3.4.3 Codification et analyse des donnees
Les données GPS ont été saisies dans un
tableur EXCEL. Leur analyse avec le logiciel ARCVIEW (3.2 a) a permis de
déterminer la superficie du polygone ainsi obtenu.
Les données d'inventaire ont été
compilées et codifiées dans un tableur EXCEL. Leur analyse s'est
faite avec le logiciel SPSS pour la comparaison des moyennes par le test de
Fisher au seuil de signification de 5% des différents paramètres
mesurés. La séparation des moyennes s'est
faite par le calcul des LSD (plus petite différence
significative). Toutes les moyennes indexées par la même lettre
sur la même ligne sont considérées comme identiques au
seuil de signification de 5 %.
Des indices ont été calculés pour
décrire et comparer la diversité biologique (floristique) des AFC
des trois régions étudiées :
L'indice de Gleason (I) (Schlaepfer, 2002):
I = (S -1) / log N
Cet indice est fondé sur l'hypothèse de la
croissance logarithmique du nombre d'espèces observées en
fonction du log du nombre N d'individus examinés. Il représente
la pente de la droite obtenue en reportant en abscisse le log N et en
ordonnée le nombre S d'espèces recensées. Plus la pente
est élevée, c'est à dire, plus le nombre S
d'espèces est élevé pour un nombre donné
d'individus examinés, plus la diversité est grande.
L'indice de Shannon-Weaver (H'),
indépendant d'une hypothèse de distribution, est basé sur
les proportions d'espèces que l'on observe :
H'= Ó (Ni/N)*Log
(Ni/N)
Ni = nombre d'individus appartenant à l'espèce i, i
allant de 1 à S (nombre d'espèces) N = nombre d'individus dans
l'échantillon, Log = Logarithme de base 2.
Dans la nature la valeur de H' se situe en général
entre 0.5 (très faible diversité) et 4.5 (dans le cas
d'échantillons de grande taille de communautés complexes).
L'indice de régularité de Pielou (R)
d'un échantillon est le rapport de sa diversité H'
à la diversité maximale pouvant être obtenue avec le
même nombre de taxons (H'max = log S). Elle est donnée par la
formule :
R = H'/H'max = H'/log S (quantité
comprise entre 0 et 1) (Pielou, 1966, cité par Sonwa, 2004 ;
Schlaepfer, op.cit) avec S (nombre d'espèces différentes
de l'échantillon).
L'indice de Shannon-Weaver peut dont être
considéré comme le produit de la régularité par le
nombre d'espèces exprimé en logarithme (H' = R*log
S).
L'indice de Simpson (ë),
comme l'indice de Shannon-Weaver est indépendant d'une
hypothèse de distribution. Il est calculé par la formule : ë
= Ó (Ni(Ni-1)) / (N(N-1)).
Il correspond à la probabilité que deux
individus tirés au hasard appartiennent à la même
espèce. Lorsque la diversité est maximale, sa valeur est 0,
lorsque la diversité est minimale, sa valeur est 1, ce qui gêne
parfois son interprétation. C'est pourquoi, l'indice est souvent
défini de manière à ce que sa valeur soit égale
à 0 lorsque la diversité est minimale :
ë = 1 - Ó (Ni(Ni-1)) /
(N(N-1)).
L'indice de Sorensen (K) ou indice de la
similarité floristique (Betti, 1996) a été obtenu par la
formule :
K = 2a / (2a + b + c) où
a est le nombre d'espèces communes aux deux sites (1 et
2), b le nombre d'espèces propres à
l'échantillon 1 et c = nombre d'espèces propres
à l'échantillon 2
Cet indice donne une grande importance aux espèces
communes. La valeur de K multipliée par 100 correspond au pourcentage de
coïncidence floristique. Un test de Khi-deux à 5% a permis de
confirmer la similitude floristique entre les régions comparées
deux à deux selon la formules :
X2 = n (ad - bc)2 / (a + b) (c+d)
(a+c) (b+d) avec a = nombre d'espèces communes
aux deux sites, b = nombre d'espèces propres à
l'échantillon 1, c = nombre d'espèces propres
à l'échantillon 2, d = nombre d'espèces
absentes dans les deux échantillons et n = nombre
d'espèces total ( n = a+b+c+d). .
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