Analyse des disparités spatiales de la transmission du paludisme dans la vallée du Kou et sa gestion par un SIG

CHAPITRE VI : GESTION DE LA TRANSMISSION DU PALUDISME

ET LA PROTECTION ANTIPALUDIQUE PAR UN SIG

La géomatique est devenue un outil incontournable de nos jours. Ses capacités fondamentales d'acquisition, de stockage, de traitement, de production et de diffusion de l'information spatiale font d'elle un puissant outil de gestion et de prise de décision. Elle est utilisée dans plusieurs domaines dont celui de la santé. La géomatique de la santé est définie comme la science qui étudie la « Complexité des liens entre la santé et l'environnement humain et physique ». GOZE B. et al. (2000).

Le chapitre présent se propose de mettre en place un SIG qui intègre des données de populations, de paludisme et de protections antipaludiques. Le SIG sur la gestion de la transmission du paludisme en élaboration est extensible aux vecteurs du paludisme. Le chapitre s'inscrit dans une démarche de surveillance de la distribution spatiale du paludisme.

6.1 LE CADRE CONCEPTUEL DU SIG

La conception du SIG a nécessité plusieurs opérations parmi lesquelles la collecte des données sanitaires auprès des CSPS, l'enquête démographique dans les localités étudiées, les travaux de terrain avec le GPS et les travaux au laboratoire sur les PVA (prises de vue aériennes) et les données collectées. L'organisation de ces opérations dont la finalité est le SIG est présenté par la figure 22.

Figure 22 : Le diagramme conceptuel du SIG

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6.2 LA CONCEPTION DE LA BASE DE DONNEES

6.2.1. Les règles de gestion

Les règles de gestion donnent une description globale du fonctionnement de l'organisation. Elles assurent la cohérence, l'intégrité des données de la future base et traduisent les relations qui existent entre les entités du modèle.

La base de données élaborée au cours de cette étude sera logée à la DRO/IRSS. Les enquêtes de l'institut s'effectuent dans des localités pouvant être des villages ou des quartiers. Pour cette raison, ces deux unités spatiales, différentes sur le plan administratif, seront considérées à la même échelle dans la base de données. Elle est régie par les règles suivantes :

R1 : Une province appartient à une et une seule région ;

R2 : Une commune appartient à une et une seule province ;

R3 : Un village ou un quartier appartient à une et une seule commune ;

R4 : Un village ou quartier peut enregistrer 0 ou plusieurs cas de paludisme en une année selon les formations sanitaires ;

R5 : Un village ou un quartier peut faire l'objet de plusieurs enquêtes ;

R6 : Une concession appartient à un et un seul village ou quartier ;

R7 : Une concession peut être habitée par 0 ou plusieurs familles ;

R8 : La date de naissance du chef de famille appartient à une seule catégorie ;

R9 : Un chef de famille à une et une seule origine ;

R10 : Un chef de famille à une et une seule ethnie ;

R11 : Une famille est de la même ethnie que son chef ;

R12 : Une famille peut connaitre plusieurs causes de transmission du paludisme et inversement ;

R13 : Une famille peut connaitre plusieurs groupes vulnérables au paludisme et inversement ;

R14 : Une famille peut utiliser plusieurs protections antipaludique et inversement ;

R15 : Une famille se protège pour plusieurs raisons et inversement ;

R16 : Une famille peut utiliser plusieurs recours de soins et inversement.

6.2.2. Le modèle conceptuel de la base de données

Le modèle conceptuel de données (MCD) a pour but d'écrire de façon formelle les données qui seront utilisées par le système d'information. Il s'agit d'une représentation des données, facilement compréhensible, permettant de décrire le système d'information à l'aide d'entités (Figure 23, page 88).

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Figure 23 : MCD de la base de données sur les disparités spatiales de la transmission du
paludisme dans la vallée du Kou et sa gestion par un SIG.

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6.2.3. Le modèle physique de la base de données

Le Modèle physique de données (MPD) découle du MCD, il définit la configuration physique de la base de données et permet d'en connaître les détails. Il permet également d'implanter la base de données dans le SGBD-R. (Figure 24)

Figure 24 : MPD de la base de données sur les disparités spatiales de la transmission du
paludisme dans la vallée du Kou et sa gestion par un SIG.

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6.2.4. Le dictionnaire de données

Un dictionnaire des données est une collection de métadonnées ou de données de référence indispensables pour la conception, la gestion et l'exploitation d'une base de données relationnelle. Le dictionnaire de données de la base de données en élaboration comporte les champs «Code», «Description», «Type de données» et «Observations» (Annexe n° 3).

6.3 LA REALISATION DE LA BASE DE DONNEES

La base de données a été réalisée sous Microsoft Access® version 2010 de la suite bureautique Microsoft Office®. « Microsoft Access® est un système de gestion de base de données relationnelle (SGBD-R) utilisant des fichiers au format `mdb'. L'extention de la base de données Access est *.accdb depuis la version 2007. Ce choix se justifie à deux niveaux :

Au niveau de la création de la base de données :

« Microsoft Access® est compatible avec les requêtes SQL (sous certaines restrictions) et dispose d'une interface graphique pour saisir les requêtes (QBE - Query by Example - « Requête par l'exemple »). Il permet aussi de configurer, avec des assistants ou librement, des formulaires et sous-formulaires de saisie, des états imprimables (avec regroupements de

données selon divers critères et des totalisations, sous-totalisations,
conditionnelles ou non)»²⁰.

