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Analyse de la diversité des champignons mycorhiziens à  arbuscules associés au maà¯s dans quatre zones de production en Côte d'Ivoire


par Kouadio Meliton Djezou
Université Felix Houphouet Boigny de Cocody  - Master  2021
  

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II.3.2- Isolement des spores de CMA

Cent grammes de chaque échantillon de sol sec ont été prélevés pour l'isolement des spores de champignons mycorhiziens qui a été réalisé suivant la méthode de tamisage humide décrite par Gerdemann et Nicholson (1963). La technique consiste à mettre en suspension 100g de sol dans 1 litre d'eau afin de séparer les propagules fongiques des particules du sol. La suspension de sol a été versée sur une série de tamis disposés l'un au-dessus de l'autre dans l'ordre décroissant des diamètres de mailles de 500, 200, 90 et 45um. À l'issu de cette étape, les débris végétaux, les cailloux et les fragements de racines sont retenus dans le tamis de 500 um. Les fractions retenues dans les tamis de 200, 90 et 45um de diamètre de mailles ont été par la suite transférées séparément dans des tubes de centrifugation. Pour chaque fraction, une solution de saccharose à 50 % a été ajoutée dans chaque tube. Le mélange a été centrifugé à 2000 rpm pendant 10 min. Le surnageant, qui contient les spores et les fines particules du sol a été récupéré. Ce surnageant a été reversé sur la colonne de tamis de 200, 90 et 45um de diamètre de mailles et le culot a été rejeté. Les spores contenues dans chaque tamis ont été rincées à l'eau de robinet pour éliminer le saccharose. Elle ont été ensuite récupérées dans une boîte de Pétri de 9,5 cm de diamètre dont le fond est tapissé de papier filtre quadrillé.

II.3.3- Détermination de l'abondance des spores dans chaque échantillon de sol

Les boîtes de Pétri contenant le filtrat de chaque tamis ont été placées sous une loupe binoculaire pour observer les spores. Dans chaque boite de Pétri, les spores ont été comptées par types en fonction de leurs couleurs et de leurs tailles. A l'aide d'une pipette Pasteur, les types de spores ont été séparés et déposés dans différentes boîtes de Pétri sur du papier filtre humidifié avec une solution physiologique constituée de NaCl à 9 %. Pour chaque zone d'échantillonnage, la densité des spores a été ensuite déterminée. Elle se définit comme étant le nombre de spores dans 100g de sol sec (spores/100g de sol). L'abondance relative (AR) a été également déterminée pour chaque type de spore (Johnson et al., 1991) par la formule suivante :

Nombre total d'un type de spore observé dans tous les sols

AR = x 100

Nombre total de spores observées dans tous les sols

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