2.3 Approche basée sur la carte de
connectivité (Connectivity Map)
Cette technologie consiste à établir un profil
d'expression à l'échelle du génome des transcrits de
gènes (Qu, 2012). Cette possibilité d'expression a
été appliquée avec succès dans la découverte
biomédicale pendant plus d'une décennie. Basé sur sa
validité scientifique par rapport aux résultats
expérimentaux de cette technologie, Connectivity Map fournit une
approche systématique basée sur la recherche des relations entre
les gènes, les produits chimiques et les conditions biologiques. Depuis
sa première introduction en 2006, cet approche a montré de
nouvelles promesses dans le domaine de développement de
médicaments, telles que l'identification et la suggestion de nouvelles
indications pour les médicaments existants et l'élucidation du
mode d'action pour de nouveaux produits chimiques en plus de prédire
potentiellement les effets secondaires.
2.4 Approche basée sur la médecine in
silico
La médecine in silico (également connue sous le
nom de "médecine computationnelle") est l'application de la recherche in
silico aux problèmes concernant la santé et la médecine
(ZHAVORONKOV, 2020). C'est l'utilisation directe de la simulation informatique
dans le diagnostic, le traitement ou la prévention d'une maladie. Plus
précisément, la médecine in silico se caractérise
par la modélisation, la simulation et la visualisation de processus
biologiques et médicaux dans les ordinateurs dans le but de simuler de
vrais processus biologiques dans un environnement virtuel (Mak, 2019).
3. Identification de médicaments antibiotiques de
"SARS-CoV-2" en l'absence d'une thérapeutique antivirale et d'un vaccin
spécifiques
3.1 Des médicaments antibiotiques
Les médicaments antibiotiques sont des
dérivés de substances isolées dans la nature. Certains
antibiotiques agissent sur la paroi ou la membrane des bactéries et
ainsi ils causent leur destruction. D'autres vont agir au niveau de la
machinerie des bactéries pour bloquer leur développement et ainsi
bloquer leur survie. Enfin, certains antibiotiques agissent directement au
niveau de leur ADN pour empêcher leur division et ainsi empêcher
leur réplication en plusieurs copies et leur prolifération.
3.1.1 Amoxicilline
L'amoxicilline est un antibiotique qui appartient au groupe
des aminopénicillines, de la famille des béta lactamines (Duval,
1973). Son mode d'action antibiotique aide à faire un blocage de la
synthèse des parois bactériennes. Certaines bactéries
sécrètent des enzymes, les béta-lactamases, qui inactivent
l'action de l'amoxicilline. Cette action peut être restaurée
par
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l'association de l'amoxicilline à un inhibiteur des
béta-lactamases, l'acide clavulanique, qui annule l'action de ces
enzymes. La structure moléculaire de l'Amoxicillin est
représentée comme suit (Figure 8).
Figure 8. Illustration de la structure
moléculaire de l'amoxicilline
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