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Recherche de nouvelles souches fongiques productrices d' antibiotiques à  partir du sol et des concrétions sédimentaires des grottes de AàŻn Fezza.

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par Wahiba Kholkhal
Université Abou Bekr Belkaid, Tlemcen Algérie - Magistère en biologie 2006
  

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2-2- Test d'antibiose :

2-2-1- Microorganisme cible :

Dans notre travail, on a utilisé comme microorganisme cible neuf souches bactériennes dont trois provient du laboratoire  « Antibiotiques, Antifongique : Physico-chimie, Synthèse et Activité biologique » (Tlemcen).

· Escherichia coli (1') (ATCC 25922)

· Pseudomonas aeruginosa (2) (ATCC 27853)

· Staphylococcus aureus (3) (ATCC 25923)

Cependant, que les autres souches provient du laboratoire « Produits Naturels » (Tlemcen).

* Les souches :

· Escherichia coli (1) 5044172. 

· Citrobacter freundï

· Enterobacter cloacea (5) 1305573.

· Klebsiella pneumoneae (6) 5215773. 

· Listeria monocytogenes (7) (ATCC 19111).

· Proteus mirabilis (8) 0536040.

· Salmonella typhi (9) 4404540.

2-2-2- Préparation de l'inoculum bactérien :

La préparation d'un lot de « Semences d'essai » des souches bactériennes a été réalisée sur Gélose nutritive en tubes inclinés et conservés à 4°C. Vingt quatre heures avant le test d'antibiose, on a effectué des précultures en Bouillon nutritif à partir des souches bactériennes conservées. Ces précultures ont été incubées à 37°C.

Lors des essais, ces précultures sert à la préparation des suspensions bactériennes dans l'eau physiologie et ajustées, ensuite, à l'aide d'un Spectrophotomètre de type (JEN WAY, 6405 UV/Vis), à 1×108 bactéries /ml par mesure de la transmission optique à 640 nm (DE BILLERBECK, 2000).

2-2-3- La réalisation du test :

Le test d'antibiose dépend des résultats d'isolement et d'identification des champignons, qu'ils nous ont posés de faire deux méthodes selon les souches isolées :

· METHODE 1 : Utilisée pour le premier groupe de champignons.

Ø Le criblage primaire : Elle était réalisée par la méthode de culture en milieu liquide inspiré de la méthode décrit par Khelil (1997) et Saadoun et al (1999) et, qui consiste à inoculer des souches fongiques pures dans un flacon de 250 ml contenant 50 ml du milieu Yeast Glucose Succhrose (YGS) et l'incuber, ensuite, à 25°C. Après 14 jours d'incubation le contenue de chaque flacon, a subi une filtration sur un papier filtre. Le surnagent était récupéré. Afin d'effectuer le test d'antibiose sur une de ces trois bactéries cible Escherichia coli (1), Pseudomonas aeruginosa (2) et Staphylococcus aureus (3), trois disques de papier ont été imprégnés du surnageant et posés en surface du milieu de culture « Gélose nutritif » coulé en boite de Pétri et ensemencé par la suspension bactérienne. Après 24 heure d'incubation la présence d'une zone clair autour des disques révèle la présence des substances antibactériennes dans le surnageant.

Ø Le criblage secondaire : Les souches révélant une activité antibactérienne importante dans le premier criblage, ont subi ce criblage afin de tester leur activité en changeant la méthode et en élargissant la gamme des bactéries-cible (neuf espèces bactériennes). Ce test inspiré de la méthode décrit par Saadoun et al (1999), consiste à ensemencer des souches fongiques sur le milieu PDAa coulé en boite de Pétri. Après 14 jours d'incubation à 25°C, trois disques d'agar ont été coupés et déposés sur le milieu Mueller Hinton ensemencé préalablement par la suspension bactérienne. Après 24 heures d'incubation à 37°C, la présence d'une zone clair autour des disques révèle la présence des substances antibactériennes dans le disque d'agar.

· METHODE 2 : Utilisé pour le deuxième groupe fongique. Cette méthode a été réalisée sous sa forme décrite ci-dessous, après qu'on a remarqué que la formation des hyphes aériens agrégés par ce groupe fongique a arrêtée la croissance de certains contaminants fongiques de la culture des souches de ce groupe.

La méthode consiste à inoculer les champignons dans un récipient contenant 100 ml du milieu YSA. Après 20 jours d'incubation à 25°C, les filaments aérien ont été récolté et homogénéisé dans 50 ml d'eau distillé stérile. Trois disques de papier filtre ont été imprégnés de cette suspension et déposé, ensuite, sur le milieu Mueller Hinton ensemencé préalablement par une suspension bactérienne (Pseudomonas aeruginosa (2) ). Après incubation à 37°C pendant 24 heures la lecture était effectuée comme la première méthode.

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"Les esprits médiocres condamnent d'ordinaire tout ce qui passe leur portée"   François de la Rochefoucauld