1.2.2 Caractérisation de la sensibilité
observée au sein de la core-collection :
Les distributions des symptômes au sein de la
core-collection constituée de 125 individus peuvent être
visualisées dans le tableau ci-dessous.
Tableau 15: Distribution des notes de
sévérité des symptômes sur feuilles observées
après inoculation au sein de la core-collection en 2013 et 2014
Ces distributions montrent clairement une variabilité
de comportement au sein de la core-collection sous forme de distributions
continues. Les moyennes brutes par classes `SevMoy' montrent une
majorité d'individus répartis entre les notes 0,5 et 1,25 pour
les deux années. La note de sévérité médiane
se caractérise par un grand nombre d'individus moyennement à peu
touchés aussi bien en 2013 qu'en 2014. En ce qui concerne la criblure,
les distributions montrent un grand nombre d'individus avec des valeurs faibles
en 2014 par rapport à 2013. Ainsi pour toutes les variables, les
symptômes observés en 2014 ont été moins intenses.
L'ACP (figure 7) illustre cette diversité génétique,
caractérisée par une grande capacité de recombinaisons
entre les variables observées et par une influence majeure de
l'année sur les variables observées. Les relations entre
variables restituées par la matrice de corrélation (tableau 16)
rendent
Mlle HADJ BRAHIM Mouna RESULTATS ET DISCUSSION
55
compte de liaisons étroites entre variables d'une
même année et entre la sévérité et la
criblure.
Tableau 16: Matrice de coefficient de
corrélation de Pearson entre les variables mesurées sur
feuilles
dans la core-collection en 2013 et 2014.
|
Variables
|
sevmoy14
|
sevmed14
|
cribmoy14
|
sevmoy13
|
sevmed13
|
cribmoy13
|
|
sevmoy14
|
1
|
|
|
|
|
|
|
sevmed14
|
0,977
|
1
|
|
|
|
|
|
cribmoy14
|
0,930
|
0,927
|
1
|
|
|
|
|
sevmoy13
|
0,135
|
0,153
|
0,177
|
1
|
|
|
|
sevmed13
|
0,134
|
0,157
|
0,180
|
0,987
|
1
|
|
|
cribmoy13
|
0,052
|
0,022
|
0,110
|
0,459
|
0,451
|
1
|
*La couleur rose indique la forte corrélation entre les
variables d'une même année et la couleur bleu indique les faibles
corrélations entre variables d'une année à l'autre.
Les chiffres 13 et 14 : indique l'année 2013 et 2014.
Les résultats mettent en évidence l'effet du
génotype, de l'année et les interactions GxE au sein de la
core-collection. Elles ont été réalisées sur les 4
répétitions des valeurs brutes de la
sévérité et de la criblure (tableau 17).
Par opposition avec ce qui a été observé
pour la descendance biparentale, le modèle utilisé a
montré un effet génotype et un effet taille des feuilles
significatif pour les deux années dont nous pouvons imaginer qu'il peut
être lié notamment à une variabilité des tailles de
limbes bien plus importante au sein de la collection par rapport à la
descendance.
Mlle HADJ BRAHIM Mouna RESULTATS ET
DISCUSSION
F2 (35,21 %)
-2
-4
-6
-8
4
6
2
0
8
-10 -8 -6 -4 -2 0 2 4 6
08
48
42 2219
1314 458965 4586
21 2089
396 2734
471 236 294 804 2894 053
2928
4811 4516 489 3516 2243
0039 2892 382 2361
030 0074
017 000
506 1330 0804
2715 0660 2204
1267 1343 1236 956
129
38653902 384
4415
2346
4423 4166 sevmed14
2348
4445 2267 0665 sevmoy14 0882
0500 1145
2312
215 241
2311 265
2184
2669 2662 2712
3521 3522 cribmoy14
2330 2335
2358 3518 0076 1793
0682 0862
0380 2129
0008
2458 2635
065 4294 3845sevmed13
171 2218 1693
4373 sevmoy13
4322 1809
3698 3511
cribmoy13
324 2485 1727
4167 4079 4449
2128 2481
3862 4576 1939
2 2490 0634
9 4360
340 843 2755
3512 406 183 56
2205 517
30
010 170
1453
1814
2217
2067 3950
Biplot (axes F1 et F2 : 86,65 %)
F1 (51,43 %)
2343 3509 4316 179 2212
1524374
4034
8 10 12
F2 (35,21 %)
-0,25
-0,75
0,75
0,25
-0,5
0,5
-1
0
1
-1 -0,75 -0,5 -0,25 0 0,25
Variables (axes F1 et F2 : 86,65 %)
F1 (51,43 %)
sevmoy13 sevmed13 icribmoy13
0,5 0,75 1
cribmoy14
sevmoy14 sevmed14
56
Figure 7: Représentation synthétique des
données de sensibilité bactérienne sur feuilles - ACP sur
l'ensemble des variables mesurées sur feuilles sur la core-collection
(125 individus) en 2013 et 2014.
A: nuage des individus selon les 2 axes
principaux.
B: représentation des variables selon les 2
axes principaux.
57
Mlle HADJ BRAHIM Mouna RESULTATS ET DISCUSSION
Tableau 17: Synthèse des analyses
statistiques effectuées suite aux inoculations des feuilles au sein de
la core-collection en 2013 et 2014.
|
Variables
|
2013
|
2014
|
2013 et 2014
|
|
sévérité
|
criblure
|
sévérité
|
criblure
|
sévérité
|
criblure
|
|
Effet de l'année
|
_
|
_
|
_
|
_
|
2,2e-16
|
0,515
|
|
Effet du génotype
|
2,2e-16
|
2,2e-16
|
2,2e-16
|
2,2e-16
|
1,597e-15
|
7,468e-10
|
|
Effet interactions GxE (Génotype x Année)
|
_
|
_
|
_
|
_
|
5,043e-08
|
3,365e-06
|
|
Distribution normale
(shapiro)
|
oui
|
oui
|
oui
|
oui
|
_
|
_
|
|
Effet taille des
feuilles
|
4,93e-05
|
5,826e-07
|
0,0104
|
7,46e-05
|
_
|
_
|
|
Homoscedasticité %
an (Fligner-Killeen)
|
_
|
_
|
_
|
_
|
0,1196
|
2,2e-16
|
|
Homoscedasticité %
génotype
(Fligner-
Killeen)
|
9,085e-05
|
2,2e-16
|
2,2e-16
|
2,2e-16
|
_
|
_
|
|
R2 du modèle
|
0,556
|
0,596
|
0,0204
|
0,0275
|
0,511
|
0,41
|
|
Comparaison %
témoin (wilcoxon)
|
2,2e-16
|
2,2e-16
|
2,2e-16
|
2,2e-16
|
_
|
_
|
% : par rapport à.
Mlle HADJ BRAHIM Mouna RESULTATS ET DISCUSSION
58
Mlle HADJ BRAHIM Mouna RESULTATS ET DISCUSSION
|
|
