1.2 Analyses des réactions aux inoculations sur
feuilles
1.2.1 Caractérisation de la sensibilité
de la population biparentale GoMo
Les distributions des notes de sévérité
au sein de la population biparentale (tableau 12) traduisent l'existence d'une
variabilité de réaction au sein de la population, validée
statistiquement. En effet, les analyses statistiques (tableau 14) traduisent
une différence de sensibilité d'origine génétique.
Les variables SevRegLog et CribRegLog issues du modèle de
régressions logistique ont permis de discriminer les hybrides en deux
classes résistant/sensible confirmées par le test chi2 (p-value
< 2,2e-16). Cependant, la comparaison des deux parents ne montre
pas de différence significative entre eux.
Tableau 12: Distribution des notes de
sévérité des symptômes sur feuilles observées
après inoculations au sein de la population hybride Goldrich x Moniqui.
Les distributions portent sur les moyennes de 4 feuilles x 4 rameaux par
individus.
Mlle HADJ BRAHIM Mouna RESULTATS ET DISCUSSION
51
Un fort effet environnement a été observé
dans nos mesures, traduit par l'effet année en interaction avec le
génotype sur les variables sévérité et criblure qui
s'explique par des conditions de printemps humide particulièrement en
2013 favorables au développement des symptômes.
Le modèle explique une bonne partie de la
variabilité. Pour la sévérité, 42% de la
variabilité est expliqué par les effets génotype,
année et leur interaction, de même pour la criblure avec 43% de la
variabilité expliquée par le modèle. Comme
précédemment, dans le cas du diamètre avec les mesures sur
rameaux, nous nous sommes interrogés sur l'influence de la taille des
feuilles sur l'intensité des symptômes observés, les
résultats traduisent une relative indépendance avec les variables
sévérité et criblure.
La ségrégation du caractère
résistance à la criblure au sein de la population hybride a
été complétée par l'étude des
corrélations (tableau 13) entre les variables afin d'appréhender
le degré de liaison existant entre elles. L'ACP réalisée
sur les jeux de données 2013 et 2014 traduit un effet année
(figure 6) et une représentation continue des individus au sein de la
population hybride.
Tableau 13: Matrice de corrélation de
Pearson entre les variables mesurées sur feuilles dans la population
GoMo en 2013 et 2014.
|
Variables
|
SevMoy14
|
SevMed14
|
Cribreglog14
|
sevmoy13
|
sevmed13
|
sevreglog13
|
cribReglog2013
|
|
SevMoy14
|
1
|
|
|
|
|
|
|
|
SevMed14
|
0,815
|
1
|
|
|
|
|
|
|
Cribreglog14
|
0,631
|
0,474
|
1
|
|
|
|
|
|
sevmoy13
|
0,227
|
0,255
|
0,166
|
1
|
|
|
|
|
sevmed13
|
0,184
|
0,255
|
0,166
|
0,918
|
1
|
|
|
|
sevreglog13
|
0,252
|
0,209
|
0,206
|
0,748
|
0,578
|
1
|
|
|
cribReglog2013
|
0,174
|
0,265
|
0,135
|
0,586
|
0,488
|
0,620
|
1
|
*La couleur rose indique la forte corrélation entre les
variables et la couleur bleu indique les faibles corrélations entre
variables d'une année à l'autre. Les chiffres 13 et 14 :
indique l'année 2013 et 2014.
Mlle HADJ BRAHIM Mouna RESULTATS ET
DISCUSSION
F2 (26,26 %)
-1
-2
-3
-4
-5
4
5
3
2
0
1
-6 -5 -4 -3
A52 A11A16
A23 A13
A05 A39 A09
A17 A43 A36 A12
A14 A08
A28 A34 A26 A32
A24
A48 A29 A45
A25
-2 -1 0 1 2 3 4
F1 (49,16 %)
A18
A0
A5 A0
Biplot (axes F1 et F2 : 75,42 %)
3 A31
A19
A41
A44
A27
A20
61A47
A35
A02
A53
A10 A15
A37
A50
A38
A40
A4
6 SevMoy14
A04
A30
SevMed14 Cribreglog14
cribReglog2013 sevmed13 sevreglog13 sevmoy13
A49
A07
A33
5 6 7
F2 (26,26 %)
-0,25
-0,75
0,75
0,25
-0,5
0,5
-1
0
1
-1 -0,75 -0,5 -0,25 0 0,25 0,5 0,75 1
Variables (axes F1 et F2 : 75,42 %)
F1 (49,16 %)
SevMoy14 Cribrglog14 SevMed14
sevreglo
sevme
sevmo
13
13
52
Figure 6: Représentation synthétique des
données de sensibilité bactérienne mesurées sur
feuilles suite à une inoculation bactérienne - ACP des variables
mesurées en 2013 et 2014 sur feuilles au sein de GoMo (moyennes de 4
feuilles x 4 rameaux par individus).
A : nuage des individus (moyennes sur 4 x 4
répétitions) sur les deux axes principaux. B :
représentation des variables mesurées en 2013 et en
2014.
53
Mlle HADJ BRAHIM Mouna RESULTATS ET DISCUSSION
Tableau 14: Synthèse des analyses
statistiques effectuées suite aux inoculations sur feuilles au sein de
la population GoMo en 2013 et 2014.
|
Variables
|
2013
|
2014
|
2013 et 2014
|
|
sévérité
|
criblure
|
sévérité
|
criblure
|
sévérité
|
criblure
|
|
Effet de l'année
|
_
|
_
|
_
|
_
|
2,948e-07
|
1,179e-08
|
|
Effet du génotype
|
2,2e-16
|
2,2e-16
|
2,2e-16
|
2,2e-16
|
2,2e-16
|
2,2e-16
|
|
Effet interactions GxE
(Génotype x Année)
|
_
|
_
|
_
|
_
|
6,355e-06
|
3,311e-05
|
|
Distribution normale
(shapiro)
|
non
|
non
|
oui
|
non
|
_
|
_
|
|
Effet taille des feuilles
|
2,2e-16
|
NS
|
NS
|
NS
|
_
|
_
|
|
R2 du modèle
|
0,4536
|
0,4371
|
0,5879
|
0,4828
|
0,4217
|
0,4358
|
|
Comparaison % témoin
(wilcoxon)
|
2,2 e-16
|
2,2 e-16
|
2,2 e-16
|
2,2 e-16
|
_
|
_
|
|
Différence entre parents
(wilcoxon)
|
0,140
|
0,686
|
0,375
|
0,39
|
_
|
_
|
|
Moyenne des individus
|
1,05#177;0,872
|
0,78#177;0,57
|
1,28#177;0,54
|
0,62#177;0,40
|
_
|
_
|
NS :non significatif, les symboles, % : par rapport à
; #177; indique l'écart-type.
Mlle HADJ BRAHIM Mouna RESULTATS ET DISCUSSION
54
|
|
