II. La production des biofertilisants
II.1. Production des biofertilisants à base de
Rhizobium II.1.1. Isolement du nodule frais
La première étape est l'isolement des nodules
sur des racines fraîches des légumineuses sont cultivées
sous serre puis nettoyées avec de l'eau du robinet pour enlever toutes
les saletés et les particules organiques. Ensuite, les racines sont
coupées à 2-3 mm de chaque côté des nodules et afin
de ne pas les endommager, l'utilisation des pinces est conseillée
(Burton, 1985 ; Beck et al., 1993). Ainsi, les nodules intacts sont
immergés pendant 10 secondes dans de l'éthanol à 95% ou
dans l'isopropanol afin de briser la tension de surface et d'éliminer
les bulles d'air. Ce traitement est suivi par un trempage dans une solution
d'hypochlorite de sodium à 2.5 % pendant 4-5 minutes (Burton, 1985).
Ces nodules peuvent être aussi stérilisés
superficiellement par immersion dans de chlorure mercurique (HgC12) à 0,
l % pendant 3 mn ou dans une solution de peroxyde d'hydrogène (3%)
(Burton, 1985). Après stérilisation, i1s sont
écrasés dans une goutte d'eau stérile. Ainsi, la
suspension obtenue est étalée sur le milieu Yeast Extract Manitol
(YEM) composé à base de mannitol et d'extrait de levure contenu
dans des boites de Pétri (Yokoyama et al., 2006).
Enfin, l'ensemble est incubé à 25-28 ° C
pendant 3 à 10 jours en fonction de l'espèce jusqu'à ce
que des colonies apparaissent (Burton, 1985). L'isolat d'une seule colonie de
rhizobium est ensuite purifié et confirmé comme Rhizobium
en démontrant sa capacité à former des nodules sur
une légumineuse hôte d'essai dans des conditions
contrôlées (authentification des isolats) (Burton, 1985).
II.1.2. Production de bouillon de culture
Le but de cette étape réside dans l'obtention
d'une forte densité de rhizobiums dans le bouillon de culture. Cette
opération est favorisée par le faite que ces micro-organismes
sont connus par leur capacité à être cultivés
facilement dans un milieu liquide. En revanche, ce processus est
influencé par plusieurs facteurs qui sont : le milieu de culture, la
souche de rhizobium, la température et l'aération (Yokoyama et
al., 2006).
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Il est très important d'indiquer que la
stérilisation de l'ensemble de l'enceinte de croissance et du milieu
ainsi que d'assurer l'inoculation du fermenteur avec la culture de
Rhizobium dans un environnement stérile sont des
précautions à ne pas négliger (Yokoyama et al., 2006).
Étant donné que les rhizobiums sont des
bactéries aérobies, des longues expériences ont
montré que ces derniers ont besoin de 5-10 litre d'air pour 1 litre de
milieu de culture en une heure (Roughley ,1970). De plus, la température
optimale de croissance rhizobienne est de 28 à 30°C (Patil et
Alagawadi, 2010).
Le bouillon de culture doit contenir une source
d'énergie qui peut être des sucres, des alcools ou certains
acides. Ce milieu doit contenir aussi bien des facteurs de croissance que des
vitamines. Cependant, certaines espèces peuvent produire leurs propres
facteurs de croissance (Patil et Alagawadi, 2010).
Ainsi, la composition du bouillon en gramme par litre d'eau
distillée est la suivante :
Tableau1 : La composition du milieu de
culture YEM (Yokoyama et al., 2006)
Ingrédients
|
g l-1
|
K2HPO4
|
0.5
|
MgSO4.7H2O
|
0.1
|
NaCl
|
0.2
|
Mannitol
|
10.0
|
Extrait de levure
|
0.5
|
Toutefois, certains laboratoires utilisent le saccharose ou
l'infusion de maïs, au lieu d'ajouter le mannitol. L'ensemble du
mélange doit être maintenu à un pH de 6,4 (Hémissi
Zaghdoudi, 2013).
Enfin, la culture est incubée à 30 #177; 2
° C en culture submergée avec une agitation orbitale de 150 ppm
(partie par million). Cette incubation demeure jusqu'à ce que la
population de cellules soit maximale de 1010 à
1011 ufc (unité formant une colonie) / ml. La culture obtenue
est appelée culture démarreur (Yokoyama et al.,
2006).
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Il reste à noter que le temps de reproduction varie en
fonction des bactéries. Il est de 2 à 4 heures pour les
bactéries dites « à croissance rapide » qui produisent
généralement des colonies relativement grandes de 2 à 4 mm
de diamètre en 3 à 5 jours et de 6 à 8 heures pour celles
« à croissance lente » qui forment des colonies de 1mm de
diamètre en 7 à 10 jours (Hémissi Zaghdoudi, 2013).
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