1.1.2 Caractérisation de la sensibilité
des variétés de la - core-collection
Les distributions (tableau 9) sont
caractérisées par des variations continues. Et une large
variabilité pour les différentes variables, à l'exclusion
de la variable bi en 2014 concentrée autour de valeurs
nulles.
Tableau 9: Distribution de l'intensité des
symptômes de sensibilité de la core-collection (129 individus)
suite à une inoculation bactérienne mesurés sur rameaux en
2013 et 2014. Les distributions portent sur les moyennes de 3 rameaux
testés par individu. Mesures en centimètres.
Mlle HADJ BRAHIM Mouna RESULTATS ET DISCUSSION
46
Comme précédemment, une ACP a été
réalisée pour illustrer l'étendue de la diversité
mise en évidence sur les données de sensibilité tissulaire
mesurée sur les rameaux. Les deux axes principaux de l'ACP qui
représentent la majeure partie de la variabilité (48,7%),
montrent que:
- Toutes les variables sont bien représentées
dans ce plan factoriel puisque leurs corrélations avec les axes sont
importantes (les projections sont proches du cercle de corrélation)
(figure 5b).
- Une corrélation des variables entre elles selon les
années, et la relative indépendance des variables de brunissement
(bi, bs) et des variables liées aux longueurs de chancre (lgc, lge).
- Une large variabilité des individus
représentée par un nuage des individus étendu et continu
illustrant l'effet variété (génotype) sur la
résistance des rameaux, les variétés les plus sensibles
étant sur la partie droite du graphe (figure 5a).
Mlle HADJ BRAHIM Mouna RESULTATS ET
DISCUSSION
F2 (16,90 %)
-2
-4
-6
4
6
2
0
-8 -6 -4 -2 0 2 4
1'93
A195& eu m666
A1314A0 55 A213~,Y~A
89E
A1236
1
Biplot (axes F1 et F2 : 49,09 %)
A1731 A1714
A1939
00 A1267 A2219 A1811 665
F1 (32,19 %)
bs2014 A0862 A1693
A1343
2
A0539 bi213 A2217 bi2014
bs2013 A1915
lgc2014
A2205A2243
A1729
lge2014 A0544
A0634lgc2013
lge2013
A2204
A0882
A1453
A0380
A0654
A1711
A1727
6 8
F2 (16,90 %)
-0,25
-0,75
0,75
0,25
-0,5
0,5
-1
0
1
-1 -0,75 -0,5 -0,25 0 0,25 0,5 0,75 1
Variables (axes F1 et F2 : 49,09 %)
F1 (32,19 %)
bs2014
bi2014
bi2013
lgc2014
lgc2013
lge2014
bs2013
lge2013
47
Figure 5: Représentation synthétique des
données de sensibilité tissulaire mesurées sur rameaux
suite à une inoculation bactérienne - ACP des variables
mesurées en 2013 et 2014 sur rameaux au sein de la core-collection
(moyennes par individus des 3 rameaux, 129 individus).
A : nuage des individus (moyennes sur 3
répétitions) sur les deux axes principaux. B :
représentation des variables mesurées en 2013 et en
2014.
Mlle HADJ BRAHIM Mouna RESULTATS ET DISCUSSION
48
Tableau 10: Matrice de corrélation de
Pearson des variables mesurées sur rameaux dans la core-
collection en 2013 et 2014.
|
Variables
|
lgc2013
|
lge2013
|
bs2013
|
bi2013
|
lgc2014
|
lge2014
|
bs2014
|
bi2014
|
|
lgc2013
|
1
|
|
|
|
|
|
|
|
|
lge2013
|
0,680
|
1
|
|
|
|
|
|
|
|
bs2013
|
0,364
|
0,335
|
1
|
|
|
|
|
|
|
bi2013
|
0,078
|
0,029
|
0,326
|
1
|
|
|
|
|
|
lgc2014
|
0,144
|
0,136
|
0,003
|
-0,082
|
1
|
|
|
|
|
lge2014
|
0,041
|
-0,011
|
0,063
|
0,021
|
0,541
|
1
|
|
|
|
bs2014
|
0,100
|
-0,071
|
0,011
|
0,067
|
0,020
|
0,145
|
1
|
|
|
bi2014
|
-0,047
|
-0,108
|
-0,070
|
0,060
|
0,307
|
0,312
|
0,351
|
1
|
*La couleur rose indique la forte corrélation entre les
variables et la couleur bleu indique les faibles corrélations entre
variables d'une année à l'autre.