Au niveau de l'utilisation :

Le logiciel a une interface très semblable à celle de Microsoft Word® et Microsoft Excel® qui sont utilisées couramment par les équipes de la DRO/IRSS. Il est aussi compatible avec ces derniers. Ce qui simplifiera la prise en main de la base de données par les utilisateurs finaux et facilitera les différentes opérations d'importation et d'exportation de données. Un autre avantage important est que le logiciel fait partie du pack Microsoft Office® qui est souvent livré à l'achat des ordinateurs. Le coût financier devient pratiquement nul pour la DRO/IRSS.

6.3.1. La génération des tables

Les tables ont été générées sous Microsoft® Access® 2010 à partir du MPD. Voir la liste des tables en annexe N° 4.

²⁰ http://fr.wikipedia.org/wiki/Microsoft_Access le 29/08/2013

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6.3.2. Les requêtes, les formulaires et les états.

Basés sur le langage SQL (Strutured Query Language), les modules d'interrogations (les requêtes) sont des moyens permettant d'extraire automatiquement des données disponibles dans les tables suivant des critères bien définis. Des requêtes, essentiellement des requêtes de type sélection ont été élaborées pour faciliter la gestion de la base de données (Figure 25).

Figure 25 : Exemple de requête : les cas de paludisme diagnostiqués dans les CSPS en 2011

Les états sont des pages personnalisées permettant de présenter les données des tables relationnelles à l'écran ou à l'impression. Il peut également comporter des données calculées, triées et/ou regroupées. Un exemple d'états de la base de données élaborée est présenté par la figure 26 (Page 92).

Le formulaire est une interface personnalisée permettant de saisir, modifier, sélectionner et visualiser les enregistrements d'une base de données, de valider des options ou de lancer différentes actions. Les contenus des tables ou les résultats des requêtes peuvent être présentés sous forme d'états pour les utilisateurs (Figure 27, page 92).

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Figure 26 : Exemple de l'état d'impression des caractéristiques physiques des concessions

Figure 27 : Exemple du formulaire de gestion des concessions

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L'interface utilisateur de la base de données élaborée à partir de l'outil « Gestionnaire du menu général » de Microsoft Access® est présentée par la figure 28.

Figure 28 : Le menu général de la base de données

6.4 CONNEXIONS DE LA BASE DE DONNEES AVEC Arc GIS®.

La base de données a été connectée à Arc GIS® version 10 par l'intermédiaire de la chaine de connexion MICROSOFT.JET.OLEDB.4.0. La chaine de connexion OLE DB (Object Linking and Embedding, Database) est une chaine de connexion typique à Microsoft Access®.

La connexion a été établie d'abord sur ArcCatalog® 10. Ensuite les données ont été affichées sur ArcMap® 10. La figure 29 (page 94) présente l'interface de connexion à la base de données.

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Figure 29 : Interface de connexion à la base de données à partir d'ArcMap 10®.

6.5 UTILISATION DE LA BASE DE DONNEES PAR LES CHERCHEURS DE LA DRO/IRSS

La base de données réalisée restera à la disposition de l'équipe d'entomologie de la DRO/IRSS. Elle sera utilisée pour conserver les données issues des multiples études effectuées dans le cadre de la lutte contre le paludisme. Il faut noter qu'elle pourra éventuellement être agrandie pour permettre la sauvegarde des données sur les essaims de moustiques et celles d'autres activités de suivi effectuées dans certains villages (pulvérisation intra domiciliaire (PID) et prospections larvaires).

Une connexion avec Quantum GIS®²¹ (Figure 30, page 95) permettra aux chercheurs d'effectuer les différents travaux de gestion des données et de cartographie. Un avantage est

²¹ Logiciel libre de SIG

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que de nombreux étudiants et chercheurs de l'équipe d'entomologie ont été initiés à l'utilisation de Quantum GIS® qui est un logiciel libre de SIG. Néanmoins, certaines recommandations peuvent être formulées pour une utilisation optimale de cet outil.

Figure 30 : Connexion de la base de données avec Quantum GIS.

6.6 RECOMMANDATIONS

Pour que l'outil mis en place soit utile, certaines mesures s'imposent. Il s'agit de :

- former des étudiants et des chercheurs de la DRO/IRSS en gestion de la base de données sous Microsoft Access® et renforcer leurs capacités d'utilisation de Quantum GIS®. Par ailleurs, la multiplicité des données servant à alimenter la base impose la désignation de responsables (deux dont un étudiant et un chercheur) pour la gestion de la base de données afin d'éviter les désagréments pouvant provenir d'un défaut de manipulation ;

- veiller à la mise à jour régulière de la base de données. Autrement, l'outil ne sera pas utile. Cette responsabilité incombera aux responsables qui seront désignés.

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Certaines recommandations vont au-delà du cadre de cette étude. Elles s'adressent aux acteurs de la recherche en santé et ceux des aménagements hydro agricoles. A ce titre, nous préconisons que :

- les SIG soient intégré dans les programmes de recherche en santé depuis leur établissement pour permettre une meilleure gestion des données. En plus, l'utilisation

des SIG en géographie des maladies s'adapte mieux aux maladies vectorielles.

- des outils de veille sanitaires tels que celui issu de cette étude soient élaborés lors des programmes d'aménagement hydrauliques pour le suivi-évaluation spatio-temporelle de l'évolution des maladies hydriques suite à l'aménagement. Cela pourrait minimiser considérablement les effets néfastes de ces maladies dans les milieux comportant ce type d'aménagement de par les capacités de spatialisation et d'analyse des SIG.