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Evaluation de la dynamique spatio-temporelle de l'évolution de la covid a Libreville par une approche machine learning


par Bakari RAMADANE
Institut Africain d’Informatique - Diplôme d’Ingénieur Informaticien 0000
  

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4. DYNAMIQUE TEMPORELLE D'UNE EPIDEMIE

La propagation d'un agent infectieux au sein d'une population est un phénomène dynamique. Les effectifs d'individus sains et malades évoluent dans le temps, en fonction des contacts.Ceci au cours desquels l'agent infectieux passe d'un individu infecté à un individu sain non immuniser en l'infectant à son tour. Un tel phénomène peut être modélisé par des équations différentielles. Ainsi dans cette section, nous allons exposer d'un côté la modélisation de la dynamique temporelle par et les modèles à base des compartiments et de l'autre côté les effets de la vaccination sur la dynamique temporelle.

a) Dynamique temporelle d'une épidémie et les modèles à base des compartiments

Cette approche permet de compartimenter la population des individus hôtes selon leur état clinique et consiste à étudier les flux d'individus entre les différents compartiments. À savoir le compartiment des susceptibles infectés, ou même éventuellement des retirés... . Un des modèles à base des compartiments les plus simples est le modèle de Kermack et McKendrick dit S.I.R (Figure 2) qui divise la population hôte en susceptibles (S), infectieux (1) et retirés (R) :

· S désigne, au sein de la population concernée, les individus Susceptibles d'être infectés,

· I désigne ceux qui sont Infectés,

· R concerne ceux qui sont Rétablis ou immunise

Le modèle décrit la dynamique d'une épidémie comme suit :

· Les individus susceptibles deviennent infectés au taux ë communément appelé force d'infection ou taux de contagiosité et,

· les individus infectés guérissent ou meurent au taux ã.

· Les flèches entre les boites représentent les flux d'individus selon les taux indiqués au-dessus des flèches.

· L'effectif de chacune de ces populations dans un compartiment varie en fonction du temps

Figure 2 : la dynamique d'une épidémie selon le modèle SIR

Le système d'équation de la dynamique temporelle d'une épidémie, selon le modèle SIR est par les équations suivant :

·

·

Ces deux équations suffisent pour décrire la dynamique temporelle d'une épidémie lorsque l'on fait l'hypothèse que la taille totale de la population hôte N reste constante. La résolution analytique ou numérique de ce système d'équations différentielles nous permet de prédire l'évolution du nombre d'individus hôtes dans chacune des trois catégories S, let R (Figure 3)

 

Figure 3: Dynamique temporelle du modèle SIR, Source: (Avhad, 2020)

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"Je ne pense pas qu'un écrivain puisse avoir de profondes assises s'il n'a pas ressenti avec amertume les injustices de la société ou il vit"   Thomas Lanier dit Tennessie Williams