
Ce sont des tests qualitatifs rapides basés sur les
réactions antigènes-anticorps. On peut citer entre autres le test
Coris qui permet la détection des carbapénèmases (OXA
48/48 like, NDM, KPC et VIM) à partir des colonies, ainsi que le NG-Test
CTX-M MULTI pour la détection des BLSE type CTX-M qui sont les plus
répandues parmi les BLSE. Ce test permet la mise en évidence des
CTX-M des groupes 1, 2, 8, 9,25. La détection de la résistance
à la méticilline chez Staphylococcus aureus peut se
faire également par des tests immunochromatographiques qui mettent la
présence des PLP2a.
2.2 Tests
chromogéniques
Les tests chromogéniques les mieux connus sont des
tests complémentaires de l'antibiogramme pour rendre un résultat
fiable.Le plus utilisé est le test à la nitrocéfine, une
céphalosporine chromogène. La détection de production de
â-lactamase par un test chromogénique est recommandée par
le CA-SFM dès l'isolement de certaines bactéries comme
Haemophilus spp, Neisseria gonorrhoeae et Moraxella catarrhalis
(CA-SFM 2018).
Le â-LACTATM Test, basé sur
l'hydrolyse d'une céphalosporine chromogène (HMRZ-86) en
présence d'une â-lactamase. Ce testinitialement conçu pour
la détection de production de â-lactamasesur coloniea vu ses
applications dérivées à des produits pathologiques
notamment les hémoculturespositives et les culots urinaires.
La céphalosporine chromogène HMRZ-86 n'est pas
hydrolysée par lesâ-lactamases types SHV1 et TEM1, elle est
cependant sensible aux BLSE, carbapénèmases (KPC et MBLs) et aux
céphalosporinases acquises.
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