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La mécanique statistique des membranes biologiques confinées

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par Khalid EL HASNAOUI
Faculté des sciences Ben M'Sik Casablanca - Thèse de doctorat  2011
  

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Extinction Rebellion

Table des matières

Résumé.

12

1

Introduction générale.

14

2

Composition et fonction des membranes biologiques.

21

 

2.1

Représentation des biomembranes. . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

21

 

2.2

Membranes lipidiques. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

25

 
 

2.2.1 Organisation. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

25

 
 

2.2.2 Lipides membranaires. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

27

 
 

2.2.3 Protéines. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

30

 
 

2.2.4 Cholestérol. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

31

 
 

2.2.5 Mouvements à l'intérieur de la membrane. . . . . . . . . . . .

32

 
 

2.2.6 Perméabilité membranaire.. . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

33

 

2.3

Membranes artificielles.. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

36

 
 

2.3.1 Définition. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

36

 
 

2.3.2 Liposomes. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

36

 
 

2.3.3 Applications des liposomes. . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

38

 

2.4

Conclusions. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

40

Table de matière

3 Mécanique Statistique des biomembranes.

9

45

 

3.1

Introduction. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

45

 

3.2

Compositions et fonctions des biomembranes. . . . . . . . . . . . . .

48

 
 

3.2.1 Les vésicules. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

48

 
 

3.2.2 Les lipides. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

49

 
 

3.2.3 Les liposomes.. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

51

 

3.3

Propriétés statistiques des biomembranes. . . . . . . . . . . . . . . .

52

 
 

3.3.1 Description thermodynamique. . . . . . . . . . . . . . . . . .

52

 
 

3.3.2 Théorie de Canham-Helfrich.. . . . . . . . . . . . . . . . . . .

53

 
 

3.3.3 Spectre de fluctuations thermiques. . . . . . . . . . . . . . . .

56

 
 

3.3.4 Interaction d'Helfrich. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

58

 
 

3.3.5 Longueur de persistance. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

60

 

3.4

Conclusions. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

62

4

Effet de Casimir dans les biomembranes confinées.

66

 

4.1

Introduction. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

66

 

4.2

Formulation théorique. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

70

 

4.3

Force de Casimir statique. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

78

 

4.4

Force de Casimir dynamique. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

81

 

4.5

Conclusions. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

90

 

Dynamique Brownienne de colloïdes au contact d'une biomem-

 
 

brane confinée.

95

 

5.1

Introduction. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

96

 

5.2

Formulation théorique. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

100

Table de matière 10

5.3 Evolution temporelle de la densité de particules. . . . . . . . . . . . . 106

5.3.1 Equations de base. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 106
5.4 Conclusions. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 112

6 Mécanique Statistique des membranes confinées dans un liquide

trouble. 118

6.1 Introduction . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 119

6.2 Hamiltonien effectif. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121
6.3 Membranes presque-plates isolées. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 124

6.4 Vésicules isolées. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 135

6.5 Phases lamellaires. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 140

6.6 Conclusions. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 146

7 Conformation d'un polymère confiné dans des domaines délimités

par des biomembranes. 1 50

7.1 Introduction. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 151

7.2 D-manifolds non confinés . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 153

7.3 D-manifolds confinés en Géométrie I. . . . . . . . . . . . . . . . . . . 156

7.3.1 Relations utiles.. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 156

7.3.2 Extension parallèle à l'axe du cylindre. . . . . . . . . . . . . . 158

7.4 D-manifolds confinés en Géométrie II. . . . . . . . . . . . . . . . . . 160

7.4.1 Séparation moyenne. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 160

7.4.2 Extension parallèle du polymère. . . . . . . . . . . . . . . . . 161

7.5 Conclusions. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 163

Table de matière 11

8 Condensation des polymères greffés sur une biomembrane. 169

8.1 Introduction. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 170

8.2 Energie libre du mélange.. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 173

8.3 Diagramme de phase.. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 180

8.4 Conclusions. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 184

9 Conclusions générales. 190

10 Appendice A. 194

11 Appendice B. 196

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"Ceux qui rêvent de jour ont conscience de bien des choses qui échappent à ceux qui rêvent de nuit"   Edgar Allan Poe