CONCLUSION
La résistance aux antibiotiques constitue un grand
enjeu de santé publique. La lutte contre la résistance
bactérienne implique nécessairement l'utilisation des outils de
diagnostic rapide.
Il ressort de cette étude que le panel Gram
négatif de ePlex® est bien adapté au diagnostic rapide des
entérobactéries et à l'identification des gènes de
résistance associés. Cette technique, entièrement
automatisée pourrait être d'un grand apport dans le diagnostic
rapide des ITU et des bactériémies surtout en période de
service à personnel réduit dans les hôpitaux. Toutefois, la
simplicité et le moindre coût des tests â-LACTATM
ainsi que des cassettes immunochromatographiques CTX-M MULTI font d'eux
des alternatives efficaces dans le diagnostic rapide des
entérobactéries productrices de BLSE. L'examen direct et la
culture demeurent indispensables pour l'amélioration de la
sensibilité et de la complémentarité de ces tests.
Recommandations
Ø Au chef de service de bactériologie de
l'hôpital Saint Louis de :
- Mettre à disposition des biologistes d'astreintes et
de gardes, l'automate ePlex® pour améliorer le diagnostic en
urgence des bactériémies et des ITU d'allures
sévères ;
- Améliorer le rendu des résultats des ECBU
à J0 en associant les cassettes CTX-M ou le â-LACTATM
test au service du jour.
Ø A tous les biologistes et techniciens de
laboratoire
Etendre les délais de lecture du
â-LACTATM test à 30 minutes pour le culot urinaire avec
considération de tout changement de coloration comme un résultat
positif.
Ø Aux autorités sanitaires du Burkina
Faso,
Intégrer les tests de diagnostic rapide de la
résistance bactérienne dans les laboratoires d'analyses
biomédicales.
Perspectives
Au vu des résultats de l'identification des
espèces à partir du culot urinaire, l'optimisation du
MALDI-TOF-MS pour l'identification des bactéries à partir des
urines sera envisagée à la suite de ce travail.
REFERENCES
BIBLIOGRAPHIQUES
1.Amzalag J, Mizrahi A, Naouri D, Nguyen JC, Ganansia
O, Le Monnier A. Optimization of the â LACTA
test for the detection of extended-spectrum- â
-lactamase-producing bacteria directly in urine samples. Infect
Dis.2016 ; 48 (9) : 695?8.
2. Bauernfeind A, Schweighart S, Grimm H. A
new plasmidiccefotaximase in a clinical isolate of Escherichia coli.
Infection. 1990 ; 18 (5) : 294?8.
3. Bonnet R. â-lactamines et
entérobactéries. In Antibiogramme, 3ème ed.,
ESKA. 2012: p 165-188.
4. Boutal H. Développement et
validation de tests de détection rapide de la résistance aux
antibiotiques.Thèse. Université Paris-Saclay, 2017 :245p.
5. Cantón R, Coque TM. The CTX-M
â-lactamase pandemic. Curr Opin Microbiol. 2006 ; 9 (5) :
466?75.
6. Caspar DY. Apports des panels BCID
à la prise en charge du sepsis. : RICAI 2017.
7. Chanal C, Bonnet R, De Champs C, Sirot D, Labia R,
Sirot J. Prevalence of â-lactamases among 1072 clinical strains
of Proteus mirabilis: 2 years survery in French hospital.
Antimicrob. Agents Chemother.2000. 44: 1930-1935.
8. Clark AE, Kaleta EJ, Arora A, Wolk DM.
Matrix-Assisted Laser Desorption Ionization-Time of Flight Mass Spectrometry: a
Fundamental Shift in the Routine Practice of Clinical Microbiology.
ClinicalMicrobiologyReviews. 2013;26(3):547-603.
9. Comité de l'Antibiogramme de la
Société Française de Microbiologie: Recommandations de
fevrier 2018.
10. Costelloe C, Metcalfe C, Lovering A, Mant D, Hay
AD. Effect of antibiotic prescribing in primary care on antimicrobial
resistance in individual patients : systematic review and meta-analysis.
BMJ. 2010 ; 340 : c2096?c2096.
11. Donhofer A, Franckenberg S, Wickles S,
Berninghausen O, Beckmann R, Wilson DN. Structural basis for
TetM-mediated tetracycline resistance. ProcNatlAcad Sci. 2012 ; 109
(42) :16900?5.
12. Dortet L, Poirel L, Nordmann P.
Épidémiologie, détection et identification des
entérobactéries productrices de
carbapénèmases Feuill De Biol. 2013.
13. Drawz SM, Bonomo RA. Three Decades of
-Lactamase Inhibitors. ClinMicrobiol Rev. 2010 ; 23 (1) : 160?201.
