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Caracteristiques phenotypiques des staphylocoques methicillino-resistants isoles au centre universitaire de diagnostic au Graben


par Agnes KAVIRA KATSIOTO
Université catholique du Graben - Docteur en Médecine, chirurgie et gynéco-obstetrique 2019
  

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CHAPITRE III : RESULTATS

III.1. Prévalence des souches de S. aureus résistantes à la méthicilline

a) Ordinogramme de prévalences globales

Parmi les 373 cultures microbiennes faites, 280 cultures ont été positives (soit 75,1%). Les bactéries Gram positif ont été isolées en 70% et 30% était des bactéries Gram négatif. Parmi, les bactéries Gram positif, on a isolé 83,2% de Staphylocoque aureus. Le Staphylocoque méthicillino-résistant a été retrouvé dans 62,2% des cas. Ceci est montré dans la figure n°2.

373 Cultures

93 Cultures négatives

 

280 Cultures positives

 
 
 

196 Gram positif

84 Gram négatif

Streptocoque 20
Listéria 10
Bacillus 2

164 Staphylococcus
aureus

102 SARM

Figure 2 : Ordinogramme des cultures effectuées

22

b) Facteurs socio-démographiques en rapport avec le SARM

Le tableau I montre les caractéristiques socio-démographiques des patients chez qui le SARM a été isolé. Le SARM a été plus isolé chez les hommes (57,8%) que chez les femmes (48,2%). Les adultes de 25 à 40 ans sont les plus touchés par le SARM avec un cumul de 67,7% et les habitants de la ville sont représentés à 79,4%. Aucune liaison n'a été retrouvée entre le sexe, l'âge, la résidence et la présence de SARM.

Tableau I : Facteurs socio-démographiques de SARM

Variables

SARM

OR

IC 95%

P-value

Oui n (%)

non n (%)

Sexe

 
 
 
 
 

Masculin

59 (57,8)

32 (51,6)

1.29

0.68-2.43

0.54

Féminin

43 (42,2)

30 (48,4)

0.78

0.41-1.47

 

Classe d'âges (années)

 
 
 
 

= 8

3 (2,9)

3 (4,8)

0.59

0.12-3.01

0.84

9-16

5 (4,9)

2 (3,2)

1.54

0.29-8.22

0.90

17-24

1 (1,0)

4 (6,5)

0.14

0.015-1.3

0.13

25-32

31 (30,4)

16 (25,8)

1.25

0.62-2.54

0.65

26-40

38 (37,3)

22 (35,5)

1.08

0.56-2.08

0.95

41-48

10 (9,8)

8 (12,9)

0.73

0.27-1.97

0.72

49-56

11 (10,8)

7 (11,3)

0.95

0.35-2.6

1.00

= 57

3 (2,9)

0 (0,0)

-

-

0.44

Résidence

 
 
 
 
 

Hors ville

21 (20,6)

18 (29,0)

0.63

0.3-1.31

 

Ville

81 (79,4)

44 (71,0)

1.58

0.76-3.27

0.29

Total

102 (100)

62 (100)

 
 
 

23

c) Répartition des SARM par rapport au type d'échantillon et origine de

l'échantillon

Le tableau II montre les types et l'origine d'échantillon chez les patients chez qui SARM a été isolé. Les SARM étaient d'origine communautaire dans 67,6% des cas. Le SARM a été plus trouvé dans le frottis urétral, le frottis vaginal et les urines avec un cumul de 65,6%. L'origine de l'échantillon et le type d'échantillon ne sont pas statiquement liés à la survenue de SARM. Les infections ORL présentent significativement un risque 3,93 fois plus

élevée d'être associé aux SARM comparativement

(OR=3.93 ;IC 95% =1.1-14.2 ; P =0.046).

