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Mise en place d'un suivi amphibien à  Vohibola, l'une des dernières forêts humides de la côte Est de Madagascar

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par Ewald JAUSSAUD
Université Joseph Fourier (Grenoble I )  - Master 2 pro biodiversité écologie environnement 2011
  

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6) Comparaison inter-sites des indices de diversité

Zones incendiées vs zones intactes

L'indice H' de Shannon des zones ayant subies l'incendie de 2002 est constamment nul, la moyenne des indices est donc égale à 0, tout comme l'écart-type de la distribution (ì1=0; ó1=0).

A l'inverse, la moyenne des indices de Shannon pour les zones intactes est différente de 0 (ì2=1.03; ó2=0.45) .

La comparaison au niveau des intervalles de confiance à 99%, semble montrer que cette différence de moyenne est significative. En effet, on obtient un intervalle de confiance à 99% = [0.5619551.489303], ce qui signifie que la valeur moyenne réelle des indices de Shannon des zones intactes à 99% de chances de se situer entre ces valeurs (0.561955< ì2 <1.489303).

Donc, au risque á = 1% de chances de se tromper, on peut conclure que les zones non impactées par l'incendie sont plus diversifiées que les zones ayant subies cet incendie de 2002.

La distribution des indices de Shannon pour les zones intactes, suivant une loi normale (W = 0.9039, p-value = 0.2417) Ce résultat est confirmé lors du test de comparaison d'une moyenne à une constante (t=6,82 > t9,0,05=2,262 ; p<0,01).

Zone de collecte vs zone non exploitée

Les sites 3 et 6 représentent initialement des milieux similaires (forêt littorale marécageuse de niaouli) mais diffèrent au niveau de leur exploitation.

On observe en moyenne 4 individus répartis en 3 espèces sur le site 6. On obtient alors H'site6=1.039721.

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Pour le site 3, on observe en moyenne 9 individus par transect pour 6 espèces, ce qui donne H'site3=1.700165.

Un test de Student modifié révèle (cf. Graphique 4) qu'au seuil de risque a = 10%, cette différence entre les indices de Shannon est significative (t=2,067 > t5,0,10=2,015), ce qui pourrait sous-entendre un impact de la collecte des feuilles de niaouli sur la diversité amphibienne, bien que la relation de causalité ne puissent être révélée par un test de comparaison de moyenne.

Graphique 4

Comparaison des indices de Shannon en fonction de l'exploitation du site

2

1,8

1,6

1,4

1,2

1

0,8

0,6

0,4

0,2

0

*

ZC ZNC

ZC = Zone collectée (site 6) et ZNC = Zone non collectée (site 3)

7) Similarité

A partir du calcul des indices de Jaccard pour l'ensemble des sites pris deux à deux, on obtient la matrice de distance suivante (Tableau 4).

Lors de l'observation de cette matrice, on remarque tout de suite que de nombreux sites sont soit fortement différents (indice de distance = 1) soit fortement similaires (indice de distance =0) entre eux. On constate notamment que tous les sites de forêts denses abritent exactement les mêmes espèces et que la seule et unique espèce retrouvée dans les savanes et zones dégradées est toujours la même.

On s'aperçoit également que le site 12, où aucune espèce n'a pu être recensée, est logiquement distant de tous les autres sites qui acceuillent tous au moins une espèce de grenouille.

Cette matrice des distances permet alors la construction d'un dendrogramme illustrant la répartition des groupes en fonction de leur degré de similarité (cf. Graphique 5 où T, comme transect, représente un site. Ex : T1 = site 1).

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Tableau 4

Matrice de distance

Ce graphique confirme tout d'abord le regroupement des sites de forêt denses d'un côté et des sites de savanes et zones dégradées de l'autre. On remarque que le site 8, qui est la forêt marécageuse de niaouli situé dans l'intérieur de la réserve, est englobé dans le groupe des sites mono-spécifiques. En effet, une seule espèce y a été retrouvée et il s'agit de la même qu'en zone dégradée et qu'en savane.

On remarque ensuite le regroupement des zones marécageuses (forêts de niaouli et marécages) qui partage un degré de similarité d'environ 40%.

Ces données permettent donc globalement de regrouper les sites en fonction de l'habitat qu'ils représentent. Il est alors possible de déterminer les habitats spécifiques de certaines espèces au sein de la réserve de Vohibola.

Graphique 5

Dendrogramme de similarité

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