INTRODUCTION GENERALE
Parmi les Prunus l'abricotier est une espèce
présente dans des régions très variées, des
régions froides et humides d'Amérique du Nord aux régions
chaudes et sèches du Maghreb. Cependant, des contraintes biotiques et
abiotiques contraignent la culture dans des zones très limitées
où les panels variétaux restent restreints, tel est le cas en
France et notamment dans la vallée du Rhône. Le
dépérissement bactérien causé par Pseudomonas
syringae fait partie des contraintes biotiques majeures pour la culture
qui s'expriment préférentiellement en zone à hiver
froid.
Pour pallier les problèmes de la culture et donner la
possibilité d'un élargissement du panel variétal, l'INRA a
initié un programme d'amélioration génétique depuis
40 ans, il s'est intensifié depuis les années 1980. Dans un
premier temps son objectif était d'implémenter les gammes
variétales afin d'étendre la période de production vers la
précocité et la tardiveté, d'assurer une bonne
qualité organoleptique et technique en termes de présentation
(calibre, couleur), de saveur, d'arôme, d'évolution après
récolte et de résistance au transport. Aujourd'hui les enjeux de
durabilité du verger en lien notamment avec les contraintes
phytosanitaires conduisent à prioriser la sélection des
variétés résistantes aux parasites majeurs de la culture;
le chancre bactérien, la sharka, le monilia et l'enroulement
chlorotique.
C'est dans ce contexte que se situe ce projet dans lequel nous
nous proposons d'étudier l'hérédité du
caractère de résistance au dépérissement
bactérien en axant notre travail sur le comportement de descendances
biparentales issues de géniteurs aux comportements contrastés
(sensibles et résistants), relativement aux parents, ainsi que sur le
comportement d'une collection de ressources génétiques. Tout
l'enjeu et la difficulté de cette approche réside dans le fait de
disposer de méthodes d'évaluation phénotypiques
précises, discriminantes et reproductibles, sans perdre de vue que les
paramètres sont liés à des phénomènes
biologiques complexes, méconnus et fortement influencés par les
conditions climatiques. Pour ceci, un protocole d'inoculation et de
phénotypage a été développé en exploitant
les résultats des travaux antérieurs réalisés en
conditions de contrôlées en verger. Sur ces bases notre projet
s'est consacré à l'étude de la variabilité
génétique de la sensibilité de l'abricotier aux
Pseudomonas au sein de
Mlle HADJ BRAHIM Mouna INTRODUCTION GENERALE
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descendances hybrides en ségrégation et dans une
collection de ressources génétiques. Deux
mécanismes ont été abordés : la réaction
tissulaire de rameaux en lien avec les mécanismes de vascularisation, et
les réactions locales suite à des lésions locales sur
limbes. Puis, les données de phénotypage acquises ont
étés mises en relation avec les données de
génotypage disponibles afin d'identifier les régions du
génome concernées. Si ces approches devaient être
concluantes, elles devraient permettre de déployer une stratégie
de Sélection Assistée par Marqueurs et d'augmenter ainsi
l'efficacité des programmes de sélection.
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