Tableau II : Type d'échantillon et origine de SARM

à d'autres

types d'échantillons

Caractéristiques

SARM

OR

IC 95%

P value

 

Oui (%)

Non (%)

Origine de l'échantillon

 
 
 
 
 

Communauté

69 (67,6)

45 (72,6)

0.79

0.39-1.58

 

Hôpital

33 (32,4)

17(27,4)

1.27

0.63-2.55

0.509

Type d'échantillon
secrétions cutanées

6 (5,8)

10 (16,1)

0.33

0.11-0.96

0.06

Sécrétion ORL

17 (16,7)

3 (4,8)

3.93

1.1-14.02

0.046

Sperme

4 (3,9)

4 (6,5)

0.59

0.14-2.45

0.72

Urine

23 (22,5)

14 (22,6)

1

0.47-2.13

1.00

Frottis urétral

27 (26,4)

10 (16,1)

1.87

0.83-4.19

0.18o

Frottis vaginal

17 (16,7)

14 (22,6)

0.69

0.31-1.52

0.20

Sang

5 (4,9)

6 (9,7)

0.4

0.12-1.38

0.37

Selles et LCR

3 (2,9)

1 (1,6)

1.85

0.9-18.19

0.98

Total

102 (100)

62 (100)

 
 
 

Légende : N : Nombre de fois qu'un antibiotique a été utilisé

24

III.2. Staphylococcus aureus résistant à la methiciline et antibiogramme

Le tableau III montre la sensibilité des 164 souches de S. aureus et des 102 souches de SARM aux antibiotiques les plus utilisés localement.

L'association amoxycilline-acide clavulanique( augmentin), la ciprofloxacine, la clindamycine, la doxycicline ont été plus actives sur les souches non SARM que sur les souches SARM (différence statistiquement significative). Généralement, le taux de résistance de SARM à la plupart d'antibiotiques testés a été élevé comparativement à celui de non SARM. Le SARM a été plus sensible à la vancomycine qu'à tous les autres antibiotiques, les non SARM étant plus sensibles à la neomycine et à l'oxacilline. Au-delà de la résistance à l'oxacilline, le SARM a été plus résistant à la meropenème, à la cotrimoxazole, à la clarythromycine et à l'azythromycine.

Tableau III : Sensibilité de S. aureus et de SARM aux antibiotiques

Antibiotiques

N

Non SARM

SARM

 

P-value

 

S (%)

R (%)

S (%)

R (%)

Amykacine

77

5 (6,5)

36 (46,7)

9 (11,7)

27

(35,1)

0,25

Augmentin

157

52 (33,1)

8 (5,1)

69 (43,9)

28

(17,8)

0,039

Azythromycin

66

3 (4,5)

11 (16,7)

2 (3,0)

50

(75,6)

0,1

Ceftriaxone

160

4 (2,5)

57 (35,6)

10 (6,3)

89

(55,6)

0,62

Ciprofloxacin

97

25 (25,8)

25 (25,8)

13 (13,4)

34

(35,1)

0,04

Clindamycine

157

37 (23,6)

21 (13,4)

38 (24,2)

61(38,8)

0,003

Gentamycine

64

15 (23,4)

10 (15,6)

21 (32,8)

18

(28,1)

0,82

Erythromycin

136

21 (15,4)

34 (25,0)

21 (15,4)

60

(44,1)

1,18

Levofloxacin

63

4 (6,3)

8 (12,7)

21 (33,3)

30

(47,6)

0,86

Neomycine

18

8 (44,4)

3 (16,7)

3 (16,7)

4

(22,2)

0,44

Meropèneme

28

0(0)

4 (14,3)

0 (0)

24

(85,7)

-

Oxacilline

162

62 (38,3)

0 (0)

0 (0)

100

(61,7)

0

Cloxacilline

2

0 (0)

0 (0)

0 (0)

2

(100)

0

Cotrimoxazol

62

0 (0)

12 (19,4)

0 (0)

50

(80,6)

-

Vancomycine

56

9 (16,1)

1 (1,8)

38 (67,8)

8

(14,3)

0,92

Spectinomycine

62

5 (8,1)

7 (11,3)

16 (25,8)

34

(54,8)

0,77

Chloramphénicol

55

5 (9,1)

10 (18,2)

17 (30,9)

23

(41,8)

0,75

Doxycycline

124

26 (20,9)

16 (12,9)

24 (19,3)