14. Ferreira L, Sanchez-Juanes F, Gonzalez-Avila M,
Cembrero-Fucinos D, Herrero-Hernandez A, Gonzalez-Buitrago JM, et
al., Direct Identification of Urinary Tract Pathogens from Urine
Samples by Matrix-Assisted Laser Desorption Ionization-Time of Flight Mass
Spectrometry. J ClinMicrobiol.2010 ; 48 (6) : 2110?5.
15. Ferreira L, Sánchez-Juanes F,
Muñoz-Bellido JL, González-Buitrago JM. Rapid method for
direct identification of bacteria in urine and blood culture samples by
matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry:
intact cell vs extraction method.ClinMicrobiol Infect.2011 ; 17 (7) :
1007?12.
16. Foxman B. Epidemiology of urinary tract
infections : incidence, morbidity, and economic costs. Am J Med. 2002
; 113 (1) : 5?13.
17. Gallah S, Decre D, Genel N, Arlet G. The
-Lacta Test for Direct Detection of Extended-Spectrum- -Lactamase-Producing
Enterobacteriaceae in Urine. J ClinMicrobiol. 2014 ; 52 (10)
: 3792?4.
18. Hailaji NSM, Ould Salem ML, Ghaber SM.La
sensibilité aux antibiotiques des bactéries uropathogènes
dans la ville de Nouakchott - Mauritanie. Prog En Urol.2016 ; 26 (6) :
346?52.
19. Harris P. Clinical Management of
Infections Caused by Enterobacteriaceae that Express Extended-Spectrum
â-Lactamase and AmpC Enzymes. SeminRespirCrit Care Med. 2015 ;
36 (01) : 056?73.
20. Hiramatsu K, Ito T, Tsubakishita S, Sasaki T,
Takeuchi F, Morimoto Y, et al., Genomic Basis for
Methicillin Resistance in Staphylococcus aureus. Infect
Chemother. 2013 ; 45 (2) :117.
21. Hooper DC. Fluoroquinolone resistance among Gram-positive
cocci. Lancet Infect Dis. 2002 ; 2 (9) : 530?8.
22. Karanika S, Karantanos T, Arvanitis M, Grigoras C,
Mylonakis E. Fecal Colonization With Extended-spectrum
Beta-lactamase-Producing Enterobacteriaceae and Risk Factors Among
Healthy Individuals: A Systematic Review and Metaanalysis. Clin Infect
Dis. 2016 ; 63 (3) : 310?8.
23. Kardaoe-Soma L. Coût de la
résistance bactérienne. la santé
publique.Séminaire DESC d'Infectiologie. 2017 :36.
24. Kliebe C, Nies BA, Meyer JF, Tolxdorff-Neutzling
RM, Wiedemann B. Evolution of plasmid-coded resistance to
broad-spectrum cephalosporins. Antimicrob Agents Chemother. 1985 ; 28
(2) : 302-307.
25. Kumar A, Roberts D, Wood KE, Light B, Parrillo JE,
Sharma S, et al., Duration of hypotension before initiation
of effective antimicrobial therapy is the critical determinant of survival in
human septic shock : Crit Care Med. 2006 ; 34 (6) : 1589?96.
26. Leclercq R. Mechanisms of resistance to
macrolides and lincosamides: nature of the resistance elements and their
clinical implications. Clin Infect Dis. 2002 ; 34 (4) : 482-492.
27. Mainardi J-L, Compain F, Bensekhri H, Lavollay M,
Rostane H. â LACTA test for rapid detection of
Enterobacteriaceae resistant to third-generation cephalosporins from
positive blood cultures using briefly incubated solid medium cultures.
Journal of Medical Microbiology. 2015;64(10):1256-9.
28. Melzer M, Petersen I. Mortality following
bacteraemic infection caused by extended spectrum beta-lactamase (ESBL)
producing E. coli compared to non-ESBL producing E. coli.
J Infect. 2007 ; 55 (3) : 254?9.
29. Merisier S. Le médecin
généraliste et les infections urinaires basses communautaires
(cystites simples), chez la femme de 15 à 75 ans : évaluation des
pratiques professionnelles en fonction des nouvelles recommandations du SPILF
de juin 2014. 2017 ; 85.
30. Mizrahi A, Amzalag J, Couzigou C, Péan De
Ponfilly G, Pilmis B, Le Monnier A. Clinical impact of rapid bacterial
identification by MALDI-TOF MS combined with the bêta-LACTATM
test on early antibiotic adaptation by an antimicrobial stewardship team in
bloodstream infections. Infectious Diseases. 2018;50(9):668-77.
31. Munita JM, Arias CA. Mechanisms of
Antibiotic Resistance. In : Kudva IT, Cornick NA, Plummer PJ, Zhang Q,
Nicholson TL, Bannantine JP, et al., Editeurs. Virulence Mechanisms
of Bacterial Pathogens, Fifth Edition. Am Society of Microbiol; 2016 ;
481?511
32. Naber KG, Schito G, Botto H, Palou J, Mazzei
T. Surveillance Study in Europe and Brazil on Clinical Aspects and
Antimicrobial Resistance Epidemiology in Females with Cystitis (ARESC):
Implications for Empiric Therapy. EurUrol. 2008;54 (5):1164?78.
