I.4. Analyses des données
Pour analyser les données, nous avons pris en compte la
richesse taxonomique, l'abondance relative, la fréquence, la
diversité, l'indice d'équitabilité, l'AFC et la CAH. Nous
avons exploité également l'échelle de tolérance des
groupes taxonomiques (voir tableau 1). Pour tracer les différents
graphiques, nous avons utilisé le tableau Excel 2007 et le logiciel R
version 2.11.1 (2010-05-31).
Ø La richesse d'un peuplement ou d'un
écosystème est le nombre d'espèces ou de taxons (niveau
genre, famille etc.).
Ø L'abondance relative d'un groupe, ou
d'une espèce, est le nombre d'individus de ce groupe, ou de cette
espèce, par rapport au nombre total d'individus. La valeur est
donnée en pourcentage.
Abr = Na/N x
100
Na est le nombre d'individus du groupe ou de
l'espèce a et N est le nombre total
d'individus récoltés. Abr est l'abondance
relative.
Ø La fréquence est le rapport
exprimé en pourcentage, du nombre de relevés où un taxon
est présent sur le nombre total de relevés effectués.
F = Pa/P x
100
Pa est le nombre de
prélèvements où se trouve le taxon a et
P est le nombre total de prélèvements.
F est la fréquence.
Ø La diversité est
mesurée par l'indice de SHANNON, donné par la
formule suivante :
H' = - Ó ((Ni
/ N) * log2 (Ni / N))
Ni : nombre d'individus d'une espèce (ou taxon)
donnée, i allant de 1 à S (nombre total d'espèces ou de
taxons). N: nombre total d'individus.
Ø L'indice d'équitabilité
est le rapport de la diversité réelle sur la
diversité maximale, donnée par la formule suivante :
J = H' / H max
J = équitabilité
H' = indice de SHANNON réel
H max = indice de SHANNON maximal
Ø L'AFC est une analyse multivariée, qui
résume la structure de corrélation des données
décrites par plusieurs variables quantitatives.
Ø La CAH est une organisation hiérarchique des
données en groupes (ou clusters) de façon à ce que les
données similaires soient dans le même groupe.
Tableau 1 :
Echelle de tolérance des grands groupes taxonomiques (source :
www.wikipedia.fr, consulté le 2 octobre 2013)
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Echelle de tolerance
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Groupes taxonomiques
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SENSIBLE
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Plécoptères
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SENSIBLE
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Éphéméroptères
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SENSIBLE
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Trichoptères
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MOYEN
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Crustacés (amphipodes, isopodes)
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MOYEN
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Mollusques (gastéropodes, bivalves)
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MOYEN
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Odonates (anisoptères, zygoptères)
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MOYEN
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Coléoptères
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MOYEN
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Hémiptères
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MOYEN
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Lépidoptères
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MOYEN
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Mégaloptères
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MOYEN
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Diptères (sauf chironomides)
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TOLERANT
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Diptères (chironomides)
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TOLERANT
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Annélides (oligochètes, sangsues)
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II. RESULTATS
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