La matrice de corrélation montre une relation entre les
variables proches (en rose) d'une même année (lgc et lge), (bs et
bi) ainsi qu'une faible corrélation (bleu) des variables entre les deux
années illustrant l'indépendance entre les années.
La synthèse des analyses représentée dans
le tableau ci-dessous traduit un effet inoculation significatif pour l'ensemble
des variables mesurées. L'effet génotype est significatif en 2013
mais pas en 2014 laissant supposer que cette année n'est pas une
année favorable au développement au chancre ce qui est
confirmé par l'analyse de ACP et les résultats de l'analyse de
variance avec un effet année significatif pour l'ensemble des variables
sauf pour le brunissement interne.
Nous avions collecté la variable diamètre afin
d'évaluer si l'importance des symptômes n'était pas
fonction de la vigueur des rameaux. Les analyses montrent que le
diamètre ne semble pas jouer un rôle dans le développement
de la maladie pour les variables mesurées. De manière
complémentaire le tableau de synthèse montre que l'interaction
GxE n'est significative que pour la longueur du chancre (lgc) entre 2013 et
2014.
49
Mlle HADJ BRAHIM Mouna RESULTATS ET DISCUSSION
Tableau 11: Synthèse des analyses
statistiques effectuées suite aux inoculations sur rameaux au sein de la
core-collection (129 individus).
|
Variables
|
2013
|
2014
|
2013 et 2014
|
|
lgc
|
lge
|
bs
|
bi
|
lgc
|
lge
|
bs
|
bi
|
lgc
|
lge
|
bs
|
bi
|
|
Effet de l'année
|
_
|
_
|
_
|
_
|
_
|
_
|
_
|
_
|
2,2 e-16
|
2,2 e-16
|
0,041
|
NS
|
|
Effet du génotype
|
2,995e-05
|
0,0021
|
1,586e-05
|
NS
|
NS
|
NS
|
NS
|
NS
|
3,8 e-06
|
1,641e-06
|
0,0027
|
0,054
|
|
Effet interactions GxE (Génotype x
Année)
|
_
|
_
|
_
|
_
|
_
|
_
|
_
|
_
|
4,5 e-06
|
NS
|
NS
|
NS
|
|
Effet diamètre du rameau
|
NS
|
NS
|
NS
|
0,0246
|
NS
|
NS
|
0,04
|
NS
|
_
|
_
|
_
|
_
|
|
Distribution normale (shapiro)
|
non
|
non
|
non
|
non
|
non
|
non
|
non
|
non
|
_
|
_
|
_
|
_
|
|
Homoscédasticité % an (Fligner-
Killeen)
|
_
|
_
|
_
|
_
|
_
|
_
|
_
|
_
|
5,15 e-06
|
0,372
|
0,1912
|
0,2634
|
|
Homoscédasticité %
génotype
(Fligner-Killeen)
|
0,937
|
0,994
|
1
|
1
|
0,999
|
1
|
1
|
1
|
_
|
_
|
_
|
_
|
|
R2 du modèle
|
0,543
|
0,503
|
0,558
|
0,387
|
0,428
|
0,447
|
0,454
|
0,44
|
0,605
|
0,2758
|
0,1566
|
0,0096
|
|
Comparaison % témoin (wilcoxon)
|
2,2 e-16
|
2,2 e-16
|
2,2 e-16
|
2,2 e-16
|
2,2 e-16
|
2,2 e-16
|
2,2 e-16
|
2,2 e-16
|
_
|
_
|
_
|
_
|
|
Moyenne des individus
|
4,57#177;2,17
|
2,33#177;0,97
|
11,62#177;8,77
|
27,18#177;11,14
|
2,70#177;0,6
|
1,39#177;0,72
|
8,93#177;8,52
|
25,81#177;10,25
|
_
|
_
|
_
|
_
|
Mlle HADJ BRAHIM Mouna RESULTATS ET DISCUSSION
50
|
|