33. Netgen. Que signifie
«?bêtalactamases à spectre élargi?» en pratique ?
Rev Med Suisse. - www.revmed.ch - 2009.
34. Nijssen S, Florijn A, Bonten MJM, Schmitz FJ,
Verhoef J, Fluit AC. Beta-lactam susceptibilities and prevalence of
ESBL-producing isolates among more than 5000 European Enterobacteriaceae
isolates. Int J Antimicrob Agents. 2004 ; 24 (6) : 585?91.
35. Ouedraogo A-S. Prévalence,
circulation et caractérisation des bactéries
multirésistantes au Burkina Faso. Thèse, Université de
MONTPELLIER 2017 :191p.
36. Pagès J-M, James CE, Winterhalter
M. The porin and the permeating antibiotic : a selective diffusion
barrier in Gram-negative bacteria. Nat Rev Microbiol. 2008 ; 6 (12) :
893?903.
37. Papp-Wallace KM, Bethel CR, Distler AM, Kasuboski
C, Taracila M, Bonomo RA. Inhibitor Resistance in the
KPC-â-Lactamase, a Preeminent Property of This Class A â-Lactamase.
Antimicrob Agents Chemother. 2010 ; 54 (2) : 890?7.
38.Paterson DL, Bonomo RA. Extended-Spectrum
â-Lactamases : a Clinical Update. ClinMicrobiol Rev. 2005 ; 18
(4) : 657?86.
39. Peralta G, Lamelo M, Álvarez-García
P, Velasco M, Delgado A, Horcajada JP, et al., Impact of
empirical treatment in extended-spectrum beta-lactamase-producing
Escherichia coli and Klebsiella spp. bacteremia. A
multicentric cohort study. BMC Infect Dis. 2012; 12 (1).
40. Poole K. Efflux-mediated antimicrobial
resistance. J AntimicrobChemother. 2005 ; 56 (1) : 20?51.
41. Queenan AM, Bush K. Carbapenemases: the
Versatile -Lactamases. Clin MicrobiolRev. 2007 ; 20 (3) : 440?58.
42. Ruppé E.
Épidémiologie des bêta-lactamases à spectre
élargi?: l'avènement des CTX-M. Antibiotiques. 2010 ; 12
(1) : 3?16.
43. Sarkis P, Assaf J, Sarkis J, Zanaty M, Rehban
R. Profil de résistance aux antibiotiques dans les infections
urinaires communautaires au Liban. Prog En Urol. 2017 ; 27 (13) : 727.
44. Sbiti M, Lahmadi khalid, louzi L. Profil
épidémiologique des entérobactéries
uropathogènes productrices de bêta-lactamases à
spectre élargi. Pan Afr Med J. 2017 ; 28.
45. Schwaber MJ, Carmeli Y. Mortality and
delay in effective therapy associated with extended-spectrum -lactamase
production in Enterobacteriaceae bacteraemia: a systematic review and
meta-analysis. J AntimicrobChemother. 2007 ; 60 (5) : 913?20.
46. Sirot D, Sirot J, Labia R, Morand A, Courvalin P,
Darfeuille-Michaud A, et al., Transferable resistance to
third-generation cephalosporins in clinical isolates of Klebsiella
pneumoniae?: identification of CTX-1, a novel â-lactamase. J
AntimicrobChemother. 1987 ; 20 (3) : 323?34.
47. Strahilevitz J, Jacoby GA, Hooper DC, Robicsek
A. Plasmid-Mediated Quinolone Resistance : A multifaceted Threat.
ClinMicrobiol Rev. 2009 ; 22 (4) : 664?89.
48. The-War-on-Drug-Resistance_PPC-Fall-2017. Disponible sur :
https://genmarkdx.com/wp-content/uploads/2018/06/.
49. Walewski V, Podglajen I, Lefeuvre P, Dutasta F,
Neuschwander A, Tilouche L, et al. Early detection with the
â-LACTATM test of extended-spectrum
â-lactamase-producing Enterobacteriaceae in blood cultures.
Diagnostic Microbiology and Infectious Disease. 2015;83(3):216-8.
50. Woerther P-L, Burdet C, Chachaty E, Andremont
A. Trends in Human Fecal Carriage of Extended-Spectrum
â-Lactamases in the Community : Toward the Globalization of CTX-M.
ClinMicrobiol Rev. 2013 ; 26 (4) : 744?58.
51. Yasufuku T, Shigemura K, Shirakawa T, Matsumoto M,
Nakano Y, Tanaka K, et al., Correlation of
Overexpression of Efflux Pump Genes with Antibiotic Resistance in
Escherichia coli Strains Clinically Isolated from Urinary Tract
Infection Patients. J Clin Microbiol. 2011 ; 49 (1) :189?94
|