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Recherche et validation de résistance génétique au dépérissement bactérien causé par pseudomonas syringae chez l'abricotier.

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par MOUNA HADJ BRAHIM
Institut Agronomique Méditerranéen de Saragosse Espagne - Master amélioration génétique végétale 2014
  

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LISTE DES FIGURES

Pages

Figure 1: Cycle biologique de P.s percicae sur pêcher (Gaignard and Luisetti, 1993) 10

Figure 2: Le modèle de résistance Zig-zag d'après (Jones and Dangl, 2006) 21

Figure 3: Evènement précoces suite à la reconnaissance spécifique 27

Figure 4: Représentation synthétique des données de sensibilité tissulaire mesurées sur rameaux suite à une inoculation bactérienne - ACP des variables mesurées en 2013 et 2014 sur rameaux au sein de la population BerBa (moyennes par individus des 5

rameaux, 211 individus. 42

Figure 5: Représentation synthétique des données de sensibilité tissulaire mesurées sur rameaux suite à une inoculation bactérienne - ACP des variables mesurées en 2013 et 2014 sur rameaux au sein de la core-collection (moyennes par individus des 3 rameaux,

129 individus). 47

Figure 6: Représentation synthétique des données de sensibilité bactérienne mesurées sur feuilles suite à une inoculation bactérienne - ACP des variables mesurées en 2013 et 2014 sur feuilles au sein de GoMo (moyennes de 4 feuilles x 4 rameaux par individus).

52

Figure 7: Représentation synthétique des données de sensibilité bactérienne sur feuilles - ACP sur l'ensemble des variables mesurées sur feuilles sur la core-collection (125

individus) en 2013 et 2014. 56

Mlle HADJ BRAHIM Mouna LISTE DES ABREVIATIONS

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LISTE DES ABREVIATIONS

ABRIWG : projet ANR de génomique comparative et fonctionnelle de la résistance à la sharka et des besoins en froid chez les arbres fruitiers à noyaux.

ACP : Analyse en Composantes Principales

BerBa : population biparentale Bergeron x Bakour

bi : mesure de brunissement interne des rameaux

bs : mesure de brunissement superficiel des rameaux

CribMoy : note de criblure moyenne des symptômes observés sur feuilles obtenue à partir des notations de 0 à 3 sur feuilles.

CribRegLog : note de criblure observée sur feuilles obtenue à l'aide du modèle de régression logistique multinomiale basé sur les notes de criblure de 0 à 3.

DL : déséquilibre de liaison: association non aléatoire entre des allèles à des loci différents

FDR : False Discovory Rate - Taux de fausses découvertes

GLM : General Linear model - Modèle linéaire généralisé GoMo : population biparentale Goldrich x Moniqui

GxE: interaction entre génotype et environnement

HR: Réaction d'hypersensibilité

lgc : longueur du chancre apparente

lge : longueur de blessure ouverte issue de l'entaille. Mesure la lésion corticale ouverte

à l'extérieur.

Ln : transformation par logarithme népérien de la variable

Mlle HADJ BRAHIM Mouna LISTE DES ABREVIATIONS

MLM: Mixed Linear Model - modèle linéaire Mixte

P.s: Pseudomonas syringae

Pseudo-F1: 1ère génération issue de parents qui ne sont pas des lignées pures

Psm: Pseudomonas syringae pv. morsponorum Pss : Pseudomonas syringae pv. syringae

RG: Ressource Génétique

RLM : Régression Linéaire Multinomiale SAM: Sélection Assistée par Marqueurs

SevMed : note de sévérité des symptômes observés sur feuilles reflétant le pourcentage de nécrose réel, basé sur une moyenne de la médiane des classes représentées par les notes de sévérité de 0 à 5.

SevMoy : note de sévérité moyenne des symptômes observés sur feuilles obtenue à partir des notations de 0 à 5.

SevRegLog : note de sévérité observée sur feuilles obtenue à l'aide du modèle de régression logistique multinomiale basé sur les notes de sévérité de 0 à 5.

SNP: Single Nucleotide Polymorphism

xi

SSR: Single Sequence Repeat

Mlle HADJ BRAHIM Mouna INTRODUCTION GENERALE

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"Qui vit sans folie n'est pas si sage qu'il croit."   La Rochefoucault