RESUMEN
Entre los cultivos frutales, el albaricoque tiene un
desarrollo importante a nivel europeo y muy particularmente en Francia. El
factor limitante a dicho cultivo en la zona septentrional es la extrema
sensibilidad de la especie a la bacteriosis causada por Pseudomonas
syringae y la ausencia de tratamientos fitosanitarios para luchar contra
la enfermedad. La creación de nuevas variedades del albaricoque que
contengan los factores de resistencia a esta enfermedad representa entonces una
problemática prioritaria para asegurar la durabilidad del sector.
En este contexto, un panel de recursos genéticos y dos
poblaciones biparentales (Berba y GoMo) fueron movilizados para estudiar la
sensibilidad de los tejidos de ramas y hojas gracias a una serie de
inoculaciones controladas por una suspensión patógena de P.
syringae pv. syringae (cepa 41A) en condiciones climáticas
naturales. Los datos fenotípicos muestran (i) que existían
potencialmente fuentes de resistencia dentro del germoplasma albericoque y (ii)
que los compuestos de resistencia estaban bajo control poligenético y
que eran fuertemente influenciados por las condiciones climáticas.
La confrontación de los datos fenotípicos sobre
los datos de genotipado disponibles: una carta genética basada en
marcadores SSR (Single Sequence Repeat) para las poblaciones biparentales y
datos SNP (Single Nucleotide Polymorphism) provenientes de la
secuenciación de 76 accesiones dentro de la colección,
permitió (i) de identificar los QTL y (ii) de poner en evidencia las
asociaciones (264) entre SNP y caracteres de sensibilidad. Sin embargo, estos
datos preliminares requieren ser consolidados. No obstante permiten la
consideración a futuro de trabajos de selección asistida por
marcadores moleculares (SAM).
Palabras clave: albaricoque, bacteriosis, Pseudomonas
syringae, inoculación, vascularización, ramas, hojas, Single
Sequence Repeat, Single Nucleotide Polymorphism, análisis de enlace,
análisis de asociación, recursos geneticos, herencia.
Mlle HADJ BRAHIM Mouna SUMMARY
vi
SUMMARY
Among the fruit crops, apricot knows an important development
at the European level and in France in particular. However its cultivation is
limited in the French Rhône valley by the extreme sensitivity to
bacterial canker caused by Pseudomonas syringae and by the lack of
phytosanitary treatment to prevent the disease. The creation of new varieties
of apricot carrying resistance factors for this disease represents therefore, a
priority stake for the sustainability of the sector.
In this context, a panel of genetic resources and two parent
populations (Berba and GoMo) were mobilized to study tissue sensitivity of
branches and leaves after controlled inoculations with a pathogenic isolate of
P. syringae pv. syringae (strain 41A) in natural climatic conditions.
The phenotyping data showed (i) that there were potential sources of resistance
within the apricot germplasm and (ii) that the resistance components were under
polygenic control and strongly influenced by the climatic factors.
The association in between the phenotyping datasets and the
genotyping datasets (genetic map based on SSR markers (Single Sequence Repeat)
for the two-parent and SNP data (Single Nucleotide Polymorphism) issued from
the re-sequencing of 76 accessions), allowed (i) to identify QTL and (ii) to
highlight associations (264) between SNP and traits of sensitivity. These
preliminary data still need to be consolidated. Nevertheless, they open new
opportunities based on the integration of the related resistance components
through Assisted Selection Markers (SAM) approaches.
Keywords: apricot, bacterial canker, Pseudomonas
syringae, inoculation, vascularization, shoots, limbs, Single Sequence
Repeat, Single Nucleotide Polymorphism, linkage analysis, association analysis,
genetic resources, heredity.
Mlle HADJ BRAHIM Mouna LISTE DES TABLEAUX
vii
|