58

(46,7)

0,0008

Clarithromycine

58

1 (1,7)

11 (18,9)

1 (1,7)

45

(77,6)

0,88

25

III.3. La sensibilité des antibiotiques aux souches hospitalières et des souches
communautaires de S. aureus

Le tableau V montre la sensibilité des antibiotiques par rapport à l'origine de l'échantillon. La sensibilité d'aucun antibiotique n'est statiquement liée à l'origine de l'échantillon dans lequel le germe a été isolé. Les souches d'origine hospitalière ont été plus sensibles à la vancomycine et l'augmentin ; et ont présenté plus de résistance à la méropèneme, clarythromycine, azythromycine. Les souches d'origine communautaire ont été plus sensibles à la vancomycine et augmentin et ont présenté une résistance à la cotrimoxazole, azythromycine et clarithromycine.

Tableau IV : Antibiosensibilité des SARM par rapport à l'origine de l'échantillon

Antibiotiques

N

HOPITAL

COMMUNAUTE

P-value

 

S (%)

R (%)

S (%)

R (%)

amykacine

63

10 (15,8)

9 (14,3)

26 (41,2)

18 (28,7)

0,84

augmentin

97

23 (23,7)

9 (9,3)

46 (47,4)

19 (19,6)

1

azythromycin

52

1 (1,9)

17 (32,7)

1 (1,9)

33 (63,5)

1

ceftriaxone

99

4 (4,0)

28 (28,2)

6 (6,0)

61 (61,8)

0,85

ciprofloxacin

47

4 (8,5)

11 (23,4)

9 (19,1)

23 (49)

1

clindamycine

99

10 (10,1)

23 (23,2)

28 (28,3)

38 (38,4)

0,34

gentamycine

39

8 (20,5)

7 (17,9)

13 (33,3)

11 (28,2)

1

erythromycin

81

9 (11,1)

17 (21,0)

12 (14,8)

43 (53,1)

0,12

levofloxacin

51

7 (13,7)

10 (19,6)

14 (27,4)

20 (39,3)

1

neomycine

7

0 (0)

2 (28,6)

3(42,8)

28 (28,6)

0,55

meropèneme

24

0 (0)

9 (37,5)

0 (0)

15 (62,5)

-

oxacilline

99

0 (0)

33 (33,3)

0 (0)

66 (66,7)

-

cloxacilline

2

0 (0)

0 (0)

0 (0)

2 (100)

-

cotrimoxazol

50

0 (0)

17 (34,0)

0 (0)

33 (66)

-

vancomycine

46

16 (34,8)

1 (2,2)

22 (47,8)

7 (15,2)

0,24

spectinomycine

50

4 (8,0)

14 (28,0)

12 (24,0)

20 (40)

0,43

chloramphénicol

41

8 (19,5)

7 (17,1)

11 (26,4)

16 (39)

0,64

doxycycline

82

6 (7,3)

19 (23,1)

18 (21,9)

39 (47,5)

0,67

clarithromycine

46

1 (2,2)

16 (34,8)

0 (0)

29 (63,0)

0,78

26

III.4. L'antibioréistance des SARM par rapport au type d'échantillon

Concernant les résultats de l'antibiorésistance des SARM par rapport au type d'échantillon, il faut se référer dans le tableau trouvé en annexe n°III.

Quel que soit le type d'échantillons, les souches de SARM isolés ont présenté un taux de résistance maximale (100%) à l'oxacilline, la cloxacilline, le méropèneme et la cotrimoxazole. Le taux de résistance est respectivement de 97,8% ; 96,2% et 89,9% pour la clarythromycine, l'azythromycine et la ceftriaxone. Le taux le plus faible de résistance a été observé pour la vancomycine (14,3%) et augmentin (17,6%).

27

CHAPITRE IV : DISCUSSION

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"La première panacée d'une nation mal gouvernée est l'inflation monétaire, la seconde, c'est la guerre. Tous deux apportent une prospérité temporaire, tous deux apportent une ruine permanente. Mais tous deux sont le refuge des opportunistes politiques et économiques"   Hemingway