Chapitre I : synthèse bibliographique
blots", "Leafimprint blots", "Tissue blots", "Transmission
electronmicroscopy and immunolabeling" (Abouzid et al., 2002).
4.2. Tests moléculaires
Les techniques moléculaires de détection et
d'identification des virus sont basées sur la réaction de
polymérisation en chaîne (PCR). Des couples d'amorces
spécifiques ou universelles ont été
développés pour la détection respectivement de certaines
espèces de Begomovirus ou de certains groupes de
Begomovirus, notamment à partir d'informations sur la
séquence des régions conservées de l'ADN-A (Wyatt et
Brown, 1996; Atzmon et al., 1998; Brown et al., 2001). De nos
jours, les comparaisons de séquences nucléotidiques et la
phylogénie permettent de distinguer avec précision les
espèces virales (Padidam et al., 1995; Brown, 1997; Fauquet
et al., 2003). Ces comparaisons sont généralement
basées sur la séquence de la région intergénique
(IR) et celle du gène de la protéine de capside (CP) en l'absence
de séquence complète de l'ADN-A (Brown, 1997; Brown et
al., 2001). Mais pour une taxonomie définitive, la séquence
complète de l'ADN-A est nécessaire. Le seuil de distinction
taxonomique des Begomovirus actuellement admis par le comité
international de taxonomie virale (CITV) est de 89% pour l'ADN-A (Fauquet
et al., 2008 ; Brown et al., 2015).
5. Méthodes de lutte contre les
Begomovirus
Les maladies virales des plantes occasionnent de pertes
importantes à la fois sur le rendement et la qualité des produits
agricoles. De nos jours, peu de méthodes de lutte sont disponibles dans
le cas d'une infection virale et surtout, aucun traitement curatif ne peut
être appliqué. Les principales mesures de lutte contre les
Begomovirus visent surtout à réduire les sources de
l'inoculum viral et la population du vecteur. Ces moyens de lutte sont
essentiellement biologiques, chimiques, culturaux et physiques. La lutte peut
être également génétique et basée sur
l'utilisation de variétés résistantes ou tolérantes
au virus et/ou au vecteur (Brown et Bird, 1992; Brown, 1994; Thresh et
Otim-Nape, 1994; Pico et al., 1996; Polston et Anderson, 1997; Varma
et Malathi, 2003).
5.1. Pratiques culturales, prophylaxie
Ce sont des pratiques qui consistent à empêcher
ou réduire considérablement l'arrivée du virus sur les
parcelles de production. Ils consistent donc à empêcher les
introductions et les mouvements de plants infectés par le virus vers les
zones encore indemnes (saines). Ces pratiques constituent une priorité
dans la lutte contre les Begomovirus (Anderson
25
|